乙型肝炎病毒逆轉(zhuǎn)錄酶基因自然序列特征分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:乙型肝炎病毒(HBV)全球慢性感染率約5%,亞洲是高發(fā)區(qū),HBV自身的和宿主免疫反應(yīng)的差異是導(dǎo)致臨床轉(zhuǎn)歸多樣性的主要原因。HBV逆轉(zhuǎn)錄酶(RT)是目前核苷(酸)類抗病毒藥物作用的靶點(diǎn),相關(guān)位點(diǎn)變異能導(dǎo)致抗病毒治療失敗。本研究的目的是通過對(duì)未接受抗病毒治療患者血清中的 RT自然序列特征進(jìn)行分析,建立RT分子流行病學(xué)資料庫,為今后進(jìn)一步縱向研究HBV體內(nèi)分子演變及其感染發(fā)展過程、臨床抗病毒藥物最佳靶位點(diǎn)選擇、以及HBV耐藥性的防治奠定

2、基礎(chǔ)。 方法:采集2005-2006年度上海、深圳、安徽、無錫、長春等省市共342例未接受核苷類藥物治療的慢性HBV感染者血樣,采用聚合酶鏈反應(yīng)特異性擴(kuò)增HBV RT區(qū)進(jìn)行序列測定,并分析其基因變異、基因型及亞型。采用logistic 回歸分析相關(guān)性,雙側(cè)檢驗(yàn)。根據(jù)遺傳距離建立系統(tǒng)生發(fā)樹。通過序列深層分析獲得RT 自然核苷酸序列和氨基酸序列的保守度和理化等特征。 結(jié)果:在該組慢性HBV感染者中,HBV 基因B型占36.3

3、%(其中88.7%為B2型),C型占63.7%(其中92.2%為C2型),1株D型;南方以B型為主,北方以C型為主。B型感染者平均年齡32.5歲,C型感染者37.3歲,差異有顯著性。HBeAg陽性者年齡小、DNA水平高;HBeAb陽性者年齡大、DNA水平低。與十年前HBV基因庫序列比較分析發(fā)現(xiàn),在未抗病毒治療的自然狀態(tài)下,HBV病毒株的遺傳距離變化與自然變異速率沒有顯著差異。對(duì)RT序列的深層分析結(jié)果顯示:總核苷酸使用率、第二位和第三位密

4、碼子核苷酸使用率,以及二核苷酸使用率存在顯著區(qū)別,T密碼子占優(yōu)勢。不同復(fù)制能力的病毒株之間的權(quán)重矩陣分值(PWMS)有差異。作為優(yōu)勢株,M204V/I/S位點(diǎn)的變異率為1.8%,A181T/V變異率為0.6%,其余耐藥相關(guān)變異位點(diǎn)的總變異率為9.3%;雜合狀態(tài)的位點(diǎn)總變異率為37.7%。 結(jié)論:自然狀態(tài)下存在的RT區(qū)變異可能是導(dǎo)致原發(fā)性或繼發(fā)性治療失敗的原因。上述RT的這些特點(diǎn)可能與其充分利用宿主肝細(xì)胞復(fù)制系統(tǒng)來提高自身的轉(zhuǎn)錄與

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