![](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/19/12/9d679d07-2adf-4d03-a7f1-d065be7adf31/9d679d07-2adf-4d03-a7f1-d065be7adf31pic.jpg)
![AphA和OpaR對(duì)副溶血弧菌密度感應(yīng)系統(tǒng)相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制研究.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/19/12/9d679d07-2adf-4d03-a7f1-d065be7adf31/9d679d07-2adf-4d03-a7f1-d065be7adf311.gif)
版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡(jiǎn)介
1、副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)是一種嗜鹽性革蘭氏陰性弧菌,廣泛存在于淺海海水、海底沉積物及魚、蝦、蛤、貝、蟹等海產(chǎn)品中。當(dāng)人們食用生的或未經(jīng)徹底煮熟的,且被攜帶關(guān)鍵毒力因子的副溶血弧菌污染的海產(chǎn)品時(shí),就有可能感染,引起以發(fā)熱、惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉等為主要癥狀的急性胃腸炎,嚴(yán)重者可發(fā)展成敗血癥,如若治療不及時(shí)可引起死亡。副溶血弧菌含有多種毒力因子,如直接耐熱溶血素(Thermostable direct h
2、emolysin,TDH)、耐熱相關(guān)溶血素(TDH-related hemolysin,TRH)、Ⅲ型分泌系統(tǒng)(TypeⅢ secretionsystem,T3SS)及莢膜多糖等,它們均與其致病性密切相關(guān),其中TDH是神奈川現(xiàn)象的直接原因。目前,副溶血弧菌已是引起食物中毒的首要病原菌。
密度感應(yīng)(quorum sensing,QS)是細(xì)菌中普遍存在一種級(jí)聯(lián)信號(hào)傳導(dǎo)機(jī)制,細(xì)菌通過合成、分泌并感應(yīng)信號(hào)分子(自誘導(dǎo)因子,autoin
3、ducer),最終通過激活或抑制其核心調(diào)控子的表達(dá)來控制細(xì)菌生物膜形成、毒力因子表達(dá)、耐藥性等細(xì)胞途徑,從而有利于細(xì)菌生存繁殖與致病。QS系統(tǒng)也普遍存在于弧菌中,其中以哈氏弧菌被研究的最為詳細(xì):當(dāng)處于低密度生長(zhǎng)(Low cell density, LCD)時(shí),細(xì)胞外低濃度的自誘導(dǎo)因子信號(hào)能使LuxO磷酸化,磷酸化后的LuxO能激活小RNA Qrr1-5的轉(zhuǎn)錄,Qrr1-5在Hfq伴侶蛋白的參與下激活A(yù)phA而抑制LuxR的表達(dá),AphA
4、進(jìn)而再調(diào)節(jié)下游毒力因子的表達(dá)和生物膜形成;當(dāng)細(xì)菌處于高密度生長(zhǎng)(High cell density, HCD)時(shí),細(xì)胞外高濃度的自誘導(dǎo)因子信號(hào)能使磷酸化的LuxO去磷酸化,導(dǎo)致Qrr1-5不表達(dá),使得Qrr1-5對(duì)AphA的激活及對(duì)LuxR的抑制作用被解除,此時(shí)LuxR大量表達(dá)后能調(diào)節(jié)下游基因的轉(zhuǎn)錄??梢?,AphA和LuxR分別是哈氏弧菌QS系統(tǒng)LCD和HCD下的核心調(diào)控子,QS系統(tǒng)正是通過控制其核心調(diào)控子的轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平而實(shí)現(xiàn)對(duì)生物膜形
5、成和毒力基因的表達(dá)調(diào)控。
哈氏弧菌QS系統(tǒng)的信號(hào)合成與傳導(dǎo)機(jī)制所需的所有基因,在副溶血弧菌中均能找到同源的基因,如副溶血弧菌在LCD時(shí)的核心調(diào)控子是AphA,而在HCD時(shí)的核心調(diào)控子是OpaR,二者與哈氏弧菌的AphA和LuxR均具有90%以上的同源性。但是,目前對(duì)副溶血弧菌QS系統(tǒng)的級(jí)聯(lián)信號(hào)傳導(dǎo)機(jī)制,及AphA和OpaR功能的認(rèn)識(shí)還很膚淺,亟需深入系統(tǒng)地研究。本文中,我們分別通過比較弧菌中OpaR和AphA及其直系同源蛋白已
