蝦夷馬糞海膽抗菌肽的功能研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、抗菌肽(antibacterial peptides)是一類普遍存在于真核生物體內(nèi),抗菌譜廣泛,不易產(chǎn)生耐藥性的小分子多肽,對生物體的免疫具有調(diào)控作用,是天然免疫的重要組成成分,其作為傳統(tǒng)抗生素的替代品,具有較高的研發(fā)價值。以往對抗菌肽的研究多集中于哺乳動物,對只具有天然免疫的無脊椎動物的抗菌肽研究則較少,本研究以蝦夷馬糞海膽為研究對象,展開如下研究:首先從實驗室已有的蝦夷馬糞海膽(Strongylocentrotus intermed

2、ius)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中篩選出了抗菌肽基因SiStrongylocin1和SiStrongylocin2的部分片段,用RACE技術(shù)擴(kuò)增獲得SiStrongylocin1和SiStrongylocin2的CDS并借助多種生物信息學(xué)軟件分析其基本序列特征;進(jìn)一步以獲得的抗菌肽基因為模板進(jìn)行RT-qPCR,分析SiStrongylocin1和SiStrongylocin2兩種抗菌肽在蝦夷馬糞海膽不同組織(體腔液、腸、圍口、管足、性腺)和不同發(fā)育期

3、(受精卵、八細(xì)胞、囊胚、原腸、棱柱、兩腕、四腕)的表達(dá)情況,并對抗菌肽基因的表達(dá)情況進(jìn)行比較和探討;最后,選用pGEX-4T-1為表達(dá)載體,通過雙酶切法構(gòu)建重組子pGEX-4T-1-SiStrongylocin1和pGEX-4T-1-SiStrongylocin2并將重組子轉(zhuǎn)入BL21(DE3) pLysS和Transseta兩種表達(dá)感受態(tài)細(xì)胞中,以IPTG做誘導(dǎo)劑誘導(dǎo)融合蛋白表達(dá),對其表達(dá)條件進(jìn)行優(yōu)化以獲得產(chǎn)量較高的重組蛋白,選用96

4、孔板微量二倍稀釋法對重組抗菌肽抑菌效果進(jìn)行檢測,分析其抑菌活性。主要實驗結(jié)果如下:SiStrongylocin1編碼區(qū)為252bp,編碼83個氨基酸,SiStrongylocin2編碼區(qū)為249bp,編碼82個氨基酸,編碼區(qū)均由信號肽、前序列和成熟肽三部分組成,氨基酸序列中均含有6個高度保守的半胱氨酸殘基,經(jīng)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測發(fā)現(xiàn) SiStrongylocin1含三個α螺旋,SiStrongylocin2含2有兩個簡單的α螺旋和一個β折疊,在

5、進(jìn)化上蝦夷馬糞海膽的抗菌肽與綠海膽(Strongylocentrotus droebachiensis)和紫海膽(Strongylocentrotus purpuratus)的抗菌肽相近;抗菌肽在不同組織和不同發(fā)育期均有表達(dá),在不同組織中 SiStrongylocin1和SiStrongylocin2分別在腸道和體腔液中表達(dá)量最高,在不同發(fā)育期,SiStrongylocin1和SiStrongylocin2均在囊胚期表達(dá)量最高;通過SD

6、S-PAGE凝膠電泳檢測發(fā)現(xiàn)重組蛋白以包涵體形式表達(dá),以IPTG為誘導(dǎo)劑的最佳表達(dá)條件為28℃,200rpm,IPTG1mM,誘導(dǎo)8h;對獲得的重組蛋白進(jìn)行抑菌活性驗證發(fā)現(xiàn)SiStrongylocin2對兩種菌的抑制效果比SiStrongylocin1更顯著,且兩種重組抗菌肽對大腸桿菌的抑制效果比強(qiáng)壯弧菌更顯著。
  綜上所述,本研究獲得了蝦夷馬糞海膽兩個抗菌肽基因并發(fā)現(xiàn)其具有抗菌肽的一般特征,驗證了抗菌肽基因的表達(dá)水平與不同組織

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