Dicer調(diào)控膽管癌細胞SFRP1基因啟動子甲基化的機制及效應(yīng)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:研究Dicer對人膽管癌細胞HuCCT1中SFRP1基因啟動子CpG島甲基化的影響,并初步探討其機制和生物學(xué)效應(yīng)。
  方法:設(shè)計、合成Dicer基因特異性siRNA和saRNA,采用慢病毒載體建立穩(wěn)定細胞株。MSP與BSP實驗分別定性和定量檢測SFRP1啟動子CpG島甲基化狀態(tài);啟動子裁截實驗檢測 SFRP1啟動子的驅(qū)動活性;HumanMethylation450K甲基化芯片分析全基因組及特異位點 CpG島甲基化變化;Ch

2、IP實驗檢測 Dicer對HP1α與H3K9me3在SFRP1啟動子區(qū)富集程度的影響;CCK-8法、劃痕實驗和Transwell實驗分別檢測細胞增殖、遷移和侵襲能力,裸鼠皮下移植瘤實驗檢測細胞體內(nèi)成瘤能力。
  結(jié)果:
  1.成功篩選出Dicer特異性siRNA和saRNA序列并建立了穩(wěn)定細胞株,慢病毒感染效率超過90%;western blot實驗表明saR-Dicer組Dicer蛋白表達增加了2.33倍,而siR-Di

3、cer組Dicer蛋白表達降低了1.56倍,灰度分析顯示Dicer蛋白表達量與對照組比較,saR-Dicer組與 siR-Dicer組的相對表達量分別為3.33±0.27、0.39±0.05,P<0.01;Real time PCR結(jié)果顯示,saR-Dicer組與siR-Dicer組的Dicer mRNA相對表達水平分別為3.96±0.18,0.25±0.05,分別增加了2.96倍和降低了3倍,P<0.01。
  2.在膽管癌細胞

4、株中,MSP實驗表明SFRP1基因啟動子呈高甲基化狀態(tài);構(gòu)建了含CpG島和不含CpG島的SFRP1啟動子裁截雙熒光素酶報告基因質(zhì)粒(分別命名為 SFRP1-CpG-Luc和 SFRP1-null-Luc),甲基化處理后含有CpG島的啟動子熒光活性下降27.56倍,P<0.01,而不含CpG島的啟動子在甲基化處理后熒光活性變化不明顯。
  3. HumanMethylation450K甲基化芯片結(jié)果顯示,siR-Dicer組和 sa

5、R-Dicer組細胞全基因組甲基化水平?jīng)]有明顯改變,但siR-Dicer組多個腫瘤相關(guān)基因(包括SFRP1)的啟動子CpG位點發(fā)生了新的變化。
  4.亞硫酸氫鹽測序(BSP)結(jié)果表明,與對照組比較,siR-Dicer組SFRP1啟動子區(qū) CpG位點甲基化水平進一步增加,且有新的CpG位點發(fā)生了新的甲基化;而saR-Dicer組的CpG位點發(fā)生了部分去甲基化。
  5.染色質(zhì)免疫共沉淀實驗(ChIP)顯示siR-Dicer組

6、HP1α和H3K9me3蛋白在SFRP1啟動子區(qū)的富集水平顯著升高,而增強Dicer表達后變化不明顯,P>0.05。
  6.與空白對照組、陰性對照組比較,siR-Dicer組細胞的增殖能力在感染48h后明顯增強,而saR-Dicer組細胞的增殖能力降低,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義;劃痕實驗結(jié)果顯示空白對照組、陰性對照組、siR-Dicer組和saR-Dicer組在48h后的劃痕愈合度分別是:0.35±0.03,0.47±0.68,0.0

7、8±0.01,0.75±0.11,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義;Transwell實驗表明空白對照組、陰性對照組、saR-Dicer組和siR-Dicer組穿膜細胞數(shù)分別為138±6.06,143.5±9.04,70±5.00,227.5±11.15;siR-Dicer組細胞裸鼠體內(nèi)成瘤能力增強,而saR-Dicer組細胞的成瘤能力下降。
  結(jié)論:
  1.在4種膽管癌細胞(HuCCT1、TFK-1、QBC939、CCLP1)中,S

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