基于候選基因的肝癌遺傳關(guān)聯(lián)研究及CD82啟動子區(qū)SNPs的功能研究.pdf_第1頁
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1、第三軍醫(yī)大學(xué)博士學(xué)位論文基于候選基因的肝癌遺傳關(guān)聯(lián)研究及CD82啟動子區(qū)SNPs的功能研究姓名:苑曉燕申請學(xué)位級別:博士專業(yè):衛(wèi)生毒理學(xué)指導(dǎo)教師:曹佳20070501第三軍醫(yī)大學(xué)博士學(xué)位論文1關(guān)聯(lián)研究中,研究對象包括434例肝癌患者和480例非癌癥對照,病例采集于廣西壯族自治區(qū)腫瘤醫(yī)院,居住地局限于廣西壯族自治區(qū)扶綏縣及其周邊地區(qū),對照來自于同一地區(qū)的社區(qū)人群,對病例與對照組人群的性別、年齡、居住地等因素進(jìn)行頻數(shù)匹配。2關(guān)聯(lián)研究中,采用

2、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)一限制性酶切片段多態(tài)性(Polymerasechainreaction—restrictionljragmentlengthpolymorphism,PCRRFLP)方法對雌激素受體p(Estrogenreceptorp,ESI也)的4個SNP位點(diǎn)(G1082A、A1730G、rsl256054和T1057G)、雌激素代謝酶的8個SNP位點(diǎn)(CyPJ7尬pAI、C歸J『9唧39Arg、Cy尸J『9I/D、CyP朋J『Msp

3、I、CyP“JIle462Val、C印JBJVal432Leu、CD^仃Ala72Ser和CD^仃Vall58Met)和抗氧化酶的6個SNP位點(diǎn)(C甜勱S∞A1934C、脅s∞A1a16Val、ECS∞Ala40Tllr、E四0D心9213Gly、C4rC一262T和G^JPr0198Leu)進(jìn)行基因分型。采用片斷分析技術(shù)對及CyPJ『9的短串聯(lián)重復(fù)標(biāo)記(TTTA)n進(jìn)行基因分型。3在SNP的功能研究中,采用電泳遷移率實驗(Electr

4、ophoreticmobil時shiRassay,EMSA)檢測了CD舵啟動子區(qū)T262G多態(tài)性位點(diǎn)對轉(zhuǎn)錄因子與DNA結(jié)合的影響。采用雙熒光素酶報告基因瞬時轉(zhuǎn)染H印G2及293細(xì)胞,檢測調(diào)控區(qū)的兩個SNP位點(diǎn)(rs934178和T262G)對1572至493區(qū)段啟動子活性的影響。4在遺傳關(guān)聯(lián)分析中,采用PHASE軟件構(gòu)建單倍型;采用心lequin軟件包計算LD模式的兩個參數(shù)(Lewontin’sD’及,)。采用SPSSl40統(tǒng)計軟件的非

5、條件Logistc回歸模型計算各基因型與肝癌風(fēng)險的相關(guān)性,分析時首先對HBV攜帶狀態(tài)進(jìn)行分層,然后對性別、年齡、吸煙、飲酒等混雜因素進(jìn)行分層,結(jié)果經(jīng)性別、年齡、吸煙、飲酒及吸煙量(年包數(shù),pack—year)等因素校正,對所有統(tǒng)計結(jié)果進(jìn)行Bonfenoni多重檢驗校正。在功能研究中,采用SPSSl40統(tǒng)計軟件的單因素方差分析比較不同轉(zhuǎn)染組熒光素酶相對活性的差異。結(jié)果1在E熾2和雌激素代謝酶基因多態(tài)性與肝癌的遺傳易感性研究中,基因分型結(jié)果

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