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![基于機器學(xué)習(xí)方法構(gòu)建類天然產(chǎn)物性打分模型.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/19/12/a5087067-e73e-4acf-9900-188ef7c1c3de/a5087067-e73e-4acf-9900-188ef7c1c3de1.gif)
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文檔簡介
1、隨著藥學(xué)的發(fā)展,人們逐漸發(fā)現(xiàn)通過化學(xué)合成的方式尋找新藥具有研發(fā)成本高,研發(fā)周期很長,篩選命中率太低并且毒性很高等缺點,科學(xué)家們現(xiàn)在開始更多的從天然產(chǎn)物中尋找新藥,天然產(chǎn)物成為藥物發(fā)現(xiàn)的重要源泉。
本課題首先研究了Etrl等人已發(fā)表的基于分子片段分離天然產(chǎn)物的方法,并通過實驗證明該方法在預(yù)測分子量較大的天然產(chǎn)物時所存在的不足,之后本課題以多種機器學(xué)習(xí)算法為基礎(chǔ)構(gòu)建了化合物類天然產(chǎn)物性評價的打分方法,并對比了Etrl等人的方法。<
2、br> 本文用14132個天然產(chǎn)物分子和42490個合成分子做訓(xùn)練集,用Dragon6.0軟件計算得到了2514個分子描述符,并使用WEKA軟件內(nèi)設(shè)的CFS算法選出其中相關(guān)性最好的46個分子描述符進行模型的構(gòu)建,構(gòu)建好類天然產(chǎn)物性打分模型后,用測試集進行預(yù)測。結(jié)果顯示決策樹算法對天然產(chǎn)物的預(yù)測正確率為93.7%,對合成分子的預(yù)測正確率為97.7%,總預(yù)測正確率為96.7%;隨機森林算法對天然產(chǎn)物的預(yù)測正確率為98.9%,對合成分子的預(yù)
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