家禽VLDLR基因多態(tài)性與生長和屠宰性狀的相關(guān)分析及MDV對VLDLR mRNA表達(dá)的影響.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、極低密度脂蛋白受體(very low density lipoprotein receptor,VLDLR)是低密度脂蛋白受體家族中的一員,主要作用是通過與富含ApoE的脂蛋白結(jié)合來調(diào)控甘油三酯的代謝。在動物體內(nèi),VLDLR主要分布于骨骼肌、脂肪、心臟等組織,在肝臟中分布較少。本實(shí)驗(yàn)在前期實(shí)驗(yàn)的基礎(chǔ)上,對高郵鴨VLDLR基因的多態(tài)性進(jìn)行了進(jìn)一步的分析,在5'端UTR及信號肽編碼區(qū)位置檢測出4出個新的SNPs位點(diǎn),同時(shí)對VLDLR基因多態(tài)

2、性與高郵鴨生長性狀和屠宰性狀進(jìn)行了相關(guān)分析;在通過RT-PCR的方法對正常鴨和雞不同組織VLDLRmRNA的表達(dá)分布情況進(jìn)行研究的基礎(chǔ)上,對MD雞不同組織VLDLR mRNA的表達(dá)進(jìn)行檢測,以期研究發(fā)生腫瘤的禽組織VLDLR mRNA的表達(dá)變化情況。
  1高郵鴨VLDLR基因5'端UTR及信號肽編碼區(qū)多態(tài)性與生長和屠宰性狀的關(guān)聯(lián)分析
  本實(shí)驗(yàn)以高郵鴨群體為研究對象,采用PCR擴(kuò)增、測序法等方法測定了267個樣VLDLR基

3、因5'端UTR及信號肽編碼區(qū)部分序列,在該段序列中檢測出4個SNPs(g.151G>A、g.170C>T、g.206A>G、g.278-295+>-),基于這4個SNPs位點(diǎn),采用PHASE2.0軟件構(gòu)建了8種單倍型,其中ACG+為主要單倍型,頻率高達(dá)29.81%; GTG+和ACA+單倍型頻率最低,均為0.96%。另外,在8個單倍型的基礎(chǔ)上構(gòu)建了15種雙倍型,其中H4H8頻率最高,為28.16%。關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明,在第6周齡,雙倍型H

4、1H1的體重顯著高于H2H8型(P<0.05),在7至10周齡,雙倍型H1H1的體重極顯著高于H2H8型(P<0.01),顯著高于H4H8型(P<0.05)。與此同時(shí),雙倍型H5H8的腹脂率極顯著高于H1H1型和H2H8型(P<0.01),顯著高于H4H8型(P<0.05),雙倍型H4H8的腹脂率顯著高于H1H1型(P<0.05)。最小二乘法分析結(jié)果表明,雙倍型H1H1的平均體重最高,H2H8最低;雙倍型H2H8的屠宰率、半凈膛率和全凈

5、膛率最高;雙倍型H5H8的腹脂率最高,H4H8型次之,H1H1型最低。表明雙倍型H1H1為優(yōu)勢組合,有可能用來作為提高高郵鴨胴體性能和選擇高瘦肉率優(yōu)良品種的分子標(biāo)記。
  2家禽VLDLR基因mRNA在不同組織中的表達(dá)分析
  為研究VLDLR在腫瘤發(fā)生中的表達(dá)變化,本實(shí)驗(yàn)首先對VLDLR基因在鴨和雞不同組織內(nèi)的表達(dá)水平和分布情況進(jìn)行探討。
  快速采集高郵鴨和成年海蘭白雞骨骼肌、肺臟、脂肪、脾臟、肝臟5種組織提取RN

