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文檔簡(jiǎn)介
1、生物分子(如三磷酸腺苷、DNA)的檢測(cè)在疾病診斷、基因治療、醫(yī)療預(yù)防以及環(huán)境監(jiān)測(cè)等方面具有重要意義。發(fā)展快速、方便、靈敏的生物傳感器備受關(guān)注。本論文研究工作,以DNA為核心,利用電化學(xué)和熒光等檢測(cè)手段,設(shè)計(jì)了分析檢測(cè)DNA和三磷酸腺苷(ATP)的生物傳感器。主要研究?jī)?nèi)容包括:
第一章,前言。介紹了DNA傳感器的基本知識(shí),重點(diǎn)闡述了基于DNA的生物傳感器在比色、電化學(xué)和熒光領(lǐng)域的研究進(jìn)展。以及基于核酸外切酶Ⅲ(Exonuclea
2、seⅢ(ExoⅢ))和T4 DNA連接酶信號(hào)放大的DNA生物傳感器的研究進(jìn)展,闡明了本論文的選題依據(jù)和研究?jī)?nèi)容。
第二章,介紹了具有特異性的免標(biāo)記電化學(xué)DNA傳感器用于目標(biāo)DNA的靈敏檢測(cè)。以亞甲基藍(lán)作為電活性物質(zhì),結(jié)合ExoⅢ酶放大作用,設(shè)計(jì)了雙鏈DNA為固定探針的檢測(cè)體系。雙鏈DNA探針由AP鏈和SP-15雜交而成,通過(guò)巰基與金電極的作用自組裝于金電極表面。SP-15由三部分組成:Ⅰ部分是和目標(biāo)DNA相匹配的系列;Ⅱ部分是
3、與AP探針相雜交的系列;Ⅲ部分是具有不同數(shù)目的游離鳥(niǎo)嘌呤系列,其能與亞甲基藍(lán)特異吸附得到較強(qiáng)電信號(hào)。與此相反,AP是沒(méi)有鳥(niǎo)嘌呤的DNA探針。該雙鏈DNA探針形成3'突出端,而不會(huì)被ExoⅢ酶剪切。在檢測(cè)之前,將雙鏈修飾的電極浸沒(méi)于攪拌的亞甲基藍(lán)溶液里,探針中含有大量游離的鳥(niǎo)嘌呤與亞甲基藍(lán)特異吸附而得到較強(qiáng)的初始DPV信號(hào);而目標(biāo)DNA與探針Ⅰ部分相結(jié)合后,使得Ⅰ部分變成平滑的3'端,引發(fā)ExoⅢ酶的酶切作用,釋放出來(lái)的目標(biāo)DNA又可以引
4、發(fā)下一輪剪切。結(jié)果大量探針的Ⅲ部分離開(kāi)電極,而探針AP沒(méi)有游離的鳥(niǎo)嘌呤,所以再次將電極浸沒(méi)于亞甲基藍(lán)溶液后,探針吸附亞甲基藍(lán)的量會(huì)大量減少,而得到較弱的DPV信號(hào)。信號(hào)前后的對(duì)比急劇減小,可以用于指示目標(biāo)DNA量的多少。
第三章,介紹了簡(jiǎn)單、快速、靈敏的免標(biāo)記熒光法檢測(cè)ATP。染料SYBR GreenⅠ在水溶液中熒光很弱,但是嵌入雙鍵DNA后熒光增強(qiáng)800-1000倍,而其與單鏈DNA或者核苷酸作用微弱,其熒光強(qiáng)度與水溶液中大
5、小相當(dāng),該染料常用于DNA生物傳感器領(lǐng)域。ExoⅢ酶可以剪切雙鏈DNA中內(nèi)嵌或平滑的3'端,對(duì)5'端和突出的3'端沒(méi)有剪切能力,對(duì)單鏈DNA的剪切活性很弱,其對(duì)底物DNA系列沒(méi)有要求。核酸外切酶Ⅰ(ExoⅠ)是另一種對(duì)底物DNA系列沒(méi)要求的剪切酶,其能對(duì)單鏈DNA從3'端到5'端按順序水解磷酸二脂鍵。再結(jié)合T4 DNA連接酶需以ATP作為輔酶的特點(diǎn),設(shè)計(jì)了環(huán)狀DNA探針。環(huán)形探針由兩個(gè)發(fā)夾結(jié)構(gòu)的DNA探針(P1和P2)按同濃度雜交而成。
6、因?yàn)橄蛏虾Iべ?gòu)買(mǎi)DNA時(shí),DNA的5'端為了控制合成方向,5'端要求除去磷酸基團(tuán),而T4 DNA連接酶是催化生成磷酸二脂鍵的,所以要求P1和P2的5'端另外修飾磷酸基團(tuán)。在檢測(cè)之前,T4 DNA連接酶不能發(fā)揮其作用,而使得環(huán)形探針的酶切位點(diǎn)暴露于ExoⅢ酶和ExoⅠ酶。兩種剪切酶將探針?biāo)獬蓡蝹€(gè)核苷酸,由于熒光染料SGⅠ與單個(gè)游離的核苷酸作用微弱,得到非常弱的背景噪音;而加入ATP之后,T4 DNA連接酶將其作為輔酶能量因子,發(fā)揮酶作
7、用,將環(huán)形探針催化形成閉合的DNA探針,其ExoⅠ和ExoⅢ的酶切位點(diǎn)均被屏蔽。染料SGⅠ大量的嵌入的雙鏈DNA中,得到增強(qiáng)的熒光作用。利用ExoⅠ和ExoⅢ酶切特點(diǎn),背景信號(hào)有效的被減弱,使得信噪比大大增強(qiáng),提高分析靈敏度。其熒光信號(hào)增加的程度與ATP濃度相關(guān),有利于定量分析。
第四章,介紹了signal-off的電化學(xué)DNA傳感器,設(shè)計(jì)了修飾生物素的分子發(fā)夾結(jié)構(gòu)的DNA探針,結(jié)合ExoⅢ酶的放大作用實(shí)現(xiàn)靈敏的DNA檢測(cè)。固
8、定于金電極的DNA探針,其突出的3'端核苷酸被生物素修飾,其與親和素與HRP的聚合物(SA-HRP)相作用,在雙氧水的催化下,大量催化TMB的氧化,再在電極上施加還原電位,因此可以得到較強(qiáng)的還原電流。而在目標(biāo)DNA存在條件下,其與DNA探針發(fā)生雜交,得到平滑的3'端,使得修飾了生物素的核苷酸被ExoⅢ酶剪切。因此,TMB的還原電信號(hào)急劇下降。該方法靈敏,并具有很好的選擇性,檢測(cè)限達(dá)到10fM.
第五章,研究開(kāi)發(fā)了快速、免熒光基
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