利用中高度重復序列對異源多倍體野生稻基因組的比較分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文主要以三種異源多倍體野生稻,寬葉野生稻(O.Latifolia)、高桿野生稻(O.Alta)和大穎野生稻(O.Grandiglumis)為研究材料,利用稻屬基因組的兩種重復序列C0t-1 DNA和ITS序列進行細胞遺傳定位和序列分析,旨在揭示重復序列在異源多倍體中的分布特點,探討異源多倍體的親緣關系,為研究多倍化過程中可能發(fā)生的遺傳學事件提供依據(jù),主要結果如下:
   1.C0t-1 DNA對異源多倍體的比較分析利用來源于C

2、C基因組藥用野生稻(O.Officinalis)的中高度重復序列C0t-1 DNA作為探針,對寬葉野生稻(O.Latifolia)、高桿野生稻(O.Alta)和大穎野生稻(O.Grandiglumis)的基因組進行比較分析。初步鑒定在相同的實驗條件下,高桿野生稻和大穎野生稻基因組中C、D基因的親緣關系要近于寬葉野生稻種的C、D基因。在此基礎上,分別利用A、C基因組的C0t-1 DNA作為探針,通過調(diào)整洗脫度的方式,詳細研究了來自A、C基

3、因組的中高度重復序列在寬葉野生稻基因組的分布情況,結果證實了隨著洗脫度的調(diào)整,中高度重復序列的分布呈現(xiàn)特異性,這一結果在對大穎野生稻的研究中也被證實。因此,相對保守的中高度重復序列在異源多倍體中的特異性分布,可以為研究異源多倍體的進化關系提供依據(jù),進一步證實了C0t-1 DNA FISH是種間關系研究的有效手段。
   2.ITS 序列分析為進一步探討稻屬異源多倍體的種間的遺傳進化及親緣關系,本研究運用PCR技術擴增并測序了5個

4、野生稻種,即斑點野生稻(O.Punctata)、藥用野生稻(O.Officinalis)、寬葉野生稻(O.Latifolia)、高桿野生稻(O.Alta)和大穎野生稻(O.Grandiglumis)的完整的ITS區(qū)及5.8S區(qū)。以ITS序列為研究對象,構建了分子系統(tǒng)進化樹,并且與董正偉(2007年,未發(fā)表)的研究結果,綜合起來分析。對ITS序列的分析表明,ITS1和ITS2長度較為保守,異源多倍體物種的ITS中的G/C含量沒有二倍體高。

5、對完整ITS及5.8S區(qū)聚類分析發(fā)現(xiàn),寬葉野生稻和大穎野生稻應該聚為一類,兩者與高桿野生稻的關系稍遠,但是都起源于藥用野生稻。將ITS序列分析的結果與C0t-1 DNA FISH的比較分析結果結合起來,將形成對異源多倍體研究的整體觀,這樣的分析結果更加準確可靠。
   3.BAC-FISH的探索在C0t-1 DNA FISH的啟發(fā)下,利用BAC克隆 B-16作為探針,在不依賴C0t-1 DNA封阻的實驗條件下,對水稻第8染色體短

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