面向蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的特征提取方法研究.pdf_第1頁(yè)
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1、生物信息學(xué)不單單是一個(gè)最近興起的學(xué)科,并且在以后的研究工作的開(kāi)拓當(dāng)中也是一個(gè)極為重要的開(kāi)發(fā)對(duì)象。生物信息學(xué)是一門(mén)全面系統(tǒng)的學(xué)科,它結(jié)合了生物和與生物相關(guān)的系統(tǒng),在生物系統(tǒng)當(dāng)中,它是將信息匯入和信息實(shí)質(zhì)進(jìn)行歸納的。人們?cè)谡_選擇這個(gè)領(lǐng)域的研發(fā)方向之前,首先必須要進(jìn)行大量的數(shù)據(jù)資料分析,這些數(shù)據(jù)資料是與生物信息學(xué)相關(guān)的。
  當(dāng)前,生物信息學(xué)的發(fā)展是非常迅速的,而DNA序列和氨基酸序列的增長(zhǎng)也是非常的快,從而,生物學(xué)就增加了大量的數(shù)據(jù)

2、。這時(shí)候,那些之前直觀(guān)獲取蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的方法(如實(shí)驗(yàn)法)已經(jīng)跟不上數(shù)據(jù)的增長(zhǎng)速度了。也就在這時(shí),機(jī)器學(xué)習(xí)的方式進(jìn)入了人們的研究當(dāng)中,因?yàn)闄C(jī)器學(xué)習(xí)可以解決模式識(shí)別與分類(lèi)的問(wèn)題。本文以CB513和RS126作為數(shù)據(jù)集,使用支持向量機(jī)作為分類(lèi)方法,提取了氨基酸序列、疏水性、偶極矩、PSSM矩陣作為特征,其具體研究工作如下:
  首先使用氨基酸序列作為特征,滑動(dòng)窗口設(shè)置為13,得到的預(yù)測(cè)結(jié)果不是很高;第二,為了提高預(yù)測(cè)精度,本文在氨基酸序列

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