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![突變敏感性分子開關(guān)技術(shù)在乳腺癌PIK3CA基因突變檢測中的應(yīng)用研究.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/19/12/10b9a49a-53c3-4b11-b8ca-40b8399ed096/10b9a49a-53c3-4b11-b8ca-40b8399ed0961.gif)
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文檔簡介
1、目的:研究高保真DNA聚合酶介導(dǎo)的突變敏感性分子開關(guān)技術(shù)在乳腺癌PIK3CA基因突變快速檢測中的應(yīng)用,并分析PIK3CA基因突變與乳腺癌之間的關(guān)系。
方法:收集蘇州大學(xué)附屬第二醫(yī)院2008年至2011年乳腺癌組織標(biāo)本90例及乳腺纖維腺瘤和癌旁乳腺組織(超過病灶周圍5cm)各10例,應(yīng)用高保真DNA聚合酶介導(dǎo)的突變敏感性分子開關(guān)技術(shù)檢測其PIK3CA基因第9外顯子的G1633A(E545K)突變和第20外顯子的A3140G(
2、H1047R)突變。首先,選取PIK3CA基因20號外顯子A3140G(H1047R)突變?yōu)闄z測靶點(diǎn),驗(yàn)證突變敏感性分子開關(guān)技術(shù)在基因突變檢測中的應(yīng)用價值。具體步驟為:①提取健康人的基因組DNA、乳腺癌組織及乳腺纖維腺瘤和癌旁乳腺組織的基因組DNA并定量;②以健康人基因組DNA為模板通過PCR體外定點(diǎn)突變技術(shù),獲得含有PIK3CA基因3140位點(diǎn)為突變位點(diǎn)(堿基為G)的DNA片段;③用PCR反應(yīng)擴(kuò)增健康人基因組DNA,獲得含有PIK3C
3、A基因3140位點(diǎn)為野生位點(diǎn)(堿基為A)的DNA片段;④將獲得的突變和野生的DNA片段連接質(zhì)粒載體轉(zhuǎn)化入感受態(tài)細(xì)菌進(jìn)行擴(kuò)增,建立突變和野生的質(zhì)粒模板并定量;⑤分別設(shè)計(jì)與PIK3CA基因3140位點(diǎn)突變堿基和野生堿基配對的3’末端硫化磷酸修飾的引物對,驗(yàn)證高保真酶及引物的靈敏度和特異性;⑥以乳腺癌組織、乳腺纖維腺瘤和癌旁乳腺組織的基因組DNA為模板,分別用驗(yàn)證好的突變檢測引物和野生檢測引物進(jìn)行高保真DNA聚合酶介導(dǎo)的PCR反應(yīng),利用凝膠成
4、像系統(tǒng)對PCR結(jié)果進(jìn)行突變檢測分析。然后,將經(jīng)過驗(yàn)證的高保真DNA聚合酶介導(dǎo)的突變敏感性分子開關(guān)技術(shù)應(yīng)用于PIK3CA基因9號外顯子G1633A(E545K)基因突變的檢測。最后分析PIK3CA基因的熱點(diǎn)突變與乳腺癌之間的關(guān)系。
結(jié)果:重組的突變和野生質(zhì)粒定量后,將突變模板和野生模板分別稀釋成109、108、107、106、105、104拷貝/μl濃度梯度作為模板,檢驗(yàn)硫化修飾引物與高保真酶的靈敏度和特異性。結(jié)果顯示分子開
5、關(guān)技術(shù)在模板濃度小于106拷貝/μl時高保真酶及硫化修飾引物具有較好的靈敏度和特異性,分子開關(guān)技術(shù)的反應(yīng)體系可用于濃度為104-105拷貝/μl的乳腺癌及乳腺纖維腺瘤和癌旁乳腺組織的基因組DNA樣本的突變檢測。PCR突變檢測結(jié)果與DNA測序結(jié)果一致,證明分子開關(guān)技術(shù)可用于體細(xì)胞基因突變的檢測。
利用高保真DNA聚合酶介導(dǎo)的突變敏感性分子開關(guān)技術(shù)在90例乳腺癌患者組織DNA中檢測到了PIK3CA基因突變18例(突變率20%)
6、。18例PIK3CA基因突變中包含A3140G(H1047R)突變14例(突變率15.6%)、G1633A(E545K)突變3例(突變率3.3%)、G1624A(E542K)突變2例(突變率2.2%),其中1例A3140G突變和1例G1624A突變發(fā)生在同一患者中。PIK3CA基因突變與患者的c-erbB-2陰性相關(guān),而與年齡分布、腫瘤大小、淋巴結(jié)狀態(tài)及ER、PR和EGFR是否表達(dá)無相關(guān)性。乳腺纖維腺瘤和癌旁乳腺組織中未檢測到PIK3C
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