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文檔簡介
1、多基因家族是一類來源相同,結(jié)構(gòu)相似,功能相關(guān)的基因。在植物基因組中,多基因家族占有很大的比例。例如,在擬南芥(A.thaliana)基因組中,有65%的基因?qū)儆诨蚣易?。成員基因間的表達差異作為進化的結(jié)果也許為解釋基因家族的進化方式提供了有用的證據(jù)。這種證據(jù)的獲得要求有一個針對大型基因家族的非常有力的研究方法,但是目前為止對于此類基因家族的全面地表達研究還十分的有限。 胚乳是玉米積累儲藏蛋白的重要器官,它主要含有醇溶谷蛋白(pr
2、olaim,亦稱zein)。醇溶蛋白專一性的在籽粒中表達,并且在籽粒發(fā)育過程中儲藏自由氨基酸。α-醇溶蛋白是玉米胚乳儲藏蛋白的主要成份,由一個龐大的超級基因家族編碼。α-醇溶蛋白超級基因家族分為四個基因家族:z1A,z1B,z1C,z1D。在玉米自交系B73中,該基因家族含有41個成員基因。作為一個典型的超級基因家族,α-醇溶蛋白超級基因家族提供了玉米研究的很好的模型。 雖然α-醇溶蛋白超級基因家族的大小和復雜性在自交系間有所不
3、同,但是它們的序列卻高度同源。比如,z1C基因家族的成員基因的同源度約為90%,甚至有兩個成員基因間有99.3%的相似。同樣的,在19kD和22kD之間,同源度也有60-65%。如此高的保守度只有依靠測序才能把成員基因區(qū)分開來。 本研究利用實時熒光定量PCR與RT-PCR隨機克隆測序相結(jié)合的策略,成功地獲得了玉米α-醇溶蛋白超級基因家族的表達譜。本研究首次揭示了α-醇溶蛋白基因在玉米籽粒發(fā)育的全期的詳細表達模式,以及該基因家族中
4、單個成員基因的表達狀態(tài)及表達模式。 本研究發(fā)現(xiàn)在α-醇溶蛋白超級基因家族的41個成員基因中,只有18個是表達的,并且它們的表達水平有很大的差別。從基因家族的水平來說,所有的家族都有一個“鋸齒”樣的表達模式,并且分為兩個截然不同的類別。一類為z1A和z1B基因家族,其特征為以四天為一周期的節(jié)律,另一類為z1C和z1D基因家族,其特征為以六天為一周期的節(jié)律。提示了在玉米營養(yǎng)物質(zhì)合成的過程中存在反饋調(diào)節(jié)的機制。而在每個基因家族的內(nèi)部,
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