1、本研究采用時間進程試驗，應用Affymetrix豬全基因組芯片，分別選取未妊娠，妊娠初期(妊娠25天)，妊娠中后期(妊娠85天)3個階段各3個全(或半)同胞大白豬個體子宮肌膜及卵巢組織(盡量采同質(zhì)細胞)進行RNA抽取，純化，反轉(zhuǎn)錄，芯片雜交等得出基因表達譜；應用Q-PCR對芯片表達譜數(shù)據(jù)可靠性進行驗證；結合對適用于本試驗表達譜數(shù)據(jù)的基因網(wǎng)絡調(diào)控模型探索及母豬妊娠調(diào)控網(wǎng)絡的構建，對基因表達譜數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計及功能基因組方面分析得到如下結果：

2、 1.得到妊娠初期卵巢2倍以上差異表達的基因974個，其中上調(diào)和下調(diào)的基因分別為418個和556個；妊娠中后期卵巢2倍以上差異表達的基因1800個，上調(diào)和下調(diào)的基因分別為826個和974個；妊娠初期子宮肌膜中2倍以上差異表達的基因355個，其中上調(diào)和下調(diào)的基因分別為189個和146個；妊娠中后期子宮肌膜中2倍以上差異表達的基因720個，其中上調(diào)和下調(diào)的基因分別有236個和487個。 2.通過對不同組織及不同妊娠階段的差異表

3、達基因的二維聚類發(fā)現(xiàn)，在卵巢和子宮肌膜中，所有差異基因可以分成7大類。根據(jù)對同一類中的已知基因功能的了解，從共表達基因角度挑選出33個差異基因供最終選擇妊娠相關新候選基因使用。 3.通過對基因表達譜數(shù)據(jù)功能分析發(fā)現(xiàn)：(1)分子功能方面，妊娠中后期卵巢中MHCⅡ族受體基因及具有酶調(diào)節(jié)活性的基因無差異表達；妊娠初期卵巢中無MHCⅠ族受體基因差異表達。而與鐵結合相關的基因只在子宮肌膜中有表達有變化。妊娠中后期與妊娠前期相比，卵巢中脂結

4、合、胞漿運動、內(nèi)切酶、趨化因子的基因表達有明顯差異。(2)生物過程方面，妊娠中后期卵巢中與正常生理過程相關的基因幾乎沒有差異表達，相對于妊娠初期卵巢及所有妊娠階段的子宮肌膜來說，與刺激，壓力及對其它組織的應激相關的基因表達差異更多。妊娠初期的子宮肌膜中與細胞生長，細胞大小調(diào)節(jié)及細胞周期相關的基因表達有變化。(3)細胞組成方面，妊娠初期中表達有變化的基因主要都與細胞膜相關。而妊娠中后期卵巢及所有妊娠階段子宮肌膜中與質(zhì)膜，免疫突觸，蛋白復合

5、體，MHC蛋白復合體形成相關的基因都有表達變化。其中，妊娠中后期子宮肌膜中與胞膜組成及形成相關的基因的表達變化最大。 4.在對卵巢已知差異基因的分析過程中未發(fā)現(xiàn)有效生物通路；在對子宮肌膜已知差異基因分析過程中，妊娠初期發(fā)現(xiàn)26個基因參與的5個有效生物通路，妊娠后期發(fā)現(xiàn)18個基因參與的3個有效生物通路。通過對生物通路的交叉分析，對整個生物作用網(wǎng)絡有了系統(tǒng)認識，通過對已知差異基因在通路中的位置，預測了其對妊娠可能有的作用。