1、寄生蠕蟲能分泌出一系列蛋白質(zhì)到體表或者宿主體內(nèi)，這類蛋白質(zhì)被稱為分泌蛋白質(zhì)(ES proteins)，它們具有不同的生物功能，它們幫助蠕蟲入侵宿主組織，抵抗宿主免疫系統(tǒng)，是蠕蟲能成功完成寄生生活史的關鍵因素。對分泌蛋白質(zhì)的研究是研究蠕蟲寄生機制，并從中尋求疫苗及藥物用以防治蠕蟲危害的重要手段。如果可以建立一個可以篩選、預測寄生蛋白質(zhì)的模型，用來分析未知功能的蛋白質(zhì)是否具有寄生功能，可縮小研究范圍、大大減少工作量，使研究目標物更加明確。本

2、文通過對寄生蛋白質(zhì)序列特征的分析，建立了寄生蛋白質(zhì)分類模型，為今后建立寄生蛋白質(zhì)篩選模型提供基礎。 目前，有多個假說用以解釋寄生蠕蟲如何獲得適應寄生生活的能力的分子機制，但是沒有定論。越來越多的研究指出這類參與蠕蟲寄生過程的分泌蛋白質(zhì)是由已經(jīng)在自由生活物種中存在表達的蛋白質(zhì)獲得新的功能進化而來的。如果表達分泌蛋白質(zhì)的基因的迅速進化是蠕蟲適應寄生生活所必需的，那么是否具有分泌功能的蛋白質(zhì)都具有更快速進化的特征呢?針對這一問題我們以

3、馬來布魯絲蟲為模型進行了研究。我們利用BLASTP蛋白質(zhì)序列比對工具及SignalP蛋白質(zhì)N端分泌信號肽分析工具分析由馬來布魯絲蟲(Brugia malayi)基因組計劃得到的蛋白質(zhì)其 N端分泌信號的分布情況；初步探討了具有分泌功能的蛋白質(zhì)在非寄生序列中是否也處于更高進化地位的問題。我們一共分析了552條蛋白質(zhì)序列，其中18.8％(104/552)的序列具有 N端分泌信號肽或者分泌信號錨定位點。序列比對結(jié)果顯示雖然有部分具有 N端分泌信

4、號的蛋白質(zhì)序列沒有在其它物種中發(fā)現(xiàn)同源蛋白質(zhì)，但是也有同樣數(shù)量的具有N端分泌信號的蛋白質(zhì)序列是高度保守的。并且多數(shù)自由生活線蟲表達的與馬來布魯絲蟲表達的具有分泌功能的蛋白質(zhì)同樣具有 N端信號肽或信號錨定位點，我們認為具有分泌功能的蛋白質(zhì)并不一定具有更高的進化地位。 既然 N端分泌信號肽并不能在廣泛的意義上代表生物分子的進化特征。我們將研究的重點放到寄生蛋白質(zhì)全序列分析上。我們根據(jù)多序列比對的結(jié)果，選擇那些在寄生序列中高度保守并且

5、不同于不具有寄生功能的序列的特定氨基酸位點作為聚類分析的變量，并根據(jù)氨基酸極性特性用1～20的數(shù)值來代表20種基本氨基酸，采用不同的聚類分析算法，得到了準確率最高的分類模型：以所選擇的寄生蛋白質(zhì)特定保守氨基酸位點，并且給這些氨基酸定義數(shù)值為變量，并以皮爾遜相關系數(shù)為相似性測度，用組內(nèi)聯(lián)結(jié)法進行聚類計算的寄生蛋白質(zhì)分類模型。我們分析了28種寄生蛋白質(zhì)家族，利用我們對變量的定義，綜合運用各種聚類方法，24種蛋白質(zhì)家族能被成功聚類，將寄生蛋白