6、知和可能的結(jié)合序列,并利用在線工具Regulatory Sequence Analysis Tools(RSAT,http://rsat.ulb.ac.be/rsat/)計(jì)算結(jié)合序列中每個(gè)位置上4種堿基出現(xiàn)的概率(Position frequency matrix,PFM),以構(gòu)建OpaR和AphA的識(shí)別基序,結(jié)果顯示OpaR和AphA的結(jié)合基序分別為TATTGATAAA-TTTATCAATA和ATATGCA-N6-TGCATAT,二者
7、均為一個(gè)反向互補(bǔ)重復(fù)序列。分別利用上述基序預(yù)測(cè)副溶血弧菌QS系統(tǒng)級(jí)聯(lián)信號(hào)傳導(dǎo)過程中哪些關(guān)鍵基因是受OpaR和AphA直接調(diào)控的,結(jié)果顯示:OpaR對(duì)自身基因、aphA和qrr2-4,AphA對(duì)自身基因、opaR和qrr4可能具有直接的調(diào)控作用。進(jìn)而,我們利用凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)(EMSA)、DNaseⅠ足跡實(shí)驗(yàn)、β-半乳糖苷酶報(bào)告基因融合實(shí)驗(yàn)(LacZ)、引物延伸及qRT-PCR等實(shí)驗(yàn)技術(shù)分別研究OpaR和AphA對(duì)上述靶基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制,結(jié)
8、果表明:當(dāng)用HI-0.5%S平板培養(yǎng)副溶血弧菌至高密度時(shí),OpaR能直接抑制qrr2-4、aphA和opaR的轉(zhuǎn)錄表達(dá),其結(jié)合位點(diǎn)均包含一段與基序相似的序列;當(dāng)用M肉湯培養(yǎng)副溶血弧菌至低密度(OD600=0.15-0.2)時(shí),AphA能直接抑制qrr4、aphA和opaR的轉(zhuǎn)錄,其結(jié)合位點(diǎn)也均包含一段與基序相似的序列;另外,AphA對(duì)qrr2-3的轉(zhuǎn)錄具有間接抑制作用。由于OpaR和AphA對(duì)上述基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制與哈氏弧菌中的完全一致
9、,因此上述結(jié)果不僅表明我們所構(gòu)建基序的可靠性與實(shí)用性,也說明了副溶血弧菌QS系統(tǒng)級(jí)聯(lián)信號(hào)傳導(dǎo)機(jī)制與哈氏弧菌的基本一致,這為后續(xù)實(shí)驗(yàn)打下了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
副溶血弧菌在自然生存與感染致病的過程中,必然面臨眾多環(huán)境信號(hào)的刺激,比如溫度、pH、滲透壓等,在此過程中其毒力因子的表達(dá)必然是被復(fù)雜的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)緊密調(diào)控的,而解析這個(gè)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)有助于理解副溶血弧菌的致病機(jī)制。ToxR是副溶血弧菌的毒力調(diào)控因子,已有研究表明它能調(diào)控溶血素基因tdh
10、、T3SS1相關(guān)基因及外膜蛋白基因ompU的表達(dá),但是其調(diào)控的分子機(jī)制仍然未被闡明。VPA0606是AraC家族的轉(zhuǎn)錄調(diào)控子,目前只知道該蛋白能影響副溶血弧菌生物膜形成,但對(duì)其分子作用機(jī)制一無所知。另外,VPA0606可能還參與調(diào)控副溶血弧菌毒力因子的表達(dá)。在副溶血弧菌基因組中,vpa0607與vpa0606轉(zhuǎn)錄方向相同,且二者基因間區(qū)僅有71 bp,RT-PCR結(jié)果表明二者共轉(zhuǎn)錄,vpa0607為首基因。引物延伸結(jié)果顯示toxR和vp
11、a0607表達(dá)也呈現(xiàn)出密度感應(yīng)的特性,這提示OpaR和AphA可能對(duì)toxR和vpa0607的轉(zhuǎn)錄具有調(diào)控作用。因此,我們采用HI-0.5%S肉湯培養(yǎng)副溶血弧菌研究了OpaR和AphA對(duì)toxR和vpa0607的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制。
