鴨MC1R基因的克隆測序與半番鴨羽色AFLP分子標記.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、羽色是半番鴨重要的質(zhì)量性狀,改良羽色性狀是水禽育種學(xué)家的研究重點,但是改良這些性狀用常規(guī)育種方法已受到了極大的限制,應(yīng)用分子標記輔助選擇已成為鴨育種改良的必然趨勢。在課題組白羽性狀選育的基礎(chǔ)上,從分子水平上研究探討半番鴨的羽色性狀,對進一步提高半番鴨白羽率,快速培育出具有我國特色的大型白羽半番鴨母本品系具有重要指導(dǎo)意義。針對目前半番鴨研究現(xiàn)狀,本研究由北京鴨和半番鴨的黑素皮質(zhì)素受體1(melanocortin 1 receptor,MC

2、1R)基因克隆測序和半番鴨羽色AFLP分子標記篩查兩部分組成,為分子標記輔助選擇育種提供了分子遺傳基礎(chǔ)。 實驗一,鴨MC1R基因的克隆測序:從北京鴨和半番鴨血液提取基因組DNA,根據(jù)雞、鵪鶉、雪雁、孔雀等MClR基因同源序列的保守區(qū)設(shè)計引物,PCR擴增、目的片段回收、克隆測序后進行序列分析。結(jié)果,(1)對北京鴨和半番鴨MC1R基因進行克隆測序,獲得了長為855bp的cDNA序列。為進一步研究半番鴨羽色MC1R基因SNP標記及在品

3、系選育中的應(yīng)用奠定了基礎(chǔ);(2)通過BLAST進行相似性搜索,結(jié)果表明,該序列與MC1R的序列同源性最高。其中半番鴨與北京鴨的保守性最高達98.9%,兩者與雪雁也有很高的保守性,都達到97.6%,與家雞、火雞、鵪鶉、藍孔雀的同源性在91.0%~95%之間??梢娗蓊惖腗ClR基因編碼區(qū)序列具有高度的保守性:(3)北京鴨與半番鴨核苷酸存在9個變異位點,其中位于229 bp(A/G)、385 bp(A/G)、634 bp(A/G)處的變異導(dǎo)致

4、了MC1R氨基酸序列分別在第77位(K/E)、129位(I/V)、212位(T/A)發(fā)生突變。 實驗二,半番鴨羽色AFLP分子標記的篩查:采用EeoR I/Taq I系列的64對引物重復(fù)實驗進行AFLP標記篩查。結(jié)果,(1)白羽性狀特有的標記初篩有10對引物含有13個特異性條帶,經(jīng)重復(fù)實驗已獲得可靠標記的3對引物為E-AAG/T-AAC、E-AAG/T-AGT、E-AGC/T-AAT并含有3個特異性條帶;(2)對3個白羽性狀特有

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