生物大分子體系結合自由能及構象變化的計算機模擬.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、在論文的第一部分,我們用雙湮滅方法計算了谷氨酰胺結合蛋白(GInBP)單體和底物GIn結合的絕對結合自由能.模擬得到的結果是-14.59 KcaI/moI,與實驗值-8.025 Kcal/moI接近,并分析了雙湮滅方法的優(yōu)點和不足,并對該方法的改進提出了一些建議.論文的第二部分工作是選擇了GInBP 體單和谷氨酰胺結合蛋白(GInBP-GIn)復合物體系為研究對象.使用GROMOS96程序及其力場分別進行了600ps的MD模擬.通過兩個

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