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文檔簡介
1、甘蔗為禾本科甘蔗屬作物,廣泛種植于熱帶和亞熱帶地區(qū),并作為生產(chǎn)食糖的重要原料,也是廣西的主要經(jīng)濟作物。本文利用MSAP檢測8個甘蔗伸長期DNA甲基化水平和5個成熟期品種甲基化水平,并克隆回收部分條帶,研究其與甘蔗農(nóng)藝性狀的之間的關(guān)系。研究結(jié)果如下:
1、甘蔗伸長期甲基化分析表明,11對引物組獲得了4719條多態(tài)性條帶。其中,非甲基化多態(tài)性條帶4288條,全甲基化多態(tài)性條帶241條,半甲基化多態(tài)性條帶190條。因此,甘蔗基因組C
2、CGG位點發(fā)生甲基化的方式主要是以內(nèi)部胞嘧啶(Cm5CGG)雙鏈甲基化為主。
2、成熟期甲基化分析表明,11對引物組合獲得3519條多態(tài)性條帶,其中,非甲基化多態(tài)3307條,全甲基化帶型171條,半甲基化帶型41條。甘蔗基因組CCGG位點發(fā)生甲基化的方式主要是以內(nèi)部胞嘧啶(Cm5CGG)雙鏈甲基化為主。
3、甘蔗伸長期和成熟期兩個時期的甲基化變化情況如下:平均每個品種擴增的半甲基化率從4.02%下降到1.16%,甲基
3、化敏感擴增多態(tài)性從9.12%下降到6.02%。
4、使用NTSYSpc軟件中UPGMA對8個甘蔗品種伸長期的MSAP中的HpaⅡ酶切數(shù)據(jù),進(jìn)行聚類分析。桂糖06-1721單獨成為第一類;柳城05-136和桂糖07-645成為第二類;桂糖04-1001和桂引C1-2003為第三類;桂糖03-1438、桂糖05-3626和桂糖06-244為第四類。用MspⅠ酶切數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析,桂糖06-1721單獨成為第一類,這與HpaⅡ數(shù)據(jù)分
4、析得到的結(jié)果一樣;柳城05-136也是單獨成為第二類;桂糖04-1001、桂引C1-2003、桂糖05-3626、桂糖03-1438、桂糖07-645和桂糖06-244為第三類。
5、對5個甘蔗品種成熟期的MSAP中的HpaⅡ酶切數(shù)據(jù),進(jìn)行聚類分析。桂糖07-645單獨成為第一類;柳城05-136和成為第二類;桂糖05-3626成為為第三類;桂引C1-2003和桂糖06-244為第四類。使用MspⅠ酶切數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析,桂糖0
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