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文檔簡介
1、蛋白質(zhì)翻譯后修飾是表觀遺傳學(xué)的重要內(nèi)容,賴氨酸可逆乙酰化修飾由于同組蛋白修飾、熱量限制、細(xì)胞凋亡、壽命延長和轉(zhuǎn)錄沉默等生理過程密切相關(guān)逐漸成為人們研究的熱點。近年來,有關(guān)真核生物的乙?;{(diào)控研究成果日新月異,而原核生物的乙?;{(diào)控研究由于手段的缺乏和基礎(chǔ)的薄弱幾乎是處于停滯不前的狀態(tài)。
本論文利用賴氨酸乙?;贵w的特異性,結(jié)合免疫沉淀和質(zhì)譜技術(shù)的高效分離特性,首次對原核生物Salmonellaenterica的乙?;孜锏鞍走M
2、行了蛋白組學(xué)水平的掃描,揭示乙?;揎椗c各種代謝關(guān)系密切;以可發(fā)酵碳源葡萄糖和不可發(fā)酵碳源檸檬酸為碳源,研究乙?;揎椗c不同代謝途徑之間的關(guān)系,并且從表型、生化和遺傳三個水平深入研究了乙?;揎棇.enterica中心代謝的調(diào)控機制,首次揭示賴氨酸可逆乙酰化修飾是中心代謝在整體水平上的一種調(diào)控方式;同時結(jié)合我們合作實驗室關(guān)于真核生物乙?;揎椀难芯拷Y(jié)果,提出賴氨酸可逆乙?;揎検且环N廣泛存在于真核和原核生物中的非常保守的中心代謝的調(diào)控
3、機制。
整個研究分為以下四個部分展開。
第一部分我們利用免疫沉淀的高靈敏性富集賴氨酸乙?;亩?并利用質(zhì)譜技術(shù)的高分辨率,首次對原核生物S.enterica的賴氨酸乙?;揎椀孜锏鞍自诘鞍捉M學(xué)水平上進行了掃描研究,得到一系列與能量代謝、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、氨基酸和核酸合成等密切相關(guān)的乙?;揎椀孜锏鞍?。本試驗結(jié)果發(fā)現(xiàn)有166個蛋白的190個肽段是乙?;?且其中的77個蛋白是與代謝相關(guān)的,這大大超出了我們對乙?;揎椀念A(yù)期,為
4、原核生物的乙?;芯块_辟了一個新的天地。
第二部分我們采用Red重組技術(shù)成功獲得了S.enterica的乙?;D(zhuǎn)移酶(Pat)和/或去乙酰化酶(CobB)缺失的突變株,并對它們在葡萄糖和檸檬酸為唯一碳源的基本培養(yǎng)基上的生長表型進行了研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)S.enterica及其衍生菌株在不同碳源基本培養(yǎng)基中展示出截然不同的生長表型,確認(rèn)了乙?;揎椗cS.enterica能量代謝之間的密切關(guān)系,并提出乙?;D(zhuǎn)移酶(Pat)和去乙?;?
5、Cobb)可能是目前唯一已知的能夠?qū).enterica中心代謝關(guān)鍵酶起可逆乙?;揎椪{(diào)控的乙?;揎椕?。
第三部分我們克隆并表達了乙?;D(zhuǎn)移酶(Pat)和去乙?;?CobB)以及中心代謝關(guān)鍵酶,如3-磷酸甘油醛脫氫酶(GapA)、異檸檬酸脫氫酶激酶,磷酸化酶(AceK)和異檸檬酸裂解酶(AceA),并在體外重構(gòu)Pat/CobB介導(dǎo)的乙?;?去乙酰化修飾體系,研究乙?;揎棇@些酶活性的調(diào)控方式;同時構(gòu)建GapA、AceK和
6、AeeA乙酰化修飾位點的點突變蛋白和敲除突變株,體外測定酶活力變化,研究這三個酶的具體乙?;揎椢稽c,并進行表型互補試驗。結(jié)果發(fā)現(xiàn)GapA的脫氫酶活力與乙?;揎椪嚓P(guān),而AceK的激酶活力和AceA裂解酶活力與乙?;揎椮?fù)相關(guān),且GapA的第108、115、321和331位賴氨酸,AceK的第72、83和553位賴氨酸,AceA的第13和308位賴氨酸與乙酰化修飾密切相關(guān)。
第四部分我們以核糖體RNA16SrRNA為內(nèi)參基因
7、,利用定量熒光實時PCR研究乙?;D(zhuǎn)移酶(Pat)和去乙酰化酶(CobB)的轉(zhuǎn)錄與不同代謝途徑乙?;揎椫g的關(guān)系,結(jié)果顯示:在葡萄糖為碳源的情況下,pat和cobB的轉(zhuǎn)錄水平要高于檸檬酸為碳源;不管是葡萄糖還是以檸檬酸為碳源,對數(shù)期pat和cobB的轉(zhuǎn)錄水平均要高于它們在穩(wěn)定期和遲滯期的轉(zhuǎn)錄水平;提出存在一個乙酰化潛能(patmRNA/cobBmRNA)的概念,即pat和cobb的轉(zhuǎn)錄水平?jīng)Q定了不同時期的乙?;揎椝?。通過qRT-P
8、CR試驗,在轉(zhuǎn)錄水平驗證了乙?;揎椗c不同碳源代謝之間的相互關(guān)系。
綜上所述,本論文綜合乙?;揎椩谏?、生化和遺傳三個方面的證據(jù),驗證了乙酰化修飾是一種廣泛存在于原核生物S.enterica中的調(diào)控方式;提出S.Enterica不同代謝通路轉(zhuǎn)換的分子機制是通過乙?;D(zhuǎn)移酶(Pat)和去乙酰化酶(CobB)的共同作用,對中心代謝關(guān)鍵酶類如GapA,AceA和AceK等進行可逆的乙?;揎?從整體水平上調(diào)控中心代謝;結(jié)合我們合作
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