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文檔簡介
1、基因表達調控的研究是分子生物學的一個核心課題。目前的研究主要集中在基因序列本身相關的啟動子和3’—UTR上,但基因序列本身并不足以完全解釋基因表達的調控。近年來有研究表明基因的表達與其在染色體上所處的位置有關,但是尚未有系統(tǒng)的研究。 要系統(tǒng)地開展位置效應的研究,需要在染色體不同位置上插入相同報告基因的一系列突變體。酵母基因敲除計劃(Guri G et al.,2002)所得到的酵母敲除菌株充分的滿足了本論文的研究需求。該計劃用一
2、個相同的報告基因KanMX4 module分別替換了酵母基因組近6000個基因。因此本論文選擇該計劃產生的50株釀酒酵母1號染色體基因敲除的雜合二倍體BY4743作為實驗材料,首次較大規(guī)模地開展了釀酒酵母1號染色體基因表達的位置效應的研究,初步探討了基因的表達與其在染色體上的位置之間的關系。 本文采用多重Taqman探針法real—time qPCR技術作為檢測基因表達的手段,建立了三重Taqman探針法real—time qP
3、CR檢測基因表達的實驗體系。經過預實驗充分檢測了影響三重real—time qPCR準確性的各種因素,結果表明該實驗體系非常好的滿足了準確定量的要求。 通過real—time qPCR實驗檢測報告基因表達量,對表達數(shù)據(jù)的分析結果如下: 1)利用絕對定量標準曲線分析原基因啟動子的表達。結果顯示,50個菌株里面只有3個菌株檢測到了原基因的表達產物。 2)分析KanMX4 module報告基因的表達。結果顯示,在50個
4、基因位置上,KanMX4 module的表達各不相同,但相對均一。 3)分析比較原始啟動子與KanMX4 module啟動子的強弱。結果表明,只有在原基因表達比KanMX4 module表達明顯高的位置上,原基因啟動子才參與KanMX4 module的表達。 4)基因表達位置效應的分析。結果顯示,KanMX4 module的表達大部分高于原基因的表達水平。將代表位置效應的KanMX4 module的表達與代表基因受各種調
5、控因素綜合影響的原基因的表達作相關性分析,結果為R2=0.0363。 5)基因的表達與基因之間的距離相關性弱(R2=0)。 綜上所述,我們的研究結果表明,由于KanMX4 module所帶的啟動子普遍強于原基因的啟動子,得到的表達結果比原基因要高,但比較均一;可以看到KanMX4 module在染色體的不同位置時存在位置效應,但是效應比較弱;位置效應的分析結果表明,在基因表達的調控因素里面,基因的表達與位置并沒有顯著的相
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