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![與ATP6相互作用的蛋白質(zhì)的篩選及基因的cDNA克隆.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-2/24/12/fe9d951e-cdbd-43a7-b29c-70b55dc61182/fe9d951e-cdbd-43a7-b29c-70b55dc611821.gif)
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1、植物細(xì)胞質(zhì)雄性不育是一種不能產(chǎn)生有活力花粉的遺傳性狀,在高等植物中,是一種常見的生物學(xué)特征。甘藍(lán)型油菜,是世界上廣泛種植的一種油料作物,其雜交種能比親本最高增產(chǎn)60%,因此把雄性不育應(yīng)用于雜交種的生產(chǎn)具有重大的意義。目前,人們對(duì)于甘藍(lán)型油菜雄性不育的研究主要集中于蘿卜胞質(zhì)不育,波里馬胞質(zhì)不育和nap胞質(zhì)不育。波里馬細(xì)胞質(zhì)雄性不育因其不育性穩(wěn)定,容易找到恢復(fù)基因,此不育系被認(rèn)為在雜交中的生產(chǎn)中是最有優(yōu)勢(shì)的。 研究表明,由于線粒體D
2、NA的重排,在編碼ATP合成酶第六亞基的基因(atp6)的上游產(chǎn)生一個(gè)嵌合的具有224個(gè)密碼子的開放閱讀框(orf 224),它與atp 6基因共轉(zhuǎn)錄,而這個(gè)atp6基因區(qū)域是與甘藍(lán)型油菜pol CMS性狀是相關(guān)的。 酵母雙雜交系統(tǒng)是近年來發(fā)展起來的一種有效的體內(nèi)研究蛋白質(zhì)之相互作用以及篩選cDNA文庫(kù)的技術(shù)手段。為了深入研究與ATP6發(fā)生相互作用的,可能與油菜雄性不育有關(guān)的基因,我們采用了酵母雙雜交系統(tǒng)進(jìn)行蛋白質(zhì)的篩選。
3、 將atp6基因和載體pGBKT7連接構(gòu)建重組誘餌質(zhì)粒pGBKT7/atp6。將雙鏈cDNA和質(zhì)粒pGADT7-Rec按照順序轉(zhuǎn)化的方法轉(zhuǎn)化含有誘餌質(zhì)粒pGBKT7/atp6的酵母AH109,通過營(yíng)養(yǎng)缺陷型的選擇和β-半乳糖苷酶(β-lacZ)活性檢測(cè)進(jìn)行篩選,初步獲得酵母陽性克隆。提取陽性酵母的總DNA,進(jìn)行PCR檢測(cè),并用限制性內(nèi)切酶進(jìn)行酶切,根據(jù)PCR結(jié)果和酶切結(jié)果,剔除相同的片段,選擇有代表性的酵母DNA轉(zhuǎn)化E. coli J
4、M109,涂布于LB+Amp培養(yǎng)基平板。并重新提取質(zhì)粒pGADT7-Rec-cDNA,轉(zhuǎn)化酵母AH109,驗(yàn)證是否與誘餌蛋白具有相互作用。最終獲得5個(gè)陽性克隆,測(cè)序后,在NCBI上Blast比對(duì)分析結(jié)果表明,分別是在油菜生理過程中起著重要作用的基因:內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)復(fù)合體a亞基(Scc61a),陽離子轉(zhuǎn)運(yùn)ATP酶復(fù)合體中的一個(gè)亞基,1,3-beta葡聚糖苷酶,水解酶以及光系統(tǒng)1L亞單位(PSAL)。 根據(jù)篩選所獲得的其中一個(gè)陽
5、性克隆水解酶基因的序列,設(shè)計(jì)引物,通過cDNA末端快速擴(kuò)增的方法擴(kuò)增基因的未知序列。根據(jù)RACE擴(kuò)增得到的序列,繼續(xù)設(shè)計(jì)引物,通過熱不對(duì)稱交錯(cuò)PCR的方法擴(kuò)增基因5’未知序列。根據(jù)三次的測(cè)序結(jié)果,拼接得到了基因的全長(zhǎng)序列,設(shè)計(jì)全長(zhǎng)引物:up-Primer:5’-TAGTTTAGGGATGCTGTCCAAAAGTGT-3’,down Primer:5’-CAGAAGAATAACCAATCAAAAAACCATC-3’進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到了基
6、因的全長(zhǎng)cDNA序列。 根據(jù)推導(dǎo)的氨基酸序列在NCBI上進(jìn)行Blast比對(duì)分析,此蛋白質(zhì)序列具有水解酶家族17的保守結(jié)構(gòu)域,與擬南芥的beta-1,3-glucanase具有84%的同源性,可能為水解酶家族的一個(gè)成員。利用網(wǎng)站和多種生物學(xué)軟件對(duì)推導(dǎo)出的氨基酸序列進(jìn)行分析。分析結(jié)果表明,此氨基酸序列有以下特征:(1)有信號(hào)肽序列,前26個(gè)氨基酸序列可能是信號(hào)肽;(2)有兩個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域。 設(shè)計(jì)引物up-Primer 5’AT
7、AGAATTC ATGCTGTCCAAAAGTGTTITFGC TG-3’,down Primer:5’-CAGAAGAATAAC CAATCAAAAAACCATC-3’,用Pfu酶進(jìn)行PCR擴(kuò)增后,用EcoR I進(jìn)行酶切,將此片段連接至經(jīng)過EcoR I和Sma I酶切過的PSK載體。重組質(zhì)粒通過Xba I和EcoR V進(jìn)行雙酶切,將片段克隆至經(jīng)過Xba Ⅰ和.Ecl136 Ⅱ酶切過的pCAMBIA 2301G載體,構(gòu)建反向植物表達(dá)載體
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