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文檔簡介
1、茶樹是我國重要的經(jīng)濟作物之一。近年來,已育成許多具有優(yōu)異性狀的茶樹品種。一方面,這些品種大多采用系統(tǒng)選種和雜交育種的方法選育而成,骨干親本類似,親緣關(guān)系比較接近,使品種的遺傳背景較窄。如果能從分子水平上揭示這些品種之間的親緣關(guān)系和遺傳結(jié)構(gòu),將為雜交育種時親本的選擇提供一定的科學(xué)指導(dǎo)。另一方面,隨著,新培育出的優(yōu)良品種越來越多,對茶樹品種的鑒別提出了更高的要求。SSR(Simple sequence repeat,簡單重復(fù)序列)分子指紋圖
2、譜鑒定技術(shù)具有簡便、迅速不受環(huán)境條件影響等優(yōu)點,非常適合品種鑒定。本研究以254個優(yōu)良茶樹品種為材料,從前期構(gòu)建的遺傳連鎖圖譜上選出185個SSR標(biāo)記,分析了我國茶樹品種的遺傳多樣性水平,并通過篩選出的核心引物,構(gòu)建了較全面的茶樹品種分子指紋圖譜。主要研究結(jié)果如下:
1.從185個SSR標(biāo)記中初步篩選出了128個擴增條帶清晰、穩(wěn)定的SSR標(biāo)記。不同連鎖群上的SSR標(biāo)記檢測到的平均等位基因數(shù)、基因型個數(shù)、多態(tài)性息含量均有較大差異
3、。根據(jù)引物擴增條帶易統(tǒng)計程度,PIC(Polymorphism information content,多態(tài)性息含量)和基因型個數(shù),篩選了2套均勻分布于15連鎖群上的30對核心引物。理論上任意兩個品種可能混淆的概率為6.0×10-13。同時,通過標(biāo)準(zhǔn)誤的變化,250個茶樹品種遺傳多樣性研究至少需要30對SSR引物。
2.利用128個SSR標(biāo)記分析了我國茶樹優(yōu)良品種的遺傳多樣性水平,在254個茶樹品種中共檢測到629個等位變異,
4、平均觀測雜合度HO為0.43,期望雜合度HE為0.54。Shannon信息指數(shù)(I)平均為1.03。PIC平均為0.5,基因多樣性指數(shù)平均為0.54。從地理區(qū)域來看,云南、廣東、重慶的品種基因多樣性水平較高,達(dá)到0.5以上;臺灣的品種遺傳多樣性水平最低,只有0.29。從不同時期分析,2000s育成品種的基因多樣性水平最高,達(dá)到0.54,其次是1990s,2010s,1980s最低。比較不同年代間平均遺傳距離的變化,發(fā)現(xiàn)1980s品種遺傳
5、距離為0.30,1990s上升到0.32,此后呈下降的趨勢?;谶z傳距離的N-J(Neighbor-joining)聚類將茶樹品種分為3個大類群,基于Structure數(shù)學(xué)模型的算法則將所有材料分為5個亞群。
3.應(yīng)用毛細(xì)管電泳(Capillary electrophoresis,CE)熒光標(biāo)記檢測分析手段與聚丙烯酰胺凝膠電泳(Polyacrylamide gel electrophoresis, PAGE)銀染檢測技術(shù),選用
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