大熊貓亞成體獸舍空氣中可培養(yǎng)細菌種類分析以及兩株新種細菌的多相分類學研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、作為圈養(yǎng)大熊貓的重要場所和青少年科普教育基地,大熊貓繁育基地每天接待大量國內外游客參訪。大熊貓獸舍附近是游客經(jīng)常駐足觀光的地方,其空氣質量與游客多少呈現(xiàn)關聯(lián)。獸舍空氣質量直接影響大熊貓的健康,甚至可能誘發(fā)某些疾病的發(fā)生。一直以來,人們很少關注圈養(yǎng)大熊貓獸舍的微生物狀況。本研究通過自然沉降法收集培養(yǎng)大熊貓亞成體獸舍空氣中的可培養(yǎng)細菌,并進行分類鑒定,以評估獸舍空氣中微生物是否會對大熊貓形成不良影響。分離得到28株細菌,并對其中2株新種細菌

2、進行了多項分類學研究,研究結果如下:
  1.大熊貓亞成體獸舍可培養(yǎng)細菌種類及耐藥性分析
  通過菌落形態(tài)特征觀察,分離純化出28株細菌。經(jīng)16S rRNA序列分析和聚類分析發(fā)現(xiàn),這些細菌分屬17個屬:微球菌屬(Micrococ cus)、明串珠菌屬(Leuconostoc)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)、志賀菌屬(Shigella)、埃希菌屬(Escherichia)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、考

3、克氏菌屬(Kocuria)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、摩根氏菌屬(Morganella)、微小桿菌屬(Exiguobacterium)、不動桿菌屬(Acinetobacter)、巨型菌屬(Macrococcus)、羅氏菌屬(Rothia)、迪茨氏菌屬(Dietzia)、西地西菌屬(Cedecea)、金黃桿菌屬(Chryseobacterium)和溶桿菌屬(Lysobacter)。其中,葡萄球菌屬、志賀菌屬和金黃桿菌屬等屬的某些細菌

4、為條件致病菌,在動物機體處于應激或者免疫力低下時易引發(fā)感染。大熊貓亞成體獸舍中出現(xiàn)這些常見的條件性致病菌證實大熊貓存在感染的潛在風險。
  藥敏實驗結果顯示,這17個屬的細菌均存在不同程度的耐藥性,且普遍存在多重耐藥現(xiàn)象,至少耐三種抗生素,多達14耐。其中對青霉素G、林可霉素、呋喃唑酮、磺胺甲基異惡唑和氨芐西林的耐藥性最為嚴重,至少有10種菌耐這些抗生素;氟苯尼考、多西環(huán)素、丁胺卡那、恩諾沙星、慶大霉素、環(huán)丙沙星和鏈霉素這7種抗生

5、素幾乎對所有細菌都敏感。由此可見,大熊貓亞成體獸舍是某些耐藥細菌的儲存地。
  2.菌株CF21T的多相分類學研究
  CF21T在TSA和LB瓊脂培養(yǎng)基上均能較好的生長,在LB平板上生長3天后為米白色半透明,表面光滑,且微微向上凸起的圓形菌落。革蘭氏染色為陰性、短桿狀;透射電鏡下觀察為球桿狀,長0.90-0.95μm,寬0.60-0.65μm,無鞭毛。菌株CF21T生長的NaCl范圍為0-2%(w/v)(最適范圍為0-1%

6、),溫度范圍為10℃-40℃(最適溫度為28℃-30℃),pH范圍為6.0-9.0(最適pH范圍為6.0-7.0),需氧,無運動性。過氧化氫酶和氧化酶檢測均為陽性;可以降解淀粉、明膠,不能降解Tween80;不能將硝酸鹽還原為亞硝酸鹽;不產(chǎn)生吲哚和硫化氫;無β-半乳糖苷酶、鳥氨酸脫羧酶活性和精氨酸脫羧酶活性;同時也不能利用多種碳源。CF21T的主要極性脂構成為二磷脂酰甘油(diphosphatidylglycerol,DPG)磷脂酰甘油

7、(phosphatidylglycerol,PG)、磷脂酰乙醇胺(Phosphatidylethanolamine,PE)和一個未知的磷脂;主要呼吸醌為Q-8;主要脂肪酸為iso-C16∶0(30.22%),iso-C15∶0(25.70%)和the sum of9/10-methyl C16∶0 and/or iso-C17∶1ω9c(21.94%);基因組DNA的G+C構成比為68.72 mol%;16S rRNA基因序列分析結果顯

8、示菌株CF21T屬于溶桿菌屬(Lysobacter),與L.ruishenii CTN-1T的16SrRNA序列同源性(95.1%)最高;gyrB序列分析也顯示菌株CF21T屬于溶桿菌屬的成員;與L.ruishenii CTN-1T的雜交率為56%。基于以上結果分析,菌株CF21T為溶桿菌屬的一個新種,命名為Lysobacter chengduensis sp.nov.,且該種模式菌株為CF21T(=CGMCC1.15145T=DSM1

9、00306T)。
  3.菌株25-1T的多相分類學研究
  菌株25-1T在TSA和LB培養(yǎng)基上均能較好的生長,在LB平板上生長3天后為金黃色不透明且向上凸起的、邊緣整齊的圓形菌落。革蘭氏染色為陰性、桿狀。透射電鏡下觀察為桿狀無鞭毛,長0.88-0.92μm,寬0.44-0.48μm。菌株25-1T生長的NaCl范圍為0-2%(w/v)(最適范圍為0-0.5%),溫度范圍為10℃-40℃(最適溫度為28℃-30℃),pH范

10、圍為6.0-9.0(最適pH范圍為6.0-7.0),需氧,無運動性。過氧化氫酶和氧化酶檢測均為陽性,可以降解淀粉和Tween80,不能降解明膠,不能將硝酸鹽還原為亞硝酸鹽,不產(chǎn)生吲哚和硫化氫,無β-半乳糖苷酶活性,無精氨酸脫羧酶活性,有鳥氨酸脫羧酶活性,不能利用多種碳源。菌株25-1T的主要極性脂為磷脂酰乙醇胺和兩個未知的氨基脂和兩個未知的脂;主要呼吸醌為MK-6;主要脂肪酸為iso-C15∶0(44.0%),iso-C17∶03OH(

11、19.8%),summed feature3(C16∶1ω7c and/or C16∶1ω6c,12.7%)和summed feature9(10-methyl C16∶0and/or iso-C17∶1ω9c,7.8%);基因組DNA的G+C構成比為36.2 mol%;16S rRNA基因序列分析結果顯示菌株25-1T屬于金黃桿菌屬(Chryseobacterium),與C.carnis G81T的16S rRNA序列同源性為96.4

12、%,與C.lathyri RBA2-6T的同源性為95.8%; gyrB序列分析也顯示菌株25-1T屬于金黃桿菌屬;與C.lathyri RBA2-6T的雜交率為38%?;谝陨辖Y果分析,菌株25-1T為金黃桿菌屬的一個新種,將其命名為Chryseobacterium chengduensis sp.nov.,且該種模式菌株為25-1T=(CCTCC AB2015133T=DSM100396T)。
  通過研究發(fā)現(xiàn),大熊貓亞成體獸

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