下呼吸道常見致病菌檢測的基因芯片的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、下呼吸道感染是臨床上最常見的疾病之一,嚴(yán)重威脅人類的健康。因此,若想有效控制下呼吸道感染疾病的發(fā)生,快速而準(zhǔn)確地檢測下呼吸道中致病菌是關(guān)鍵的技術(shù)基礎(chǔ)之一。傳統(tǒng)的細(xì)菌培養(yǎng)方法及生化鑒定,操作繁瑣,且需要數(shù)天才能得到結(jié)果。免疫學(xué)方法和探針雜交技術(shù)也存在特異性或敏感性的問題。常規(guī)PCR一次只能檢出有限的幾種致病菌,對下呼吸道中分離的未知菌,或有多種細(xì)菌污染的樣品則顯得無從下手。
   為了實(shí)現(xiàn)對下呼吸道致病菌的快速檢測與鑒定,預(yù)防下呼

2、吸道感染疾病的發(fā)生,我們運(yùn)用寡核苷酸芯片技術(shù)建立了對常見的八種下呼吸道致病菌進(jìn)行檢測的方法,檢測的目的菌株是銅綠假單胞菌、肺炎克雷伯菌、鮑曼不動(dòng)桿菌、嗜肺軍團(tuán)菌、流感嗜血桿菌、肺炎鏈球菌、金黃色葡萄球菌、卡他莫拉菌。我們利用在細(xì)菌分類學(xué)上具有重要意義的16S rRNA和16S-23S rRNA間區(qū),以及一些已被驗(yàn)證過較為成熟的特異基因作為檢測靶基因,并在其間設(shè)計(jì)探針,建立一套下呼吸道致病菌的基因芯片快速檢測技術(shù)。不同細(xì)菌的16S rRN

3、A具有序列一致的恒定區(qū)和序列不同的可變區(qū),恒定區(qū)和可變區(qū)交錯(cuò)排列。這樣,我們在恒定區(qū)設(shè)計(jì)PCR引物,在可變區(qū)設(shè)計(jì)檢測探針;而特異基因作為靶基因時(shí),我們選擇其種內(nèi)保守性與種內(nèi)特異性最高的區(qū)域進(jìn)行引物和探針設(shè)計(jì),用多對引物(共分兩組)在同一反應(yīng)條件中,可以將全部待檢致病菌的相應(yīng)基因片段擴(kuò)增出來,再用每種細(xì)菌的特異性探針陣列與標(biāo)記的靶片段進(jìn)行雜交反應(yīng),雜交后用專用設(shè)備讀取分析熒光信號,可以定性和半定量地檢出致病菌。通過雜交結(jié)果可以看出設(shè)計(jì)的探

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