SELDI蛋白芯片技術(shù)篩選乙肝后肝硬化與原發(fā)性肝癌腹水蛋白標(biāo)記物的研究.pdf_第1頁(yè)
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1、在我國(guó)肝癌死亡率位居惡性腫瘤死亡率的第二位,死于肝癌的患者占全球肝癌死亡人數(shù)的53%。盡管肝癌的臨床診治及基礎(chǔ)研究均取得了豐碩的成果,但其總體預(yù)后并未得到顯著改善,難以早期診斷而失去手術(shù)時(shí)機(jī)是重要原因之一。雖然甲胎蛋白仍然是肝癌早期診斷的最好指標(biāo),但其敏感度和特異性均不高,因此尋找一種簡(jiǎn)單、快速、高靈敏度和高特異性的診斷方法已成為臨床醫(yī)學(xué)的迫切需要。 目前隨著分子生物學(xué)技術(shù)的飛速發(fā)展,生命科學(xué)研究重點(diǎn)已經(jīng)從結(jié)構(gòu)基因組學(xué)轉(zhuǎn)移到蛋白

2、質(zhì)組學(xué)上來(lái)。其中表面增強(qiáng)激光解析離子化飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(SELDI-TOF-MS)是近些年來(lái)興起的一種新的蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法,其具有高通量性及高靈敏度,為研究疾病的發(fā)生、發(fā)展以及其早期生物標(biāo)記物的檢測(cè),提供了強(qiáng)有力的平臺(tái),目前已用于多種疾病的檢測(cè)和診斷的研究。 本課題旨在利用表面增強(qiáng)激光解析離子化飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(SELDI-TOF-MS)檢測(cè)乙肝后肝硬化和原發(fā)性肝癌兩組患者的腹水,得到兩組的蛋白質(zhì)表達(dá)譜,分析比較兩組差異表達(dá)

3、蛋白并構(gòu)建相應(yīng)的診斷模型(pattern),以其能從腹水中篩選乙肝后肝硬化患者和原發(fā)性肝癌患者蛋白質(zhì)標(biāo)志物及發(fā)現(xiàn)可以用于乙肝后肝硬化患者和原發(fā)性肝癌患者診斷的蛋白質(zhì)組學(xué)構(gòu)型,并為進(jìn)一步研究提供線索和新的思路。 第一部分蛋白芯片及的選擇 目的:從CM10、IMAC3-Cu這兩種芯片中選擇合適應(yīng)用于乙肝后肝硬化和原發(fā)性肝癌患者腹水蛋白質(zhì)指紋圖譜研究的芯片種類。 方法:選擇乙肝后肝硬化和原發(fā)性肝癌患者腹水各12例,采用

4、CM10、IMAC3-Cu兩種蛋白芯片,經(jīng)SELDI-TOF-MS技術(shù)測(cè)定蛋白質(zhì)譜,篩選檢測(cè)腹水蛋白的最佳芯片。 結(jié)果:在1000-50000Da范圍內(nèi),CM10芯片在各實(shí)驗(yàn)組捕獲的蛋白峰數(shù)分別為:乙肝后肝硬化組103個(gè);原發(fā)性肝癌組118個(gè)。IMAC3-Cu芯片在各實(shí)驗(yàn)組捕獲的蛋白峰數(shù)分別為:乙肝后肝硬化組53個(gè);原發(fā)性肝癌組57個(gè)。 結(jié)論:CM10能得到更多的乙肝后肝硬化和原發(fā)性肝癌患者有顯著意義的差異蛋白峰值,能更

5、好的應(yīng)用于本課題的研究。 第二部分乙肝后肝硬化患者和原發(fā)性肝癌腹水蛋白標(biāo)記物篩選和診斷模型的建立 目的:尋找乙肝后肝硬化和原發(fā)性肝癌相關(guān)蛋白質(zhì)及治療靶點(diǎn),初步構(gòu)建乙肝后肝硬化患者與原發(fā)性肝癌患者診斷模型,并探討其臨床應(yīng)用的可行性。 方法:收集30例乙肝后肝硬化患者、29例原發(fā)性肝癌患者新鮮腹水,經(jīng)分析選用Ciphergen公司的CM10芯片(弱陽(yáng)離子芯片),利用SELDI-TOF-MS技術(shù)對(duì)樣本進(jìn)行檢測(cè),得到其蛋

6、白質(zhì)質(zhì)譜掃描譜,并采用CiphergenBiosystems軟件對(duì)上述兩組波譜進(jìn)行兩兩比較分析。 結(jié)果: 1、在乙肝后肝硬化患者組與原發(fā)性肝癌組比較中發(fā)現(xiàn)24個(gè)蛋白峰在兩組間的比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。與乙肝后肝硬化患者腹水蛋白質(zhì)譜相比,原發(fā)性肝癌患者腹水中16個(gè)差異蛋白峰表達(dá)上調(diào),8個(gè)差異蛋白峰表達(dá)下調(diào)。 2、軟件從這24個(gè)差異蛋白峰中選取6個(gè)有顯著差異的標(biāo)志蛋白組合樣式建立診斷模型,其模型雙盲驗(yàn)證

7、的準(zhǔn)確率為81.35%(48/59),靈敏度為80.00%(24/30),特異度為82.75%(24/29),陽(yáng)性預(yù)測(cè)值82.75%(24/29),陰性預(yù)測(cè)值為80.00%(24/30)。 結(jié)論: 1、乙肝后肝硬化患者組與原發(fā)性肝癌組間腹水蛋白圖譜表達(dá)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。肝細(xì)胞惡變可能在肝細(xì)胞再生過(guò)程中發(fā)生,即經(jīng)肝細(xì)胞損害引起再生或不典型增生,此過(guò)程可能與這16個(gè)表達(dá)上調(diào)的差異蛋白峰相關(guān)。 2、建立的診斷模型,能將

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