利用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選PEDV蛋白間互作及與nsp14、nsp16互作的宿主蛋白.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、豬流行性腹瀉(PED)是由豬流行性腹瀉病毒(PEDV)引起的一種急性、高度接觸性腸道傳染病,主要特征表現(xiàn)為急性腸炎、嘔吐、腹瀉和脫水,各年齡階段的豬均易感,初生仔豬最為嚴(yán)重,發(fā)病率和死亡率極高,給養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。酵母雙雜交系統(tǒng)是目前研究蛋白質(zhì)間相互作用的一種有效技術(shù),該系統(tǒng)靈敏性高,能檢測(cè)到生物體內(nèi)很弱的蛋白質(zhì)相互作用。本研究主要利用酵母雙雜交系統(tǒng)探究PEDV各病毒蛋白間存在的相互作用以及分別篩選與PEDV nsp14、ns

2、p16存在相互作用的宿主蛋白。主要研究?jī)?nèi)容如下:
  1.酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)分析PEDV各蛋白間的相互作用
  首先,構(gòu)建PEDV除nsp11外所有病毒蛋白的兩套酵母融合表達(dá)質(zhì)粒,包括誘餌蛋白質(zhì)粒pGBKT7-X(bait)和獵物蛋白質(zhì)粒pGADT7-X(prey)共44個(gè),對(duì)其進(jìn)行自激活活性和毒性檢測(cè),發(fā)現(xiàn)pGBKT7-nsp15、pGADT7-nsp4、pGADT7-nsp5、pGADT7-nsp15對(duì)酵母Y2H菌株有一定毒

3、性,pGBKT7-nsp3-1有自激活活性(不能用于酵母雙雜交實(shí)驗(yàn))。然后,將所有bait和prey質(zhì)粒以點(diǎn)對(duì)點(diǎn)的方式兩兩共轉(zhuǎn)化酵母Y2H菌株以檢測(cè)PEDV各蛋白間存在的相互作用,通過(guò)酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)共篩選了462組互作,結(jié)果篩選到46組存在相互作用,包括29組單向互作,12組雙向互作及5組自身互作。
  2.豬小腸上皮細(xì)胞酵母雙雜交cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及鑒定
  首先在體外培養(yǎng)豬小腸上皮細(xì)胞并提取其總RNA,以總RNA為模板合

4、成含有與pGADT7-Rec線性載體同源末端的ds-cDNA,然后將ds-cDNA與pGADT7-Rec共轉(zhuǎn)入酵母Y187菌株中,通過(guò)同源重組獲得酵母雙雜交cDNA文庫(kù),最后將所有克隆收集并分裝成1ml文庫(kù)用于雙雜交篩選。本實(shí)驗(yàn)成功構(gòu)建并鑒定了一個(gè)較高質(zhì)量的豬小腸上皮細(xì)胞酵母雙雜交cDNA文庫(kù),文庫(kù)滴度6.5×108 cfu/mL,文庫(kù)容量1.04×1011cfu。
  3.篩選cDNA文庫(kù)以獲得與PEDV nsp14、nsp16

5、相互作用的宿主蛋白
  將誘餌蛋白質(zhì)粒pGBKT7-nsp14和pGBKT7-nsp16分別轉(zhuǎn)化Y2H菌株,轉(zhuǎn)化產(chǎn)物分別與1mL豬小腸上皮細(xì)胞酵母雙雜交cDNA文庫(kù)共培養(yǎng),通過(guò)對(duì)文庫(kù)的篩選分析得到nsp14和nsp16的潛在互作宿主蛋白。通過(guò)酵母回復(fù)雜交實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)nsp14與宿主蛋白CCT7、EIF3I存在相互作用,nsp16與宿主蛋白DDIT4、UBE2K、UBA52存在相互作用。通過(guò)免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),在HEK293T細(xì)胞

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