重復序列和基因組DNA在寬葉野生稻CCDD基因組中的比較分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、1.用栽培稻“廣陸矮4號”(AA)和藥用野生稻(CC)C0t-1 DNA作為探針,對寬葉野生稻(CCDD)進行比較原位雜交分析。同時,利用栽培稻基因組總DNA(gDNA)和藥用野生稻基因組總DNA(gDNA)作為探針,對寬葉野生稻進行基因組原位雜交,作為對照。比較A、C和D基因組之間關系,并對稻屬異源四倍體的可能起源機制進行了初步探討。在不封阻的情況下,廣陸矮四號Cot-1 DNA探針大概在26條染色體上信號較強,還可以看到同源染色體具

2、有相似的C0t-1 DNA帶型,并對其核型進行了同源性聚類。藥用野生稻C基因組Cot-1 DNA作探針,可以明顯地觀察到信號主要集中在24條染色體上,表明這24條染色體與藥用野生稻C基因組同源性較高,應屬于寬葉野生稻C組染色體。D染色體組上也存在一些雜交信號,說明CC和DD基因組之間的中度和高度重復序列亦具有同源性. 2.采用基因組原位雜交(GISH)技術來研究稻屬藥用野生稻復合體中寬葉野生稻(CCDD基因組)和高桿野生稻(CC

3、DD基因組)基因組的關系。用這兩種野生稻基因組總DNA作為探針分別對寬葉野生稻中期染色體進行原位雜交,雜交結果顯示寬葉野生稻和高桿野生稻同源性非常高,說明這兩種親緣關系十分接近,但區(qū)別也非常明顯,為寬葉野生稻和高桿野生稻是不同物種提供依據(jù),同時根據(jù)同源染色體上的相似信號帶型進行核型的同源性聚類。 3.重復序列的特點及組成對于研究基因組結構和進化具有重要意義,對重復序列的研究已經逐漸成為植物基因學研究的重要內容。制備植物C0t-1

4、 DNA的傳統(tǒng)方法中,高壓和超聲波打斷DNA的方法不能穩(wěn)定的獲得一定長度的DNA片段,而且有時也受許多因素影響。我們在Zwick等的方法基礎上加以改進,利用DnaseⅠ和DNA聚合酶Ⅰ酶解穩(wěn)定的獲取預定長度的DNA片斷,結合S1酶消化獲得C0t-1 DNA,并將提取的C0t-1 DNA與用高壓打斷所提取的C0t-1 DNA進行熒光原位雜交檢測,對比雜交結果,證明本實驗方法能夠獲得較高質量的C0t-1 DNA。 4.用多色基因組熒

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