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文檔簡介
1、本研究利用簡單重復(fù)序列間擴增DNA(ISSR)技術(shù),對酸竹屬(Acidosasa)的粉酸竹(Acidosasachienouensis)、福建酸竹(Acidosasa longiligula)、黃甜竹(Acidosasa edulis(wen))、黎竹(Acidosasavenusta)和大節(jié)屬(Indosasa)的橄欖竹(Indosasa gigiantea)進行ISSR多態(tài)性分析,篩選了18個隨機引物,均可擴增出清晰、重復(fù)性好、多態(tài)
2、性明顯的條帶。在DPS v7.05版軟件中,統(tǒng)計18個引物的擴增產(chǎn)物來計算Nei&li遺傳距離,建立UPGMA(unweighted pair group methed with arithmeticmean)類平均法聚類分析圖。試驗得到如下結(jié)論:
(1)確立了一套實際可行、操作簡單的酸竹屬DNA提取方法:采用“Biospin”植物基因組DNA提取試劑盒,對提取方法進行優(yōu)化,提取樣品DNA,從而獲得高質(zhì)量的基因組DNA。<
3、br> (2)采用單因素實驗設(shè)計方法,對影響PCR反應(yīng)的各個成分和擴增程序進行了優(yōu)化,建立了酸竹屬植物ISSR分析的反應(yīng)體系:反應(yīng)終體積是20μL,含有10×Buffer2.0μL、2.5mMMg2+、0.2mMdNTPs、0.2μM引物、1.0UTαq酶、50ng模板DNA、加滅菌的ddH2O定容至20μL。
(3)從100條引物中,篩選出18條能夠擴增出產(chǎn)物穩(wěn)定、特異性強、擴增譜帶清晰的ISSR引物。利用篩選出的
4、這18個引物和已優(yōu)化的ISSR反應(yīng)程序和反應(yīng)體系,對來自福建農(nóng)林大學百竹園的酸竹屬4個竹種和大節(jié)屬的橄欖竹進行全面的ISSR分析,結(jié)果在全部供試資源中共擴增出117位點,其中多態(tài)性位點共計97個,占77.7%。
(4)利用18個ISSR引物產(chǎn)生的117條DNA片段計算了供試材料間的遺傳距離與遺傳相似系數(shù),5個供試樣品兩兩間的遺傳距離在0.0857-0.8222之間,平均值為0.6041,相似系數(shù)在0.3273-0.8941
5、之間,平均為0.5213。表明各種間有很大的差異,遺傳背景比較復(fù)雜。
(5)用18個隨機引物對5個供試樣品進行DNA隨機擴增,所得的ISSR擴增產(chǎn)物具有豐富的多態(tài)性,表明酸竹屬種間和種內(nèi)有非常復(fù)雜遺傳背景,通過ISSR技術(shù)可以準確、靈敏、高效地檢測出各個酸竹屬種間和種內(nèi)的遺傳多樣性。利用UPGMA構(gòu)建了5份樣品的聚類樹狀圖,以遺傳距離0.66為標準,將5份供試樣品可分為3大類群:第1類包括粉酸竹、福建酸竹、黃甜竹;第2類為
6、橄欖竹:第3類為黎竹。
(6)橄欖竹的分類歸屬問題在傳統(tǒng)分類上存在一定爭議,分歧之處在于《中國植物志》(第九卷第一分冊)將橄欖竹歸為大節(jié)竹屬,而《福建植物志》把它歸為酸竹屬。通過分子標記的遺傳距離分析得出,粉酸竹和福建酸竹之間遺傳距離最近,黃甜竹次之,橄欖竹其次、黎竹最遠,本研究結(jié)果支持將橄欖竹歸為酸竹屬。因此,依據(jù)現(xiàn)代的分類手段可以有效地解決傳統(tǒng)分類中有爭議的問題,是傳統(tǒng)分類中一種可靠的輔助手段,對區(qū)分一些歸屬不清或混淆
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