銅綠假單胞菌生物膜形成相關(guān)的蛋白質(zhì)組學(xué)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:找出銅綠假單胞菌野生型PA01與黏液型PD0300菌株、PA01lasI rhlI基因缺陷型菌株、PA01 lasR rhlR基因缺陷型菌株之間的差異蛋白質(zhì),探討這些蛋白質(zhì)與銅綠假單胞菌生物膜形成的關(guān)系。 方法: (1)將同一份樣品配制成不同蛋白濃度的標(biāo)本分別上樣檢測,對(duì)檢測所得蛋白質(zhì)圖譜進(jìn)行分析。(2)根據(jù)最佳檢測蛋白濃度,將黏液型PD0300、野生型PA01、PA01 lasIrhlI基因缺陷型和PA01 lasR r

2、hlR基因缺陷型菌株的菌體蛋白分別采用CM10、IMAC3-Cu這兩種蛋白質(zhì)芯片,運(yùn)用SELDI技術(shù)進(jìn)行測定,篩選最佳蛋白質(zhì)芯片。(3)利用SELDI技術(shù)對(duì)黏液型PD0300、野生型PA01、PA01 lasIrhlI基因缺陷型和PA01 lasR rhlR基因缺陷型菌株的菌體蛋白分別進(jìn)行檢測,并采用Biomarker Wizard軟件進(jìn)行分析。 結(jié)果:(1)檢測蛋白濃度為1.5gg/μl時(shí),進(jìn)行SELDI檢測可發(fā)現(xiàn)較多的蛋白峰

3、。(2)同樣檢測蛋白濃度時(shí),CM10芯片捕獲的蛋白峰數(shù)量比IMAC3-Cu芯片多。(3)銅綠假單胞菌野生型PA01與黏液型PD0300菌株的菌體蛋白比較,有16個(gè)蛋白峰存在差異(P<0.01)。與野生型PA01菌株相比,PD0300菌株中有10個(gè)蛋白質(zhì)高表達(dá),分子量分別為4,074Da、3,817Da、8,923Da、8,148Da、3,332Da、4,521Da、7,621Da、11,594Da、7,83iDa和13,75IDa;有6

4、個(gè)蛋白質(zhì)低表達(dá),分子量分別為6,199Da、6,899Da、12,379Da、6,11 5Da、6,763Da和8,576Da。(4)銅綠假單胞菌PA01 lasI rhlI基因缺陷型與野生型PA01菌株相比有1個(gè)蛋白質(zhì)低表達(dá)(P<0.05),分子量為6,910Da。(5)銅綠假單胞菌PA01 lasR rhlR基因缺陷型與野生型PA01菌株之間有4個(gè)蛋白峰存在差異(P<0.05)。在PA01 lasR rhlR基因缺陷型菌株中有2個(gè)蛋

5、白質(zhì)高表達(dá),分子量分別為8,924Da和8,790Da;有2個(gè)蛋白質(zhì)低表達(dá),分子量分別為6,735Da和6,986Da。 結(jié)論: (1)運(yùn)用SELDI技術(shù)對(duì)細(xì)菌菌體蛋白進(jìn)行分析的最佳檢測蛋白濃度為1.5μg/μl。 (2)與IMAC3-Cu芯片相比,CM10芯片更適于細(xì)菌菌體蛋白質(zhì)組學(xué)的研究。 (3)銅綠假單胞菌野生型PA01與黏液型PD0300的菌體蛋白有16個(gè)蛋白質(zhì)表達(dá)明顯不同,這些差異蛋白可能與銅綠

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