雜交群體中基因組選擇應(yīng)用效果研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、隨著芯片技術(shù)和計算機技術(shù)的發(fā)展,覆蓋全基因組單核苷酸多態(tài)性(SNP)標記數(shù)據(jù)被大量的獲得,這些遺傳標記與數(shù)量性狀位點(QTL)形成連鎖不平衡(LD),利用SNP信息進行育種值估計的基因組選擇也應(yīng)運而生?;蚪M選擇具有準確性高、可縮短世代間隔、降低近交系數(shù)上升速度、加速遺傳進展以及能進行早期選種等優(yōu)點?;蚪M選擇方法分為最佳線性無偏預(yù)測(BLUP)類方法和Bayes類,基因組選擇模型有基因組選擇單性狀模型和多性狀模型。目前,基因組選擇在動

2、物育種應(yīng)用中,多數(shù)應(yīng)用在純種群體上,而且基本上使用的是基因組選擇單性狀模型,在雜交群體中的應(yīng)用較少,尤其是關(guān)于基因組選擇多性狀模型在雜交群體應(yīng)用的報道更加少。
  本研究將傳統(tǒng)BLUP方法以及基因組選擇GBLUP(genomic best linear unbiased prediction)、BLUP|GA(genomic best linear unbiasedprediction with genetic architect

3、ure)的單性狀模型和多性狀模型在杏花雞與隱性白羽洛克雞雜交F2代群的14個生長性狀運用,旨在研究基因組選擇在雜交群體中的準確性,以及進行早期選種的效果,探討基因組選擇的評價方法。按照設(shè)計的方案進行育種值估計,得到估計育種值(EBV)和GEBV(GEBV),再進行統(tǒng)計分析得到的如下結(jié)論:
 ?。?)傳統(tǒng)BLUP方法和基因組選擇GBLUP方法、BLUP|GA方法在雞雜交群體生長性狀中運用的平均準確性分別是為0.429、0.514和0

4、.522,平均無偏系數(shù)分別為1.016、1.027、0.913,準確性最好的是BLUP|GA,無偏性最好的是BLUP。
 ?。?)不同留種率下,根據(jù) EBV或 GEBV排名,基因組選擇 GBLUP方法與BLUP|GA方法選留個體的共同比例比傳統(tǒng)BLUP方法與GBLUP方法選留個體共同比例、傳統(tǒng)BLUP方法與BLUP|GA方法選留個體共同比例高,選留個體的表型平均值都高于全群表型均值,基因組選擇方法選留個體的表型均值選留高于傳統(tǒng)BL

5、UP方法選留個體的表型均值。
 ?。?)雞雜交群體生長性狀的基因組選擇多性狀模型與基因組選擇單性狀模型相比,GBLUP多性狀模型的準確性比GBLUP單性狀模型高0.068,BLUP|GA多性狀模型的準確性比BLUP|GA單性狀模型高0.133。
 ?。?)基因組選擇可以在雞雜交群體中進行早期選種,基因組選擇單性狀模型在留種率較少的情況下具有明顯的優(yōu)勢;基因組選擇多性狀模型中,GBLUP多性狀模型在77日齡時,對90日齡目標體

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