稀有鮈鯽microRNA的鑒定及在水生態(tài)毒理學(xué)上的初步應(yīng)用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、MicroRNAs(miRNAs)是一類重要的內(nèi)源性短的(~22個核苷酸的長度)單鏈非編碼RNA(ncRNA),存在于動物、植物等真核生物以及某些病毒中,廣泛參與細(xì)胞增殖、分化、凋亡、衰老及代謝等生物體內(nèi)的多個生理生化過程。研究顯示,miRNAs的異常表達(dá)與許多人類疾病的發(fā)生密切相關(guān)。雖然已有大量文獻(xiàn)報道了PAHs對人類健康的危害,但大部分工作還主要集中在對高分子量PAHs的研究上,忽略了低分子量PAHs的環(huán)境危害。
  稀有鮈鯽

2、(Gobiocypris rarus)是中國一種小型鯉科土著魚類,已被廣泛用作水生實驗用魚。鑒定稀有觴鯽的miRNAs基因信息是發(fā)現(xiàn)miRNA的生物學(xué)功能和篩選新的分子生物標(biāo)志物,以評估未來環(huán)境污染的風(fēng)險的第一步。然而,稀有鮈鯽的相關(guān)生物學(xué)數(shù)據(jù)如miRNA轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)并沒有獲得。
  本研究借助Illunima高通量測序技術(shù)獲取了稀有鮈鯽的miRNAs生物學(xué)信息。以菲(Phenanthrene,Phe)為例,研究了成年稀有鮈鯽(~5

3、個月)在濃度為10μg/L、100μg/L、1000μg/L的Phe溶液中暴露30d后的肝臟毒性效應(yīng)。
  主要研究結(jié)果如下:
  1.構(gòu)建了一個從稀有鮈鯽6個不同組織(腦、眼、肝臟、鰓、肌肉和心)中提取的等量RNA構(gòu)成的混合文庫,并通過illumina高通量測序技術(shù)進(jìn)行測定,共獲得26,930,553個原始序列和2,118,439個高質(zhì)量序列。通過生物信息學(xué)分析首次在稀有鮈鯽中發(fā)現(xiàn)并注釋了352個保守的以及112個候選的新

4、miRNAs。
  2.對Phe處理組的稀有鮈鯽肝臟組織進(jìn)行TUNEL和Hoechst33342染色,染色結(jié)果均顯示隨著暴露濃度的升高,肝臟細(xì)胞凋亡數(shù)目也隨之增加,其中10μg/L和100μg/L的處理濃度顯著誘導(dǎo)了肝臟細(xì)胞的凋亡發(fā)生。此外還發(fā)現(xiàn)caspase3酶活性在10μg/L和100μg/L的處理組顯著上升,caspase9的活性僅在1000μg/L的處理組中顯著上調(diào)(P<0.05),caspase8各濃度處理組均無顯著上調(diào)

5、。綜合上述組織學(xué)染色和細(xì)胞凋亡過程中caspase3、caspase8和caspase9酶活性的試驗結(jié)果表明,Phe通過caspase9介導(dǎo)的內(nèi)源性途徑引起了稀有鮈鯽肝臟細(xì)胞凋亡的發(fā)生。
  3.采用qPCR法檢測p53信號通路中的細(xì)胞周期以及細(xì)胞凋亡相關(guān)基因在稀有鮈鯽肝臟中的表達(dá)情況。細(xì)胞周期調(diào)控基因p21和gadd45α的表達(dá)量在各濃度組均顯著上調(diào)(P<0.05),其中10μg/L和100μg/L的處理組與對照組相比上調(diào)倍數(shù)均

6、10倍以上??辜?xì)胞凋亡基因bcl-2表達(dá)量在100μg/L和1000μg/L濃度組沒有顯著變化,而10μg/L濃度組基因表達(dá)量明顯增加(P<0.05)。與對照組相比,促凋亡基因bax的表達(dá)情況正好與bcl-2相反,在高濃度組(100μg/L和1000μg/L)顯著誘導(dǎo)(P<0.05)。
  4.采用poly(A)加尾法測定了Phe對稀有鮈鯽肝臟miR-17~92 cluster(miR-17、miR-18a、miR-19a、miR

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