![](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/8/f30dc08f-14fe-4baa-ba66-af720cedba55/f30dc08f-14fe-4baa-ba66-af720cedba55pic.jpg)
![基于花椒轉錄組序列的SSR分子標記開發(fā)及種質資源鑒定.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/8/f30dc08f-14fe-4baa-ba66-af720cedba55/f30dc08f-14fe-4baa-ba66-af720cedba551.gif)
版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內容提供方,若內容存在侵權,請進行舉報或認領
文檔簡介
1、花椒(Zanthoxylum bungeanum Maxim)為蕓香科花椒屬植物,有較高的藥用、食用和生態(tài)價值;花椒在我國栽培歷史悠久,品種資源繁多,且栽培范圍廣泛,但由于在引種栽培過程中,同名異種、同種異名的現(xiàn)象比較嚴重,不利于花椒種質資源的鑒定、引種工作。本文以12個有地域代表的花椒種質為試驗材料,開展了花椒EST-SSR功能性標記的開發(fā),并對12份花椒種質資源進行了鑒定,豐富花椒在分子標記方面類型,為花椒種質資源鑒定提供依據(jù)。
2、r> 主要研究結果如下:
1.采用生物信息學分析軟件MISA對前期測序獲得的45057條Unigene序列進行了SSR位點數(shù)據(jù)挖掘,發(fā)現(xiàn)在全部的非冗余序列中有3315條序列包含SSR位點,共3814個,SSR位點在全部序列中的出現(xiàn)頻率為8.46%,平均分布距離約7.2kb;在檢索出的SSR位點中,三核苷酸是主導重復類型,且三核苷酸重復基元中以GAA/CTT、AGA/TCT重復基元出現(xiàn)頻率最高;在檢索出的不同SSR位點類型中,
3、所有重復基元的重復次數(shù)范圍在4-12次。其中二核苷酸重復次數(shù)范圍6-12次、為最大,六核苷酸重復次數(shù)范圍只有4次、為最小。隨著重復基元重復次數(shù)的增加,二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸重復基元的數(shù)量和重復基元總數(shù)呈明顯下降趨勢。
2.通過引物開發(fā),從64對設計的引物中篩選出了18對EST-SSR多態(tài)性引物。引物多態(tài)性對應的重復基元中,二核苷酸重復類型有1個,三核苷酸重復類型有8個,四核苷酸重復類型有6個,五核苷酸重復類型有
4、1個,六核苷酸重復類型有2個。
3.用所篩選的18對多態(tài)性EST-SSR引物對12份花椒種質進行PCR擴增,共擴增出81條條帶,其中多態(tài)性條帶73條,多態(tài)率為90.12%;經(jīng)計算各花椒種質間遺傳形似系數(shù)范圍為0.5526-0.8947;用UPGMA法進行聚類分析,在相似系數(shù)為0.70處,所有花椒品種分為三類,即項壇花椒為第Ⅰ類,竹葉椒為第Ⅱ類,其他花椒為第Ⅲ類。
4.用所篩選的18對引物對12個花椒種質進行種質資源鑒
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權益所有人同意不得將文件中的內容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內容負責。
- 6. 下載文件中如有侵權或不適當內容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 基于SSR分子標記技術鑒定甜菜種質資源.pdf
- 基于SSR分子標記的葡萄種質資源遺傳多樣性分析及品種鑒定.pdf
- 滸苔的線粒體、葉綠體基因組研究及基于轉錄組數(shù)據(jù)的SSR分子標記開發(fā).pdf
- 基于轉錄組測序枇杷EST-SSR標記的開發(fā)與利用.pdf
- 基于轉錄組測序的石磺科貝類SSR和SNP兩種分子標記的開發(fā).pdf
- 椰子SSR分子標記的開發(fā).pdf
- 基于轉錄組信息的玫瑰SSR標記開發(fā)及野生玫瑰遺傳多樣性分析.pdf
- 杏種質資源親緣關系及分類地位的ISSR和SSR分子標記研究.pdf
- 基于甜菜序列信息的SSR分子標記開發(fā)與應用研究.pdf
- 番茄果實光滑基因F的分子標記篩選及種質資源鑒定.pdf
- 黃瓜線粒體SSR分子標記的開發(fā)及應用.pdf
- 菠蘿SSR分子標記的開發(fā)及初步應用.pdf
- 小濱麥種質系的鑒定及其抗條銹病基因的SSR分子標記.pdf
- SSR分子標記在高粱屬品種鑒定及種質資源遺傳多樣性分析中的應用研究.pdf
- 煙草種質資源形態(tài)學標記與SSR分子標記遺傳多樣性研究.pdf
- 基于SSR標記構建白蠟種質資源分子身份證及其遺傳多樣性分析.pdf
- 大豆疫霉分子檢測及SSR標記的開發(fā).pdf
- 利用SSR分子標記鑒定荷花雜交子代.pdf
- 耐熱水稻種質資源的篩選及SSR標記分析.pdf
- 蠶豆種質資源遺傳多樣性分析及分子標記開發(fā).pdf
評論
0/150
提交評論