基因芯片技術(shù)在黃曲霉毒素生物合成相關(guān)基因檢測(cè)中的應(yīng)用研究.pdf_第1頁(yè)
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1、黃曲霉毒素(Aflatoxins,AFT)是最常見的一類真菌毒素,廣泛分布于土壤、動(dòng)植物特別是花生、玉米等人類傳統(tǒng)農(nóng)作物中。因其對(duì)人和動(dòng)物肝臟組織有嚴(yán)重的破壞作用,并可導(dǎo)致肝癌甚至死亡而被世界衛(wèi)生組織定為Ⅰ致癌物。 本文采用Plackett-Burman(PB)試驗(yàn)篩選出對(duì)毒素產(chǎn)量影響顯著的生長(zhǎng)因子,然后采用響應(yīng)曲面法研究了各關(guān)鍵因子對(duì)寄生曲霉AS3.4407和黃曲霉AS3.4408產(chǎn)毒的影響以及它們間的交互作用,得出菌株產(chǎn)毒量

2、最低和最高時(shí)所對(duì)應(yīng)的環(huán)境條件,為實(shí)踐中糧食作物等的AFT污染控制提供理論依據(jù)和針對(duì)性措施。此外,本實(shí)驗(yàn)結(jié)合RT-PCR方法成功建立了基因芯片制備技術(shù),搭建了可用于分析黃曲霉毒素生物合成相關(guān)基因的生物芯片技術(shù)平臺(tái),并篩選出與產(chǎn)毒相關(guān)的6個(gè)差異表達(dá)基因,初步分析了差異表達(dá)基因與黃曲霉毒素產(chǎn)生的相關(guān)性。為高通量篩選真菌中與產(chǎn)真菌毒素相關(guān)的基因提供技術(shù)支持。主要研究結(jié)果如下: 1.建立了改進(jìn)的HPLC聯(lián)合熒光檢測(cè)器檢測(cè)黃曲霉毒素的方法。

3、用三倍體積氯仿提取樣品中的黃曲霉毒素B1。用HPLC-熒光檢測(cè)器檢測(cè)。HPLC的色譜條件為:反相C18柱(250×4.6mm),流動(dòng)相為甲醇∶乙腈∶水(30∶20∶50,v/v/v),流速0.8mL/min。該法最低檢出限為2ng/mL,AFB1加標(biāo)量為6.25~1000ng/mL時(shí),發(fā)酵液中AFB1的平均回收率為86.4~96.8%,變異系數(shù)小于7.0。提取液無(wú)需過(guò)柱純化,可以直接進(jìn)行檢測(cè)。該方法不但可以將待檢毒素與其它雜質(zhì)有效分離,

4、而且可以同時(shí)檢測(cè)其它三種與AFB1結(jié)構(gòu)非常相似的AFB2、AFG1和AFG2。 2.通過(guò)PB試驗(yàn)確定轉(zhuǎn)速、溫度和初始pH三因子對(duì)寄生曲霉AS3.4407的毒素產(chǎn)量影響顯著(p<0.001),利用中心組合設(shè)計(jì)建立了寄生曲霉產(chǎn)毒預(yù)測(cè)模型Y=338.45-7.98X1-7.82X2+43.25X3-34.1X21-26.93X22-22.9X23+5.35X1X2-10.76X1X3-0.069X2X3。由回歸模型來(lái)分別預(yù)測(cè)菌株產(chǎn)毒量

5、最高和最低時(shí)的環(huán)境條件及相應(yīng)產(chǎn)量,結(jié)果顯示寄生曲霉AS3.4407產(chǎn)毒量在最適條件下可達(dá)350ng/mL以上(轉(zhuǎn)速174rpm、溫度27.7℃、pH6.0),而在不適條件下約為200ng/mL(轉(zhuǎn)速240rpm、溫度18.0℃、pH8.0),實(shí)驗(yàn)值與預(yù)測(cè)值之間的相關(guān)系數(shù)為0.99,證明應(yīng)用此模型能夠很好地預(yù)測(cè)不同生長(zhǎng)環(huán)境條件下的產(chǎn)毒情況。 3.通過(guò)PB試驗(yàn)確定時(shí)間、溫度和裝液量三因子對(duì)黃曲霉AS3.4408的毒素產(chǎn)量影響顯著(p

6、<0.001),利用Box-Behnken實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)建立了黃曲霉產(chǎn)毒預(yù)測(cè)模型Y=598-46.25x1+33.13x2-25.63x3-124.63x1x2-108.38x1x3-48.37x2x3-47.5x12-45x22+88.75x32。通過(guò)對(duì)響應(yīng)面的分析,得到較高毒素產(chǎn)量(>500ng/mL)的培養(yǎng)條件范圍分別為,溫度27~29℃,裝液量55~65mL/250mL,時(shí)間7~10天。通過(guò)解二次回歸方程,可知在27℃,64.5mL/

7、250mL和培養(yǎng)9天條件下可得到最高毒素產(chǎn)量606ng/mL。預(yù)測(cè)值和實(shí)測(cè)值有良好的相關(guān)性。 4.以Genebank中公布的基因序列信息為背景設(shè)計(jì)了27對(duì)引物,通過(guò)RT-PCR從高產(chǎn)毒寄生曲霉AS3.4407總RNA中擴(kuò)增獲得與黃曲霉毒素生物合成相關(guān)的25個(gè)基因片段和一個(gè)陽(yáng)性對(duì)照基因片段β-tublin,從大腸桿菌基因組中擴(kuò)增得到一個(gè)陰性對(duì)照基因片段LacZ,將它們作為芯片點(diǎn)陣的探針。為獲得一致的雜交溫度,設(shè)計(jì)合成的探針片段長(zhǎng)度

8、均為400bp。 5.建立了比較成熟的可用于分析黃曲霉毒素生物合成相關(guān)基因的芯片技術(shù)。研究表明芯片點(diǎn)陣后依次通過(guò)溫浴2h,650mJ/cm2紫外交聯(lián)30s,80℃烘烤2h,預(yù)雜交45min,清洗,干燥等步驟,最后與待測(cè)樣品在42℃雜交16h,可獲得低背景高質(zhì)量的芯片。初步建立了可用于分析黃曲霉毒素生物合成相關(guān)基因的芯片技術(shù)平臺(tái)。 6.采用誘導(dǎo)產(chǎn)毒培養(yǎng)的方法培養(yǎng)寄生曲霉AS3.4407,獲得產(chǎn)毒與不產(chǎn)毒兩種性狀的菌絲體。應(yīng)

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