污染湖泊宏基因組文庫中谷氨酸脫羧酶基因的克隆及功能研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、γ-氨基丁酸(GABA)是哺乳動物的重要神經(jīng)遞質(zhì),具有多種保健功能。谷氨酸脫羧酶在催化谷氨酸脫去羧基后,可生成GABA。相對于化學合成法而言,利用微生物技術(shù)生產(chǎn)γ-氨基丁酸具有不可比擬的優(yōu)越性。未培養(yǎng)微生物中含有大量的新基因資源,而普通的分離純化以及純培養(yǎng)技術(shù)很難將其加以利用。因此,本課題探究了通過建立宏基因組文庫的辦法,挖掘自然界中新的谷氨酸脫羧酶基因,這在國內(nèi)外谷氨酸脫羧酶的研究中鮮有報道。
  本課題利用酸性污染的環(huán)境樣品構(gòu)

2、建了以pGEM-3Zf(+)為載體,Escherichia coli DH5α為宿主的宏基因組文庫,其中總共包含1.2萬個陽性克隆,容量約為50.4 Mb。通過隨機測序并與GenBank數(shù)據(jù)庫進行一致性比對,發(fā)現(xiàn)該文庫中包含大量與參考序列一致性較低的新基因,證明了這一方法的有效性。
  通過活性篩選策略,最終從文庫中篩選得到了兩個具有明顯變色反應的陽性克隆,命名為pGEMW1和pGEMW2。將這兩個陽性克隆中所包含的ORF與Gen

3、Bank數(shù)據(jù)庫進行一致性比對和功能鑒定,最終獲得了一個編碼谷氨酸脫羧酶的新基因,將其命名為gad3。該基因全長約1.4 kb,編碼一條由469個氨基酸組成,分子量約為53 kDa,理論等電點為5.61的多肽鏈。在氨基酸水平上,它與Lactobacillus plantarum屬編碼的谷氨酸脫羧酶具有99%的一致性,但該基因來自于全基因組注釋,并沒有進行功能鑒定。
  將gad3基因表達的重組蛋白經(jīng)鎳柱純化后,對其酶學性質(zhì)進行測定,

4、發(fā)現(xiàn)其最適溫度為37℃,最適pH值為4.7,Sr2+,Co2+,F(xiàn)e2+、Zn2+、Mg2+和Zn2+對酶促反應有明顯的激活作用,Al3+、Fe3+、Mn2+和Cu2+對酶促反應有明顯的抑制作用。EDTA對酶活有明顯的抑制作用,說明該酶對金屬離子具有依賴性。純酶的Km值為0.619 mg/mL,kcat/Km=19.483 mL/(mg·s)。與其他來源的谷氨酸脫羧酶相比較,該酶的性質(zhì)參數(shù)處于中等水平。
  本研究建立了一整套利用

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