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![陸地棉和達(dá)爾文氏棉種間遺傳圖譜構(gòu)建及優(yōu)異材料創(chuàng)制.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/8/c5b7104a-3581-41f4-a41f-d42fafb01172/c5b7104a-3581-41f4-a41f-d42fafb011721.gif)
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文檔簡介
1、棉花不僅是一種重要的經(jīng)濟(jì)作物,也是重要的食用油資源。但是陸地棉栽培品種遺傳基礎(chǔ)過于狹窄,造成了目前棉花產(chǎn)量、質(zhì)量和抗逆等方面的育種進(jìn)展緩慢。所以挖掘野生棉的優(yōu)良性狀已變的尤為重要,達(dá)爾文氏棉屬于四倍體野生棉種,它具有纖維細(xì)度好、耐干旱及抗枯黃萎病等優(yōu)點(diǎn)。但是目前有關(guān)達(dá)爾文氏棉的研究不多。本研究利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)構(gòu)建了陸地棉TM-1和達(dá)爾文氏棉種間遺傳圖譜,對達(dá)爾文氏棉的重要性狀基因進(jìn)行定位,并進(jìn)行優(yōu)異材料的創(chuàng)制研究。
本研
2、究將陸地棉TM-1和達(dá)爾文氏棉雜交得到的F1自交得到含有181個單株的F2群體,以F2群體構(gòu)建遺傳連鎖圖譜,對黃色花瓣(Y1)、黃色花粉(P1)、花瓣紅心基斑(R2)、雞腳葉(L1)質(zhì)量性狀基因進(jìn)行定位,以及始花期性狀的QTL定位。
1.棉花種間SSR標(biāo)記遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
本研究使用實驗室的8488對SSR引物對親本進(jìn)行多態(tài)性的篩選,獲得多態(tài)性引物388對。利用388對多態(tài)性引物進(jìn)行F2群體基因型鑒定,共產(chǎn)生了40
3、0個位點(diǎn),這些位點(diǎn)包括顯性標(biāo)記位點(diǎn)91個,其中陸地棉TM-1的顯性位點(diǎn)有31個,達(dá)爾文氏棉的顯性位點(diǎn)有60個,分別占總位點(diǎn)的7.75%和15.00%;共顯性標(biāo)記位點(diǎn)309個,占總位點(diǎn)的77.25%。400個多態(tài)位點(diǎn)包含eSSR位點(diǎn)185個,gSSR位點(diǎn)215個,分別占總位點(diǎn)的46.25%和53.75%。
采用Joinmap3.0軟件,選擇LOD≧4來構(gòu)建連鎖群,最后共產(chǎn)生48個連鎖群,利用本實驗室構(gòu)建的海陸高密度遺傳圖譜,根據(jù)
4、共有位點(diǎn),將這48個連鎖群進(jìn)行編號,結(jié)果46個連鎖群定位到棉花的26條染色體上,包含330個位點(diǎn),其中4個形態(tài)標(biāo)記位點(diǎn),覆蓋了全基因組2379.09cM的遺傳距離,兩標(biāo)記間的平均遺傳距離是7.20cM。2個連鎖群未被定位到任何染色體上,命名為LG01和LG02,含有12個位點(diǎn),全長91.4cM。剩余的53個標(biāo)記不能構(gòu)成任何連鎖群。
定位到26條染色體上的330個位點(diǎn),其中,148個位點(diǎn)分布于At亞組,全長1164.32cM,標(biāo)
5、記間的平均遺傳距離為7.87cM;182個位點(diǎn)分布于Dt亞組,全長1214.77cM,標(biāo)記間的平均遺傳距離為6.66cM。D3上的標(biāo)記位點(diǎn)最多,有20個,A8上標(biāo)記住點(diǎn)最少,只有2個,D1最長有148.00cM。
卡方測驗結(jié)果表明,在所有的400個位點(diǎn)中,有85個位點(diǎn)表現(xiàn)偏分離,占總位點(diǎn)的21.2%,對定位到26條染色體上的330個位點(diǎn)檢測,有64個表現(xiàn)偏分離,占全基因組染色體位點(diǎn)的19.1%。At亞組上產(chǎn)生偏分離的位點(diǎn)有29
6、個,其中有14個位點(diǎn)(48.3%)偏向于TM-1;Dt亞組上產(chǎn)生偏分離的位點(diǎn)有35個,其中有15個位點(diǎn)(42.8%)偏向于TM-1。At∶Dt的偏分離位點(diǎn)比為1∶1.2。Dt亞組偏分離率高于At亞組。
2.棉花重要性狀的基因定位
利用本實驗構(gòu)建陸地棉TM-1和達(dá)爾文氏棉圖譜將棉花形態(tài)標(biāo)記定位,黃色花瓣基因(Y1)位于A13染色體上,與dPL0083-175的標(biāo)記位點(diǎn)最近,遺傳距離是4.1 cM;花瓣紅基點(diǎn)基因(R2)
7、定位到了A7染色體上,與NAU2887-450的標(biāo)記位點(diǎn)最近;黃色花粉(P1)定位到A5上,與標(biāo)記NAU4106-390最近,遺傳距離為3.1cM;雞腳葉(L1)基因定位到D1上,與TMG11-240的遺傳距離最近為2.0cM。
基于本實驗構(gòu)建陸地棉TM-1和達(dá)爾文氏棉的遺傳連鎖圖譜,利用WinQTLCart2.5軟件以復(fù)合區(qū)間圖法對始花期性狀進(jìn)行QTL定位,在F2群體中共檢測到4個QTL位點(diǎn),分別位于D1、A5、D11上,1
8、個部分顯性效應(yīng)QTL,1個顯性效應(yīng)的QTL,2個超顯性效應(yīng)QTL;貢獻(xiàn)率表現(xiàn)為0.48-11.7%。檢測到的在D11上的控制始花期的QTL表現(xiàn)為正效加性效應(yīng)和負(fù)效部分顯性效應(yīng),解釋了11.7%的表型變異,其貢獻(xiàn)率高于其他位點(diǎn),可能存在主效QTL,可用于進(jìn)一步的研究。
3.優(yōu)異材料的創(chuàng)制
本研究BC3F2群體中初步篩選,獲得了纖維強(qiáng)度較高的單株和長度較好的單株各3個,平均纖維長度和比強(qiáng)度分別為31.9 mm和37.47
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