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![病原性絲狀真菌快速診斷和鑒定的實(shí)驗(yàn)研究.pdf_第1頁(yè)](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/19/12/ff549a45-e09f-4e6f-8918-2528f63f0542/ff549a45-e09f-4e6f-8918-2528f63f05421.gif)
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文檔簡(jiǎn)介
1、第一部分絲狀真菌DNA提取方法的比較和優(yōu)化
目的篩選適合提取絲狀真菌模板DNA的方法。方法比較2個(gè)菌落培養(yǎng)時(shí)間段(3d內(nèi)和7~14d)提取DNA質(zhì)量的差異:運(yùn)用氯化芐法、CTAB法、Biospin法和微波法分別提取黑曲霉基因組DNA,后用直接電泳、濃度測(cè)定、PCR擴(kuò)增等方法比較所提DNA的濃度和質(zhì)量;選出最優(yōu)方法,用8種常見(jiàn)絲狀真菌進(jìn)行檢驗(yàn)和驗(yàn)證。
結(jié)果:培養(yǎng)3天內(nèi)的菌落提取的DNA純度較高,無(wú)需純化即可用于
2、后續(xù)實(shí)驗(yàn);4種方法制備的DNA均可用于PCR等后續(xù)實(shí)驗(yàn),其中以CTAB法提取的DNA純度好,產(chǎn)率最高。結(jié)論CTAB法是一種適用于絲狀真菌DNA提取的簡(jiǎn)便方法。
第二部分 PCR-RFLP技術(shù)快速鑒別8種致病絲狀真菌病原菌的實(shí)驗(yàn)研究
目的建立能應(yīng)用于臨床檢測(cè)深部絲狀真菌感染病原菌的PCR-RFLP方法。方法用真菌通用引物擴(kuò)增煙曲霉、黃曲霉、土曲霉、黑曲霉、雜色曲霉、構(gòu)巢曲霉、尖端賽多孢和串珠鐮刀菌的ITS區(qū),分
3、別用HhaⅠ、HaeⅢ、HinfⅠ,TaqⅠ和MspⅠ5種限制性核酸內(nèi)切酶對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行酶切,建立以PCR為基礎(chǔ)的RFLP方法,然后對(duì)22株臨床株和2株環(huán)境分離株進(jìn)行PCR-RFLP圖譜分析。結(jié)果對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行RFLP分析可以準(zhǔn)確鑒定8種深部致病絲狀真菌,從DNA提取到酶切分析可以在一個(gè)工作日中完成;22株臨床株和2株環(huán)境分離株P(guān)CR-RFLP鑒定結(jié)果與傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果一致。結(jié)論P(yáng)CR-RFLP技術(shù)是一種能夠快速鑒定深部感染絲狀
4、真菌的有效方法。
第三部分多重PCR檢測(cè)深部曲霉感染病原菌的實(shí)驗(yàn)研究
目的建立能同時(shí)鑒別多種曲霉病原菌的多重PCR體系。方法篩選4種最常見(jiàn)深部曲霉感染病原菌(煙曲霉、黃曲霉、土曲霉和黑曲霉)的特異性引物建立多重PCR體系,用該體系檢測(cè)4種曲霉單模板、雙模板和三模板的擴(kuò)增情況,用DNA模板連續(xù)稀釋的方式檢測(cè)該反應(yīng)體系的敏感性。然后對(duì)22株臨床株和2株環(huán)境分離株進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果該多重PCR體系有較好的特異性,4種曲
5、霉分別擴(kuò)增出250 bp,200bp,450 bp和150 bp的DNA片段,電泳圖中能夠很好區(qū)別;在合適的反應(yīng)條件下,對(duì)單模板、雙模板和三模板均能擴(kuò)增出目的片段,未見(jiàn)明顯非特異片段的干擾;多重PCR體系的敏感性為100pg,較單種特異性引物的敏感性(10pg)略差。結(jié)論多重PCR體系能夠檢測(cè)4種曲霉的單純感染和混合感染,是一種快速、敏感、特異性強(qiáng)的診斷方法。
第四部分菌落PCR快速鑒別絲狀真菌的實(shí)驗(yàn)研究
目
6、的探討菌落PCR在檢測(cè)絲狀真菌病原菌方面的運(yùn)用。方法初步建立絲狀真菌菌落PCR的檢測(cè)技術(shù),用19種絲狀真菌標(biāo)準(zhǔn)株進(jìn)行驗(yàn)證,選取部分菌種的菌落PCR產(chǎn)物和酶切結(jié)果與常規(guī)PCR產(chǎn)物和酶切結(jié)果進(jìn)行比較;所有菌落PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,檢測(cè)其準(zhǔn)確性。結(jié)果19株菌中有16株(占84.2%)菌落PCR擴(kuò)增成功;其中有7株菌進(jìn)行了菌落PCR與常規(guī)PCR產(chǎn)物及酶切圖譜的比較,結(jié)果條帶完全一致;16株擴(kuò)增成功的菌株ITS區(qū)測(cè)序結(jié)果與傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)結(jié)果一致。結(jié)論菌
7、落PCR可以用于絲狀真菌的快速檢測(cè),不僅縮短了菌落形態(tài)學(xué)鑒定所需的較長(zhǎng)時(shí)間,而且也節(jié)省了制備模板DNA的時(shí)間和成本,是一種快速、經(jīng)濟(jì)的PCR檢測(cè)技術(shù)。
第五部分菌落PCR快速鑒定菌種的臨床應(yīng)用
目的探討菌落PCR在臨床標(biāo)本檢測(cè)中的應(yīng)用。方法收集1例皮下真菌感染的臨床標(biāo)本,在真菌培養(yǎng)長(zhǎng)出菌落伊始即進(jìn)行菌落PCR檢測(cè),擴(kuò)增ITS區(qū)進(jìn)行測(cè)序,鑒定病原菌的菌種;收集淺部真菌感染的臨床標(biāo)本(指趾甲、皮屑)11例,選擇真
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