1、凡納濱對(duì)蝦(Pacific white shrimp，Litopenaeus vannamei)，又名南美白對(duì)蝦，自然分布于南美洲太平洋沿岸水域，是世界重要的對(duì)蝦類養(yǎng)殖品種之一。凡納濱對(duì)蝦具有適應(yīng)性廣泛、對(duì)不良環(huán)境抗逆性強(qiáng)、生長(zhǎng)速度快等特點(diǎn)，其肉質(zhì)鮮美，深受人們的喜愛(ài)，有著十分廣闊的市場(chǎng)前景。但是近年來(lái)由于氣候異常，導(dǎo)致我國(guó)南方凡納濱對(duì)蝦主養(yǎng)殖區(qū)屢次遭遇寒災(zāi)，對(duì)凡納濱對(duì)蝦產(chǎn)業(yè)造成重大損失。異常低溫不僅導(dǎo)致凡納濱對(duì)蝦大量死亡，同時(shí)溫度因素

2、也制約著凡納濱對(duì)蝦的養(yǎng)殖季節(jié)和地域，影響?zhàn)B殖產(chǎn)量和效益。為了加速培育出耐低溫凡納濱對(duì)蝦新品種，提高養(yǎng)殖產(chǎn)量和經(jīng)濟(jì)效益，對(duì)凡納濱對(duì)蝦耐低溫相關(guān)性狀的遺傳參數(shù)進(jìn)行估計(jì)是十分必要的。然而，在傳統(tǒng)的BLUP遺傳育種方法中，個(gè)體間親緣關(guān)系的確定來(lái)源于人為記錄的物理系譜，物理系譜的構(gòu)建很容易由于標(biāo)記脫落、誤讀和引入共同環(huán)境效應(yīng)而導(dǎo)致信息錯(cuò)誤或不準(zhǔn)確，給性狀遺傳參數(shù)的準(zhǔn)確估計(jì)造成困難。本研究首次將微衛(wèi)星分子標(biāo)記引入凡納濱對(duì)蝦耐低溫性狀遺傳參數(shù)的評(píng)估中

3、，通過(guò)計(jì)算分子親緣相關(guān)度構(gòu)建分子系譜進(jìn)而對(duì)性狀遺傳參數(shù)進(jìn)行估計(jì)，并利用交叉驗(yàn)證跟物理系譜相比較，以佐證分子親緣相關(guān)度在實(shí)際中估計(jì)性狀遺傳參數(shù)的可行性。本實(shí)驗(yàn)主要結(jié)果如下:
　　(1)本實(shí)驗(yàn)通過(guò)篩選凡納濱對(duì)蝦多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn)，并不斷優(yōu)化位點(diǎn)組合、反應(yīng)體系及反應(yīng)程序，成功建立了一個(gè)五重、兩個(gè)四重和一個(gè)三重PCR反應(yīng)體系，并將其應(yīng)用于11個(gè)凡納濱對(duì)蝦家系的親權(quán)鑒定。結(jié)果顯示，4組多重PCR體系中的16個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)在11個(gè)凡納濱對(duì)蝦家系中

4、的平均等位基因數(shù)（Na）為6，平均多態(tài)信息含量(PIC)為0.581，平均觀測(cè)雜合度(Ho)為0.513，平均期望雜合度(He)為0.636。利用Cervus3.0軟件，對(duì)已知系譜關(guān)系的11個(gè)凡納濱對(duì)蝦家系進(jìn)行親權(quán)分析，其第一親本累積排除率(CE-1P)、第二親本累積排除率(CE-2P)和雙親累積排除率(CE-PP)分別為0.99525487、0.99990862和0.99999986。進(jìn)一步分析表明，當(dāng)同時(shí)使用4組多重PCR體系進(jìn)行親

5、權(quán)分析時(shí)，其模擬配對(duì)率和親權(quán)鑒定準(zhǔn)確率均為100％，全同胞和半同胞家系鑒別效果良好，體現(xiàn)出4組多重PCR體系具有良好的鑒別能力。
　　(2)本實(shí)驗(yàn)采用已經(jīng)建立的4組多重PCR體系對(duì)凡納濱對(duì)蝦家系進(jìn)行基因分型，通過(guò)Coancestry1.0.1.2軟件中TrioML參數(shù)計(jì)算個(gè)體間分子親緣相關(guān)度，進(jìn)而構(gòu)建分子系譜，并分別利用物理系譜和分子系譜對(duì)低溫條件下凡納濱對(duì)蝦生長(zhǎng)及出肉率性狀進(jìn)行遺傳參數(shù)估計(jì)。結(jié)果顯示，個(gè)體間分子親緣相關(guān)度均在0～

6、1之間，平均值為0.058，分子親緣相關(guān)度與物理親緣相關(guān)度間皮爾遜相關(guān)系數(shù)為0.574，為中等強(qiáng)度正相關(guān)，表現(xiàn)出分子親緣相關(guān)度構(gòu)建的分子系譜有較高的可信度。利用物理系譜估算出的體重(BW)、體長(zhǎng)(BL)、肉重(MW)和出肉率(MR)性狀的遺傳力分別為0.16±0.05、0.12±0.04、0.20±0.05和0.18±0.05，根據(jù)分子系譜估算上述性狀的遺傳力分別為0.07±0.03(BW)、0.04±0.02(BL)、0.10±0.0

7、3(MW)、0.10±0.03(MR)，兩者皆為低水平遺傳力。在物理系譜信息下，計(jì)算得到低溫條件下凡納濱對(duì)蝦出肉率性狀與可測(cè)量性狀之間的遺傳相關(guān)，結(jié)果顯示出肉率(MR)與腹節(jié)全長(zhǎng)(ASL)的遺傳相關(guān)系數(shù)為最大（0.636±0.133），低溫條件下凡納濱對(duì)蝦群體平均出肉率為51.37％。交叉驗(yàn)證的結(jié)果表明，利用物理系譜和分子系譜計(jì)算的育種值預(yù)測(cè)值與觀察值間皮爾遜相關(guān)系數(shù)分別為0.56和0.55，兩者較為接近，說(shuō)明利用分子系譜和物理系譜預(yù)測(cè)