cDNA芯片在乳腺癌個體化治療中作用的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、乳腺癌輔助化療能夠降低乳腺癌患者的復發(fā)和死亡,但是絕對死亡率的減少僅為10%-12%。目前乳腺癌的治療,臨床醫(yī)師均依據(jù)循證醫(yī)學指南經驗用藥,對于病理類型和分期以及個別乳腺癌相關基因(如:ER、PR、HER-2)相同的乳腺癌患者,均采用相同的化療方案。但是乳腺癌是一種多種分子改變累積的多基因疾病,表現(xiàn)為病人的臨床異質性。因此,接受同樣方案治療卻有著完全不同的預后的乳腺癌患者比比皆是。這就說明了我們目前的主要依靠細胞形態(tài)學進行乳腺癌分類的方

2、法不足夠準確,迫切需要找到一種能夠準確分類,且這種分類可以準確指導化療方案的制定的方法。 基因芯片的高通量、微型化、自動化的特點使其可以同時檢測成千上萬個基因。我們可以利用它來檢測乳腺癌組織基因表達圖譜,發(fā)現(xiàn)差異表達基因,基因表達圖譜的差異為乳腺癌的臨床異質性提供了分子水平上的證據(jù),并可以此對乳腺癌重新分類,且這種分類和患者接受某種化療后的預后相關,從而發(fā)現(xiàn)預測具體患者對于具體化療方案敏感性的基因表達模式。 本研究采用新

3、輔助化療為研究背景。行新輔助化療不僅可以在治療前獲取乳腺癌原發(fā)腫瘤樣本分析其基因表達圖譜,還可以在化療周期間獲取乳腺癌標本以檢測早期基因表達變化,而且,可以通過直接監(jiān)測腫瘤大小變化了解化療療效。新輔助化療后的臨床緩解和病理緩解狀況均和患者的預后相關。接受新輔助化療后那些臨床上腫瘤消退明顯的患者預后要優(yōu)于那些消退不明顯或明顯耐藥的患者,而達到病理完全緩解(pCR)的患者,其無病生存率(DFS)、無遠處疾病生存率(DDFS)和總生存率(OS

4、)都高于其他患者,且差別具有統(tǒng)計學意義。結合臨床腫瘤大小變化及術后病理緩解情況評估化療方案療效,探索基因表達模式同化療療效間的相關性,從而發(fā)現(xiàn)能夠預測療效的基因表達模式。總之,新輔助化療為我們發(fā)現(xiàn)這一預測因子提供了理想的平臺。 本研究就運用了基因芯片技術和新輔助化療為平臺或背景進行研究,期望本研究能為乳腺癌的個體化治療的相關研究提供一些參考。 目的: 利用自制cDNA芯片檢測乳腺癌新輔助化療前后腫瘤基因表達圖譜及

5、其變化,以發(fā)現(xiàn)能夠預測化療療效的基因表達圖譜,指導臨床醫(yī)師制定更合理的乳腺癌化療方案,使患者可以獲得最有效、最經濟的治療。 方法: 所有病人均在接受治療前通過組織學證實為乳腺癌患者,在征得病人同意后對病人行三周期新輔助化療并在化療開始前及化療第二周期前和術后取腫瘤組織凍存?zhèn)湫谢驁D譜分析。 1.搖菌、提取質粒、PCR擴增,獲得腫瘤相關基因PCR產物,經純化后點至玻片上,制備成包含5952個點陣的腫瘤相關基因cDN

6、A芯片。 2.提取凍存乳腺癌組織與正常乳腺組織總RNA,經反轉錄并標記為cDNA探針,與cDNA芯片雜交,經Scanarray4000芯片掃描儀掃描圖象,應用Quantarray3.0軟件分析,得到基因表達的數(shù)據(jù)資料。應用半定量RT-PCR方法對cDNA芯片檢測的某些差異表達基因的表達狀況進行驗證。 結果: 1.經實驗證實,自行制備的腫瘤相關基因cDNA芯片,掃描圖象信號清晰,背景信噪低,重復性好,結果理想。

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