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![煙草全基因組赤星病抗性位點發(fā)掘.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/8/6c734894-186f-4cf2-bc4c-8d870beb950b/6c734894-186f-4cf2-bc4c-8d870beb950b1.gif)
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文檔簡介
1、煙草是我國重要的經濟作物之一,以煙葉為主要經濟器官,優(yōu)質煙葉是卷煙生產的原料保證。赤星病是煙草的一種葉部病害,主要發(fā)生在成熟期。赤星病的發(fā)生除降低煙葉外觀質量,影響煙葉化學成分含量,造成煙農的經濟損失。目前,實際生產中已有多種措施來防治煙草赤星病,如化學農藥防治、栽培措施防治、生物防治和培育抗病品種等,毫無疑問,培育抗病品種是防治煙草赤星病的根本途徑。因此,研究煙草赤星病抗性遺傳規(guī)律,發(fā)掘主效QTL,開發(fā)可用分子標記,能為分子輔助改良赤
2、星病抗性奠定理論基礎。
本研究以NC82×凈葉黃的F2、 F23群體為連鎖分析群體,利用SNP芯片技術鑒定基因型,在全基因組范圍內發(fā)掘赤星病抗性QTL,分析不同QTL的遺傳效應,確定在不同環(huán)境下穩(wěn)定表達的主效QTL;以219份烤煙種質組成的自然群體為關聯(lián)分析群體,研究主效QTL在不同種質中的分布,開發(fā)與赤星病抗性QTL緊密連鎖的標記。研究結果如下:
1.利用煙草SNP芯片技術,分析了以凈葉黃與NC82為親本的186份
3、F23群體的基因型,總共檢測到44.3萬個SNP位點。其中在凈葉黃與NC82之間可以檢測到多態(tài)性的SNP位點36692個,約占全部SNP位點的8.27%。對SNP標記進行卡方檢驗,在P<0.01水平下,去除偏分離標記,共剩余7482個SNP標記;在P<0.05水平下,去除偏分離標記,剩余2462個標記,用于構建遺傳圖譜。
2.根據(jù)SNP標記在F23群體間的基因分型信息,構建連鎖群,最終共構建30條連鎖群,其中1號、5號、8號、
4、11號、12號和15號染色體各包括兩個連鎖群,其余18條染色體上各有一個連鎖群。該遺傳圖譜覆蓋煙草基因組的24條染色體,遺傳距離共4493.17cM,共2312個SNP標記,平均每條連鎖群上有77.1個SNP標記,平均每1.94cM就有一個SNP標記。
3.結合病情數(shù)據(jù),進行抗赤星病QTL分析,共檢測到16個抗赤星病相關QTL,分布于12條連鎖群上。連鎖群chr24上172cM左右存在一個主效抗性QTL,該QTL在不同群體和不
5、同環(huán)境下均被檢測到,平均LOD值分別為7.37,可以解釋的表型變異平均為15.07%;連鎖群chr18上存在一個主效QTL,平均可以解釋9.41%的表型變異;其余連鎖群上的QTL對赤星病抗性起微效作用。
4.為驗證定位到的主效QTL,在chr24上172cM附近開發(fā)indel標記,利用關聯(lián)分析的方法,進一步將主效QTL定位到indel50-indel62之間,區(qū)間對應物理距離5.34Mb,總共有49個候選基因,其中多個與抗病性
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