奧曲肽對(duì)人大腸癌細(xì)胞系SW480影響的蛋白質(zhì)組學(xué)研究.pdf_第1頁(yè)
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1、中南大學(xué)博士學(xué)位論文奧曲肽對(duì)人大腸癌細(xì)胞系SW480影響的蛋白質(zhì)組學(xué)研究姓名:胡偉申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:博士專(zhuān)業(yè):外科學(xué)指導(dǎo)教師:鐘德玝20060401博士學(xué)位論文中文摘要2DE)分離實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組的人大腸癌細(xì)胞系SW480的總蛋白質(zhì),凝膠銀染及考馬斯亮藍(lán)染顯色,建立雙向凝膠電泳圖譜,經(jīng)ImageMaster軟件進(jìn)行圖像分析,篩選部分分離較好的差異蛋白質(zhì)點(diǎn)。(4)應(yīng)用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間/飛行時(shí)間譜(Matrixassistedlase

2、rdesorption/ionizationtimeofflighttimeofflightmassspectrometryMALDITOFTOFMS)分析部分差異表達(dá)的蛋白質(zhì)點(diǎn),獲取肽質(zhì)量指紋圖譜,Mascot軟件搜索NCBInr數(shù)據(jù)庫(kù)鑒定蛋白質(zhì)。結(jié)果:(1)MTT法顯示奧曲肽在625~200OOng/ml濃度范圍對(duì)SW480細(xì)胞有明顯的生長(zhǎng)抑制作用,并以濃度2500ng/ml時(shí)的抑制作用為最強(qiáng)。濃度在25OOng/ml以上抑制作用并

3、不繼續(xù)增加。(2)ImageMaster軟件分析3次相同條件下的2DE圖譜,結(jié)果顯示重復(fù)性、匹配性較好。對(duì)照組檢測(cè)到(1091448)個(gè)蛋白點(diǎn),平均匹配率894%;處理組檢測(cè)到(98537)個(gè)蛋白點(diǎn),平均匹配率886%。對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組的3塊不同的膠間蛋白質(zhì)點(diǎn)在等電聚焦(Isoelectricfocusing,IEF)方向的偏差為O6920186mm和08420158mm,在十二烷基磺酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳(Sodiumdoecylsul

4、fateopolyacrylamidegelelectrophoresis,SDS—PAGE)方向上的偏差為1242土0236mm和1376土0312mm。制得對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組平均膠,以平均膠進(jìn)行匹配,匹配率為804%。(3)篩選出差異表達(dá)蛋白質(zhì)點(diǎn)136個(gè),其中50個(gè)表達(dá)上調(diào),47個(gè)表達(dá)下調(diào),39個(gè)未匹配。(4)選取奧曲肽處理后上調(diào)、下調(diào)或未匹配的蛋白質(zhì)點(diǎn)共10個(gè)進(jìn)行質(zhì)譜分析,從中獲得9張較好的肽質(zhì)量指紋,鑒定了7個(gè)蛋白質(zhì)。包括電壓依賴(lài)性

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