6、A,反轉(zhuǎn)錄成cDNA保存于-20℃?zhèn)溆?。根?jù)GenBank中的鴨和雞VLDLR基因序列設(shè)計(jì)引物并進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,檢測5種組織中VLDLR基因的相對表達(dá)水平。結(jié)果顯示VLDLR基因在鴨和雞不同組織間的表達(dá)存在差異,均表現(xiàn)為骨骼肌表達(dá)量最高,肺臟和脂肪組織次之,肝臟表達(dá)量最低。鴨的5種組織相對表達(dá)量表現(xiàn)為為骨骼肌(57.47±0.10)>肺臟(11.72±0.28)>脂肪組織(4.13±0.05)>脾臟(1.76±0.14)>肝臟(1

7、.00±0.15);雞表現(xiàn)為骨骼?。?0.95±0.14)>肺臟(3.87±0.23)>脂肪組織(3.02±0.11)>脾臟(2.31±0.08)>肝臟(1.00±0.17)。二者相同,脾臟、肺臟、骨骼肌和脂肪內(nèi)VLDLRmRNA的表達(dá)均極顯著高于肝臟(P<0.01),肺臟內(nèi)VLDLR mRNA的表達(dá)高于脂肪,二者差異極顯著(P<0.01)。本實(shí)驗(yàn)顯示了VLDLR基因在肺臟有較高的表達(dá)量,脾臟也有一定的表達(dá)。
  3 MDV對雞V

8、LDLR mRNA表達(dá)的影響
  本實(shí)驗(yàn)研究對象為自然條件下感染MDV雞、MDV RB1B毒株攻毒雞和禽霍亂(PM)雞。采集3種雞肝臟、脾臟、肺臟、骨骼肌、脂肪等組織提取RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA于-20℃保存?zhèn)溆?。根?jù)GenBank中的雞VLDLR基因序列設(shè)計(jì)引物并進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,檢測雞VLDLRmRNA在5個組織中的相對表達(dá)水平。結(jié)果顯示VLDLR基因在3種雞不同組織間的相對表達(dá)存在差異。在感染MDV雞不同組織內(nèi)的相對表達(dá)

9、情況為骨骼肌(7.88±0.095)>肝臟(1.00±0.041)>肺(0.649±0.027)>脂肪(0.168±0.053)>脾臟(0.05±0.021),脾臟、肺臟和脂肪組織內(nèi)VLDLRmRNA的表達(dá)量均極顯著低于肝臟的表達(dá)量(P<0.01),同時(shí)VLDLR在肺臟的表達(dá)量比脂肪組織高,表現(xiàn)為差異極顯著(P<0.01)。在攻毒MDV RB1B毒株雞不同組織的相對表達(dá)情況為骨骼肌(30.18±0.074)>脂肪(5.13±0.061)

10、>肺(2.99±0.178)>肝臟(1.00±0.390)>脾臟(0.41±0.117),脾臟內(nèi)VLDLRmRNA的表達(dá)量低于肝臟,旦兩者差異不顯著,肺臟、骨骼肌和脂肪組織內(nèi)VLDLR表達(dá)量均顯著高于肝臟(P<0.01),脂肪內(nèi)VLDLR mRNA的表達(dá)高于肺,二者差異極顯著(P<0.01)。在PM雞不同組織的相對表達(dá)情況為骨骼肌(84.83±0.183)>肺(13.17±0.307)>脂肪(2.72±0.050)>脾臟(1.17±0.

11、214)>肝臟(1.00±0.343),脾臟的表達(dá)量略高于肝臟,二者差異不顯著,肺臟、骨骼肌和脂肪內(nèi)VLDLR mRNA的表達(dá)極顯著高于肝臟(P<0.01),肺臟內(nèi)VLDLR mRNA的表達(dá)高于脂肪,二者差異極顯著(P<0.01)。結(jié)果顯示,MDV感染雞肝臟(發(fā)生腫瘤的肝臟)組織中VLDLR mRNA的表達(dá)超過了脂肪、肺臟等組織,而攻毒MDV RB1B毒株后未發(fā)生MDV感染或被其他疾病感染(如PM)的肝臟內(nèi)VLDLR mRNA的表達(dá)量依

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