玉米自交系間抗病基因的遺傳差異研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、玉米是世界上重要的糧食作物,病蟲害嚴(yán)重影響玉米的產(chǎn)量。對玉米抗病基因變異特征和遺傳多樣性的研究,有助了解其進(jìn)化規(guī)律和發(fā)掘重要的抗病基因,對玉米抗病育種具有重要的指導(dǎo)意義。本研究利用生物信息學(xué)對不同玉米自交系間NBS類抗病基因LRR區(qū)域的核酸多態(tài)性、選擇壓力及不同雜種優(yōu)勢群中的遺傳差異等參數(shù)進(jìn)行分析,同時(shí)利用SNP數(shù)據(jù)對抗病基因家族的整體遺傳多樣性進(jìn)行分析,主要結(jié)果如下:
  1.5個(gè)抗病基因的LRR區(qū)域的核酸多態(tài)性π值差異較大,其

2、中ZmNBS63基因最為保守,π值為0;ZmNBS55基因的核酸多態(tài)性π值最高為0.062,其LRR核心結(jié)構(gòu)域處的π值為0.146,明顯要高于其兩側(cè)序列的0.099和0.131,說明該基因LRR結(jié)構(gòu)域堿基突變率較高,進(jìn)化速度較快。
  2. ZmNBS32、ZmNBS75、ZmNBS94在5個(gè)雜種優(yōu)勢群中的中性檢驗(yàn)結(jié)果均不顯著。ZmNBS55基因在Reid群體中的中性檢驗(yàn)結(jié)果得到顯著性的正值,暗示ZmNBS55基因可能在該群體中的

3、進(jìn)化受到選擇作用的影響。
  3.5個(gè)抗病基因LRR核心結(jié)構(gòu)域、非LRR結(jié)構(gòu)域的Ka/Ks比值均小于1,表明受到純化選擇作用。
  4.對86個(gè)玉米全基因組測序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),玉米 NBS類抗病基因具有3種遺傳多態(tài)性:TypeI,保守類抗病基因29個(gè)(π<0.01%);Type II,中等差異類抗病基因38個(gè)(π值介于0.01%-0.1%之間);Type III,高度差異類抗病基因29個(gè)(π>0.1%)。
  5.通

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