NRAMP1基因、維生素D受體基因多態(tài)性與中國藏族結核病的關聯(lián)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、第一部分NRAMP1基因多態(tài)性與中國藏族結核病的關聯(lián)研究 目的:研究自然抗性相關巨噬細胞蛋白1(natural-resistance-associated macrophage protein 1,NRAMPl)基因4種多態(tài)現(xiàn)象與藏族結核病易感性的關系。 方法:選取藏族活動性肺結核患者140例,感染結核菌未發(fā)病的同民族對照139例,用變性高效液相色譜(DHPLC)檢測和聚合酶鏈式反應-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFL

2、P)分析的方法對NRAMP1基因4種多態(tài)性(5′ (GT)<,n>、INT4、D53N、3′UTR)進行基因分型,根據(jù)不同基因型與單倍型對樣本進行分組,最后經統(tǒng)計學處理,研究4種多態(tài)性及其單倍型與肺結核易感性的關系。 結果:病例組中,(GT)<,9>/(GT)<,9>、(GT)<,9>/(GT)<,10>、(GT)<,10>/(GT)<,10>多態(tài)性(GT)<,9>/(GT)<,9>、(GT)<,9>/(GT)<,10>、(GT

3、)<,10>/(GT)<,10>三種基因型分別為63例(45%)、58例(41.4%)、19例(13.6%);而對照組的相應基因型為88例(63.3%)、41例(29.5%)、10例(7.2%),病例組(GT)<,10>/(GT)<,10>基因型頻率明顯高于對照組(p<0.01,OR 2.654,95%可信區(qū)間1.156,6.094)。病例組中INT4多態(tài)性G/G,G/C 2種基因型分別為127例(90.7%)、13例(9.3%);而對

4、照組的相應基因型則為133例(95.7%)、6例(4.3%),兩組的基因型頻率無顯著性差異(p>0.05,OR 2.269,95%可信區(qū)間0.837,6.152)。病例組中3′UTR多態(tài)性TGTG+/+、TGTG/缺失、TGTG缺失/缺失三種基因型分別為84例(60.0%)、50例(35.7%)、6例(4.3%);對照組的相應基因型為101例(72.7%)、36例(25.9%)、2例(1.4%),病例組TGTG+/缺失基因型頻率與對照組

5、比較無顯著性差異(p>0.05,OR 2.027,95%可信區(qū)間1.182,3.476)。病例組中G/G,G/A 2種基因型分別為103例(73.6%)、37例(26.4%);對照組的相應基因型則為118例(84.9%)、21例(15.1%)。病例組G/A基因型頻率顯著高于對照組(p<0.05,OR 2.018, 95%可信區(qū)間1.111,3.668)。 5′(GT)<,n>與INT4 D′為0.859,存在連鎖不平衡;3′UTR與D5

6、43ND′為0.821,存在連鎖不平衡;其余等位基因間未見連鎖不平衡(D′<0.5)。 在病例組, 5′(GT)<,9>/INT4 C、5′ (GT)<,10>/INT4 C、5′(GT)<,9>/INT4 G與5′ (GT)<,10>/INT4 G單倍型頻率分別為0.9%、3.7%、64.8%、30.6%;在對照組,上述單倍型頻率為0%、2.2%、78.1%、19.8%。病例組的5′(GT)<,9>/INT4 G單倍型頻率顯著

7、低于對照(p<0.01,OR 0.51795%可信區(qū)間0.355,0.752)。病例組中,3′UTR TGTG/D543N A、3′UTRTGTG/D543N G、3′UTR TGTG缺失1D543N A、3′UTR TGTG缺失1D543N A單倍型頻率分別為1.2%、76.6%、12.0%、10.1%,在對照組中,上述單倍型頻率為1.2%、84.4%、6.4%、8.0%。病例組3′UTR TGTG/D543N G單倍型頻率較對照顯著

8、降低(p<0.05,OR 0.605,95%可信區(qū)間0.395,0.927),3′UTR TGTG缺失1/D543N A單倍型較對照顯著增加(p<0.05,OR 2.003,95%可信區(qū)間1.098,3.653)。 結論:NRAMP1基因中5′(GT)<,n>、D53N多態(tài)性與肺結核易感性相關,未發(fā)現(xiàn)INT4多態(tài)性、3′UTR與肺結核發(fā)病有關聯(lián)。3′UTR與D543N、5′(GT)<,n>與INT4分別存在連鎖不平衡。5′(GT

9、)<,9>/INT4 G單倍型、3'UTR TGTG/D543N G與肺結核抵抗性有關,3'UTR TGTG缺失1/D543N A單倍型與肺結核敏感性有關。 第二部分維生素D受體基因多態(tài)性與中國藏族結核病的關聯(lián)研究 目的:研究基因維生素D受體基因2種多態(tài)現(xiàn)象與藏族結核病易感性的關系。 方法:選取藏族活動性肺結核患者140例,有分枝桿菌接觸史的同民族健康對照139例,用聚合酶鏈式反應.限制性片段長度多態(tài)性(PCR-

10、RFLP)分析的方法對NRAMP1基因2種多態(tài)性(Fok Ⅰ、taq Ⅰ)進行基因分型,根據(jù)不同基因型與單倍型對樣本分組,經統(tǒng)計學處理,研究2種多態(tài)性與肺結核易感性的關系。 結果:病例組中,F(xiàn)F、Ff與ff 3種基因型分別為60例(42.9%)、56例(40%)、24例(17.1%);而健康對照組的相應基因型為70例(50.4%)、60例(43.2%)、9例(6.5%),病例組fr基因型頻率顯著高于對照(p<0.05,OR 3.

11、111,95%可信區(qū)間1.343,7.207))。病例組中TT、Tt 2種基因型分別為137例(97.9%)、3例(2.1%);而健康對照組的相應基因型則為134例(96.4%)、5例(3.6%)。通過X<'2>檢驗表明,兩組的基因型頻率無顯著性差異(p>0.05,OR 1.704,95%可信區(qū)間0.399,7,272)。Fok Ⅰ與TaqⅠ二位點D′為0.475,不存在連鎖不平衡。 結論:維生素D受體基因中Fok Ⅰ多態(tài)性與肺

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