木聚糖酶基因的體外定向進化及其高拷貝重組酵母的構建.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、木聚糖是谷物類飼料中一種主要的抗營養(yǎng)因子,通常需要添加內切木聚糖酶(EC3.2.1.8)破壞木聚糖長鏈結構,釋放出短鏈木寡糖,在木糖苷酶(EC3.2.1.37)的協(xié)同作用下,木聚糖可最終被水解成木糖。近年來,內切木聚糖酶已被廣泛應用于飼料、食品和制漿造紙工業(yè)等,此外以木糖為底物生產燃料乙醇的研究也具有廣闊前景。然而,目前木聚糖酶仍存在酶的催化活性不高、酶學特性不能滿足工業(yè)加工或生產應用的需求或酶的生產成本較高等不足,亟需開發(fā)兼具高活性且

2、酶學特性優(yōu)良的理想木聚糖酶基因及其高效表達宿主。本研究克隆了糖苷水解酶家族11的4種內切木聚糖酶基因和1種木糖苷酶基因,以其中的優(yōu)良基因為基礎對其進行分子改良,構建了相應的高拷貝重組酵母表達宿主,在搖瓶中發(fā)酵表達內切木聚糖酶和木糖苷酶,并對底物形態(tài)和水解特性進行分析。主要結果如下:
   1內切木聚糖酶與木糖苷酶基因的克隆及原核表達
   本研究克隆了家族11黑曲霉(Aspergillus niger xylanase,

3、anx)、枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis xylanase,bsx)、褐色高溫單孢菌(Thermomonospora fuscaxylanse,tfx)和雜合內切木聚糖酶(hybrid xylanse,atx)基因以及枯草芽孢桿菌來源的木糖苷酶(B.subtilis xylosidase,xylo)基因,并在大腸桿菌中進行表達。酶學特性分析發(fā)現(xiàn),所有木聚糖酶均在酸性條件下較為穩(wěn)定。其中,ATx和Tfx兼具高酶活性和良好

4、的熱穩(wěn)定性,且Tfx具備良好的抗抑制劑特性和一個家族11木聚糖酶少有的碳水化合物結合域(carbohydrate binding module,CBM)。因此,atx和tfx可作為后續(xù)分子改良的基因材料。
   2 atx的分子改良及重組酵母菌的構建
   基于非理性設計思路,采用定向進化提高atx的催化活性。定向進化策略包括易錯PCR(error-prone PCR,EP-PCR)產生隨機突變,在微孔板上篩選木聚糖酶活

5、性提高的優(yōu)勢突變體。一輪EP-PCR后共篩選1530個轉化子得到一個酶活性提高的突變體基因FSI-A124。將atx和FSI-A124分別轉化畢赤酵母(Pichiapastoris) GS115,在PGAp啟動子和α交配因子信號肽的控制下分泌表達木聚糖酶,96 h發(fā)酵上清液中比活性分別為954和1556 U/mg。突變酶YFSI-A124的Km為4.25 mg/ml,較之野生酶YATx下降4.7%,催化轉化數(shù)kcat則提高44%。然而,

6、酶學特性分析顯示,YFSI-A124熱穩(wěn)定性略有下降。氨基酸比對和三維結構分析發(fā)現(xiàn),L49P替換使得酶的催化區(qū)域變得柔和,突變酶與底物木聚糖的親和能力增強,酶的催化效率提升,另一方面氫鍵作用、相鄰氨基酸之間的范德華力和表面疏水作用減弱,導致酶的熱穩(wěn)定性下降。
   3tfx的分子改良
   綜合非理性設計和理性設計的優(yōu)勢,采用定向進化和定點突變相結合的技術,提高tfx的催化活性和熱穩(wěn)定性。首先利用兩輪EP-PCR隨機突變

7、,經(jīng)微孔板篩選約7000個突變體,獲得6個木聚糖酶活性提高的優(yōu)勢突變體。并對其中4處可能與酶的催化活性或熱穩(wěn)定性相關的氨基酸殘基進行序列飽和突變。將優(yōu)勢突變體用于DNA shuffling和StEP進行優(yōu)勢重組,經(jīng)篩選3000個轉化子共獲得3個木聚糖酶活性提高的優(yōu)勢突變體。之后,將S144C點突變引入G3DS2,使分子內產生一個新的二硫鍵,獲得兼具高活性和良好熱穩(wěn)定性的突變基因G4SM1(S62T/S144C/N198D/A217V)。

8、G4SM1的特異性比活為2036±45.8 U/mg,是野生酶Tfx的2.12倍,而Km值為1.84 mg/ml,較之野生酶顯著下降(P<0.05),而kcat/Km提高76%,提示酶與底物的親和能力增強,且酶的催化效率提高。三維結構分析顯示,推測位于催化區(qū)的兩處氨基酸替換S62T和S144C有助于提高酶的催化活性和穩(wěn)定性。
   4構建包含高拷貝G4SM1基因的重組酵母菌
   采用兩種不同的方法構建包含高拷貝G4SM

9、1及其催化區(qū)G4SM1_CBM基因的重組酵母。一是采用高濃度抗生素壓力法篩選酵母轉化子,將電擊后的轉化子分別涂布于含500、1000、1500和2000μg/mlzeocin的YPD平板,在1500和2000μg/mlzeocin的平板上挑取陽性轉化子進行拷貝數(shù)鑒定,Southern blot和qPCR分析顯示,28號菌株為包含兩拷貝G4SM1的重組酵母菌,命名為33-1。研究發(fā)現(xiàn),Tfx中包含一段沒有催化活性的CBM2,為了減少高拷貝

10、外源基因對宿主的壓力,將Tfx中不影響其其催化活性的CBM2截去,采用一對同尾酶BamHⅠ和BgⅡ將表達盒頭尾相連,構建一個包含四拷貝表達盒的穿梭載體pGAPZαA/G4SM1_CBM(4),再將該載體轉化P.pastoris SMD1168獲得包含四拷貝G4SM1_CBM基因的重組酵母33-2,Southern blot和qPCR進一步驗證其正確性。
   5共表達內切木聚糖酶和木糖苷酶的重組酵母菌的構建及搖瓶發(fā)酵、底物形態(tài)和

11、水解特性分析
   利用BamHⅠ和BglⅡ將pGAPZαA/G4SM1_CBM(4)與包含木糖苷酶基因的pPI CZαA/xylo相連接,獲得共表達內切木聚糖酶和木糖苷酶的重組載體pαAX-GAPGC(4),轉化P.pastoris SMD1168獲得共表達宿主33-3。將菌株33-1和33-2在YPD培養(yǎng)基中分泌表達內切木聚糖酶,培養(yǎng)120 h后發(fā)酵上清液中總蛋白含量分別為0.49 g/l和0.65 g/1。菌株33-3能在

12、YPD培養(yǎng)基中僅表達內切木聚糖酶,同時也能在甲醇的誘導下共表達內切木聚糖酶和木糖苷酶,120 h發(fā)酵上清液中總蛋白含量達1.22 g/l。底物形態(tài)和水解特性分析顯示,未處理的樺木木聚糖結構致密、表面粗糙,多糖分子粘連程度高,經(jīng)內切木聚糖酶水解后,長鏈結構被破壞,分子呈現(xiàn)較小的顆粒狀態(tài),表面形態(tài)趨于平整。水解24 h后,木二糖和木三糖的濃度分別為0.954±0.093 mg/ml和0.360±0.022 mg/ml,分別占總水解產物的62

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