miRNA-200c在乳腺癌中的表達(dá)及其調(diào)控基因網(wǎng)絡(luò)的篩選.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:分析miR-200c在乳腺細(xì)胞株及乳腺病變組織中的表達(dá);篩選miR-200c調(diào)控的基因網(wǎng)絡(luò)與信號(hào)通路。
  方法:實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR方法檢測(cè)12個(gè)乳腺細(xì)胞株中miR-200c的表達(dá);原位雜交方法分析miR-200c在不同乳腺疾病中的表達(dá);mRNA表達(dá)譜生物芯片與生物信息學(xué)軟件對(duì)miR-200cmimic轉(zhuǎn)染的4個(gè)乳腺癌細(xì)胞株mRNA表達(dá)芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,篩選差異表達(dá)基因及其相關(guān)信號(hào)通路;免疫組化驗(yàn)證miR-200c預(yù)測(cè)

2、靶點(diǎn)EDNRA在乳腺疾病組織芯片中的表達(dá)。
  結(jié)果:⑴實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR結(jié)果顯示,4個(gè)高度惡性乳腺癌細(xì)胞株(BT549、HS578T、MDA-MB-231、SUM159PT)中miR-200c的表達(dá)較6個(gè)低度惡性細(xì)胞株(BT474、MCF7、MDA-MB-468、SKBR3、T-47D、ZR-75-1)和永生化正常乳腺上皮細(xì)胞株(MCF10A、MCF12A)中為低(p<0.01)。⑵乳腺疾病組織芯片原位雜交結(jié)果顯示,36例

3、正常與良性乳腺病變中,27例表達(dá)陽(yáng)性;36例乳腺癌中,18例表達(dá)陽(yáng)性。miR-200c的表達(dá)在正常、良性乳腺病變組織中的表達(dá)明顯高于乳腺癌(p=0.028)。⑶mRNA表達(dá)譜芯片分析結(jié)果顯示,與mimic control轉(zhuǎn)染組比較,miR-200cmimic轉(zhuǎn)染的BT549、HS578T、MDA-MB-231和SUM159PT細(xì)胞株中分別有1160、1731、1579和1630個(gè)基因表達(dá)下調(diào)(倍數(shù)值<-1.25)。任意3個(gè)轉(zhuǎn)染細(xì)胞株中的

4、共下調(diào)基因與5個(gè)miRNA調(diào)控靶點(diǎn)分析系統(tǒng)(TargetScan6.2、miRDB、PicTar、microrna.org和DIANA LAB)預(yù)測(cè)的miR-200c調(diào)控基因綜合比較,獲得45個(gè)交集基因。⑷生物信息學(xué)分析顯示45個(gè)差異表達(dá)基因相關(guān)信號(hào)通路包括G13信號(hào)通路、突觸傳遞(synaptic transmission)信號(hào)通路、神經(jīng)沖動(dòng)傳遞(transmission ofnerve impulse)信號(hào)通路、轉(zhuǎn)錄負(fù)調(diào)控(nega

5、tive regulation of transcription)信號(hào)通路和細(xì)胞內(nèi)代謝負(fù)調(diào)控(negative regulation of cellular metabolism)信號(hào)通路等;不同的信號(hào)通路可以通過(guò)共調(diào)基因相互聯(lián)系;在特定的信號(hào)通路中,共調(diào)基因間也存在密切的相互聯(lián)系。⑸miR-200c預(yù)測(cè)靶蛋白EDNRA免疫組化分析顯示,36例乳腺癌標(biāo)本中17例表達(dá)陽(yáng)性(47.22%),明顯高于癌旁正常組織與良性乳腺病變中EDNRA的陽(yáng)

6、性表達(dá)(16.67%),其表達(dá)量與乳腺病變惡性度相關(guān)(p=0.005)。部分組織切片的EDNRA免疫組化與原位雜交結(jié)果相互比較,發(fā)現(xiàn)EDNRA的表達(dá)與miR-200c的表達(dá)相反,提示EDNRA可能是miR-200c的調(diào)控靶點(diǎn)。
  結(jié)論:①相較于正常、低度惡性細(xì)胞株,miR-200c的表達(dá)在高度惡性乳腺癌細(xì)胞株中明顯下調(diào)。②miRNA原位雜交方法在組織標(biāo)本上的應(yīng)用,能定性并半定量反映miRNA的表達(dá)情況。乳腺疾病組織芯片的miR-

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