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1、中期因子(midkine,MK)是一個(gè)由121個(gè)氨基酸組成的分子量約為1.kDa的堿性蛋白質(zhì),屬于肝素結(jié)合生長(zhǎng)因子家族,其在人胚胎的肝、腎和腦部組織中高表達(dá),但在健康成人體內(nèi)表達(dá)量卻很低,然而在腫瘤患者體內(nèi)表達(dá)量又會(huì)顯著地升高。研究發(fā)現(xiàn)MK在很多方面顯示與腫瘤發(fā)生有關(guān)的活性,包括促細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)化、血纖蛋白溶解、血管新生和抗細(xì)胞調(diào)亡等,但對(duì)其發(fā)揮一系列生物學(xué)功能的機(jī)理卻并不明了。基于蛋白質(zhì)相互作用在生命活動(dòng)的重要性,本碩士學(xué)位論文利用酵母
2、雙雜交技術(shù)篩選MK的相互作用蛋白質(zhì),為深入研究MK參與的分子途徑、闡明其發(fā)揮功能的分子機(jī)理打下基礎(chǔ)。
我們首先將MK全長(zhǎng)基因克隆至Invitrogen公司ProQuest酵母雙雜交系統(tǒng)的誘餌載體pDBLeu中,構(gòu)建成功的pDBLeu-MK轉(zhuǎn)化酵母細(xì)胞MaV203,對(duì)該雙雜交系統(tǒng)的兩個(gè)報(bào)告基因lacZ和URA3分別進(jìn)行檢驗(yàn)后確定MK無(wú)自身轉(zhuǎn)錄激活能力。在此基礎(chǔ)上,通過(guò)小規(guī)模篩庫(kù),確定在大規(guī)模篩庫(kù)中使用2.mM的3AT濃度以及
3、1.μgcDNA文庫(kù)量較為合適。在大規(guī)模篩庫(kù)后,我們從2×106數(shù)量的轉(zhuǎn)化子中篩選得到51個(gè)可能的陽(yáng)性克隆。經(jīng)過(guò)X-gal方法的檢驗(yàn),確定其中30個(gè)克隆呈陽(yáng)性。抽提得到酵母陽(yáng)性克隆的質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,用氨芐青霉素篩選獲得文庫(kù)質(zhì)粒,測(cè)序并將結(jié)果在GenBank中進(jìn)行BLAST序列比對(duì),共得到6個(gè)不同的蛋白質(zhì)。最后將篩選獲得的文庫(kù)質(zhì)粒分別與pDBLeu和pDBLeu-MK共轉(zhuǎn)化酵母進(jìn)行自身活性鑒定及活性再鑒定,并最終確定5個(gè)候選蛋
4、白,它們分別為Dvl-bindin.protei.nake.cuticle2(NKD2)、磷脂混雜酶1(phospholipi.scramblas.1,PLSCR1)、顆粒蛋白前體(progranulin,PGRN)和潛活TGF-β結(jié)合蛋白3,4(laten.transformin.growt.factorbet.bindin.protei.3an.4,LTBP-3.-4)。
由于酵母雙雜交技術(shù)本身的缺陷,所得到的相互作用
5、蛋白質(zhì)還需通過(guò)pulldown、FRET、co-IP等方法進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證。因此在本論文的第二部分,我們采用了i.vitropulldown的方法來(lái)初步驗(yàn)證篩選獲得的相互作用的真實(shí)性。首先我們將各個(gè)蛋白的全長(zhǎng)基因克隆到體外表達(dá)載體pCMVTnT中,然后在Promega公司的TNT快速轉(zhuǎn)錄/翻譯耦聯(lián)系統(tǒng)中分別表達(dá)35[S]-甲硫氨酸標(biāo)記的蛋白。將表達(dá)產(chǎn)物分別與原核表達(dá)純化的His-MK共孵育,利用特異性結(jié)合His標(biāo)簽的鎳珠將孵育后的復(fù)合物沉
6、淀下來(lái),并通過(guò)SDS-PAGE分離復(fù)合物,最后放射自顯影檢測(cè)35[S]-甲硫氨酸標(biāo)記的蛋白是否被His-MK共沉淀下來(lái),從而確定它們是否與MK發(fā)生相互作用。目前為止,我們利用此方法驗(yàn)證了NKD2、PLSCR1、PGRN與MK能在體外發(fā)生直接的相互作用。
在本研究中所篩選到的MK相互作用蛋白質(zhì)有細(xì)胞外基質(zhì)組分,也有胞內(nèi)重要的信號(hào)分子,暗示中期因子可能參與的生物學(xué)過(guò)程的多樣性以及它在其中發(fā)揮作用的機(jī)制的復(fù)雜性。研究結(jié)果不僅為闡
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