PPIL6基因的生物信息學分析及其在兒童急性淋巴細胞白血病的表達.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、研究背景:急性淋巴細胞白血病(acute lymphoblasticleukemia,ALL)是我國兒童和青少年最常見的惡性腫瘤性疾病,占兒童白血病70%左右。近年來隨著白血病治療方法的進展,ALL患兒的完全緩解率及長期無病生存率有顯著的提高,但仍有少數(shù)患兒療效差,其中對化療不敏感和復發(fā)是治療失敗的主要因為,而其主要分子機制至今仍不清楚。近年來研究認為,痛基因的轉化和抑癌基因的畸變在ALL的發(fā)生發(fā)展中有重要作用,因此對它們進行深入研究有

2、助于尋找新的改善ALL預后的治療方法。郭碧贊、康睿等研究發(fā)現(xiàn)位于6q21區(qū)域內(nèi)的PPIL6基因可能是一個新的候選腫瘤抑制基因。進一步研究PPIL6基因表達與ALL發(fā)生發(fā)展的關系,有助于篩選可用于ALL早期診斷、病情變化監(jiān)測及預后判斷的抑癌基因,從而為ALL的基因靶向治療提供新的思路。
   目的:以人類基因組數(shù)據(jù)庫為基礎,對PPIL6基因進行生物信息學分析,為進一步研究PPIL6基因的功能、進一步選擇動物模型克隆PPIL6基因及

3、進行功能研究提供理論基礎。并通過檢測PPIL6基因在初治、復發(fā)與緩解組ALL患兒及對照組的表達,探討PPIL6基因表達在兒童急性淋巴細胞白血病(ALL)發(fā)生發(fā)展中的意義。
   方法:根據(jù)GeneBank中已登錄的PPIL6基因序列,利用生物信息學軟件對其進行生物信息學分析。應用RT-PCR法分別檢測46例急性淋巴細胞白血病患兒(其中包括初治組20例,緩解組16例,復發(fā)組10例)及14例貧血查因患兒骨髓單個核細胞(bone ma

4、rrowmononuclear cells,BMMCs)中PPIL6基因的表達水平,分析PPIL6表達水平與ALL發(fā)生發(fā)展及預后的關系。
   結果:PPIL6的cDNA全長為4223 bp,分布于一個位于NC001111298基因組序列中,定位于6q21。PPIL6基因家族序列在人及其他8種常見物種中高度保守。人類PPIL6基因編碼的蛋白產(chǎn)物由337個氨基酸組成,分子式是C1722H2658N474O495S12,是一略顯堿性

5、的蛋白質(zhì)。PPIL6基因編碼產(chǎn)物廣泛分布于細胞膜、細胞核及多種細胞器中。ALL初治組及復發(fā)組患兒的PPIL6基因表達水平(0.25±0.19,0.32±0.15)明顯低于對照組(0.55±0.33),差異有顯著性(P<0.05);緩解組患兒PPIL6基因表達水平明顯高于初治組患兒(0.51±0.33 VS0.25±0.19),差異有顯著性(P<0.05);緩解組患兒PPIL6基因的表達水平高于復發(fā)組(0.51±0.33 vs0.32±0

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