我們首先采用引物延伸和Western blot研究了菌密度對(duì)opaR、vpa0606、aphA和toxR的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,結(jié)果表明:opaR和vpa0606在OD600=0.6-0.8時(shí)表達(dá)水平高,aphA在
12、OD600=0.05-0.2時(shí)轉(zhuǎn)錄水平高,toxR在OD600=0.2-0.4時(shí)轉(zhuǎn)錄水平高。進(jìn)而,我們采用引物延伸、LacZ等實(shí)驗(yàn)技術(shù)研究了OpaR和AphA對(duì)自身基因及對(duì)toxR和vpa0607的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制,結(jié)果表明:在OD600=0.05-0.2時(shí),AphA直接抑制aphA和opaR,而間接抑制toxR的轉(zhuǎn)錄,但是AphA對(duì)vpa0607-0606具有間接的激活作用;在OD600=0.6-0.8時(shí),OpaR能直接抑制aphA、op
13、aR和vpa0607-0606,而間接抑制toxR的轉(zhuǎn)錄。由于OD600=0.05-0.2時(shí)AphA激活vpa0607-0606的轉(zhuǎn)錄,這提示vpa0607-0606可能在低密度下轉(zhuǎn)錄水平高,引物延伸結(jié)果顯示該操縱子的轉(zhuǎn)錄特性確實(shí)與aphA的一致。然而,vpa0606與vpa0607共轉(zhuǎn)錄,VPA0606又在OD600=0.6-0.8時(shí)蛋白表達(dá)水平高,這似乎相互矛盾。實(shí)際上,VPA0607蛋白是一種DNaseⅡ,能從mRNA的3'-端向
14、5'-端水解磷酸二酯鍵,從而使RNA降解。我們推測(cè):只有當(dāng)細(xì)胞內(nèi)VPA0607蛋白水平低時(shí),處于基礎(chǔ)表達(dá)的vpa0607-0606才能得以翻譯成VPA0606蛋白。這種假設(shè)需要我們后續(xù)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。
總之,我們的實(shí)驗(yàn)結(jié)果不僅證明了副溶血弧菌QS系統(tǒng)和哈氏弧菌具有相似的級(jí)聯(lián)信號(hào)傳導(dǎo)機(jī)制,而且顯示出ToxR和VPA0606也參與到QS系統(tǒng)的調(diào)控機(jī)制中來。AphA、OpaR、ToxR和VPA0606隨菌密度的變化而表現(xiàn)出不同的表達(dá)豐
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 副溶血性弧菌QS系統(tǒng)核心調(diào)控子OpaR和AphA對(duì)mfp和cpsQ的調(diào)控研究.pdf
- 副溶血弧菌轉(zhuǎn)錄因子AphA調(diào)控生物膜基因的初步研究.pdf
- 副溶血弧菌OpaR調(diào)控子調(diào)控生物膜的研究.pdf
- 副溶血弧菌群體感應(yīng)與調(diào)控的初步研究.pdf
- 副溶血性弧菌中密度感應(yīng)系統(tǒng)依賴的T3SS1和T6SS2調(diào)控機(jī)制研究.pdf
- 副溶血弧菌tdh2基因敲除、表達(dá)及調(diào)控機(jī)制研究.pdf
- 副溶血弧菌的基因分型研究.pdf
- 副溶血弧菌毒力基因的表達(dá)變化研究.pdf
- 副溶血弧菌調(diào)控蛋白CalR功能的初步研究.pdf
- 副溶血弧菌調(diào)控蛋白calr功能的初步研究
- 副溶血弧菌Ⅵ型分泌系統(tǒng)功能及其調(diào)控.pdf
- 副溶血性弧菌溶血毒素基因的克隆與表達(dá)研究.pdf
- 副溶血弧菌tdh、trh和tlh基因的克隆、表達(dá)及其基因敲除對(duì)其溶血活性的影響.pdf
- 黃芩醇提物對(duì)副溶血性弧菌和哈維氏弧菌抑菌機(jī)制的研究.pdf
- 副溶血性弧菌的體外比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究.pdf
- 臭氧對(duì)副溶血性弧菌滅活機(jī)制的探索研究.pdf
- 副溶血性弧菌
- 基于群體感應(yīng)分析腐敗希瓦氏菌對(duì)副溶血弧菌毒力因子的影響機(jī)制.pdf
- 副溶血弧菌耐熱直接溶血素基因的克隆表達(dá)與鑒定.pdf
- 副溶血弧菌的分子檢測(cè)與基因分型研究.pdf
評(píng)論
0/150
提交評(píng)論