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![中國南方廣西地區(qū)葡萄糖-6-磷酸脫氫酶(G6PD)缺乏癥的發(fā)生率及全面分子診斷(附4例新突變).pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/19/13/0622fde8-8f46-49e1-9d0a-73f3cce2dc9c/0622fde8-8f46-49e1-9d0a-73f3cce2dc9c1.gif)
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文檔簡介
1、背景與目的 葡萄糖-6-磷酸脫氫酶缺乏癥(Gluocose-6-phosphate dehydrogenasedeficiency,簡稱G6PD缺乏癥)[MIM305900]是世界上最常見的單基因遺傳病之一,也是我國南方地區(qū)人群中常見的血液遺傳病之一,世界范圍內(nèi)約有4億人受累。G6PD缺乏癥屬X連鎖不完全顯性遺傳,男性半合子G6PD活性呈顯著性缺乏,女性雜合子酶活性變化范圍較大,可呈顯著性降低,也可在正常范圍。G6PD基因定位于
2、xq28,全長約20kb,含13個外顯子和12個內(nèi)含子,編碼515個氨基酸。G6PD缺乏癥的分子基礎多表現(xiàn)為單個堿基置換的錯義突變,導致氨基酸置換,使G6PD活性降低,還未發(fā)現(xiàn)大片段缺失、無義突變和移碼突變。目前全世界已報道了150多種G6PD基因突變型,突變的分布具有種族和地區(qū)異質(zhì)性。迄今為止在東南亞人群中發(fā)現(xiàn)30種G6PD基因突變型,在我國人群中發(fā)現(xiàn)的突變有25種,其中1388G>A、1376G>T和95A>G是最常見的突變,約占總
3、突變的70%以上。由于方法學的限制,我國以往對該病的研究主要是采取基于男性患者的調(diào)查策略(the male patient-based investigation),即以表型陽性的男性樣本鑒定G6PD缺乏癥的發(fā)生率及其基因突變譜,幾乎未涉及該病的基因型和表型關(guān)系分析。廣西是一個有著4.9千萬人口的少數(shù)民族地區(qū),該地區(qū)G6PD缺乏癥的流行病學資料尚不清楚,特別是女性攜帶者和病人的資料幾乎不了解。 本研究采用基于人群的分子分析策略(
4、the population-based molecularanalysis),完成了對該地區(qū)人群的G6PD缺乏癥發(fā)生率、突變譜、表型與基因型關(guān)系和單倍型的分析,以及女性的系統(tǒng)分子鑒定。設計與方法用于本研究的樣本共4,704例(其中男性2,368例,平均年齡29.45±5.06歲;女性2,336例,平均年齡26.52±3.89歲),于2002年10月至2003年10月期間于柳州市婦幼保健院婚檢門診采集,被檢者就診時均無貧血表現(xiàn)。這些樣品
5、98.5%是來自于中國南方地區(qū),其中94.8%的樣本的祖籍地來自廣西壯族自治區(qū)14個不同地區(qū),無血緣關(guān)系。隨機選取的樣本中漢族和壯族人群的比例與廣西全區(qū)二者的比重相同,分別占64.3%(3,027/4,704,漢族)和32.5%(1,528/4,704,壯族),其余149例樣品來自其他少數(shù)民族。正常對照129例,其中男性64例,年齡:23~42,平均年齡29.91±3.29,G6PD/6PGD比值為:1.62~1.79(1.73±0.1
6、1);女性65例,年齡:23~34,平均年齡27.48±2.56,G6PD/6PGD比值為:1.58~1.93(1.65±0.09)。 本研究提出并建立了表型篩查與基因型分析結(jié)合的系統(tǒng)分子鑒定流程:采用傳統(tǒng)的高鐵血紅蛋白還原試驗(methemoglobin reduction test,MetRT,檢測標準為:MetHb%>75%為陰性;MetHb%=75%,為陽性)進行初篩,然后用WHO推薦的G6PD/6PGD比值法(診斷標準
7、為:比值>1.5為陰性;比值=1.5為陽性)進行檢測,接著我們把所有經(jīng)過檢測高鐵血紅蛋白還原試驗為陽性的樣品(或者說經(jīng)過G6PD/6PGD比值法確診為表型陽性的樣品和所有疑似樣品)用標準方法抽提基因組DNA,通過引物延伸/變性高效液相色譜(primerextension/Denaturing High Performance Liquid Chromatographty,PE/DHPLC)技術(shù)進行基因型分析,該技術(shù)能同時檢測10種東南亞
8、地區(qū)常見G6PD基因突變型(95 A>G 392 G>T,487 G>A,493 A>G 592 C>T,871 G>A,1024 C>T,1360 C>T,1376 G>T和1388 G>A)和一種多態(tài)性位點(1311 C>T),最后,為了檢測是否存在新突變或其他突變類型,我們對PE/DHPLC技術(shù)未檢測出的陰性樣本進行G6PD基因12個外顯子和外顯子-內(nèi)含子結(jié)合區(qū)的直接測序。此外,我們從高鐵血紅蛋白還原試驗檢測為陰性的4,263例樣
9、品中隨機選取129例樣品作為正常對照組,用PE/DHPLC技術(shù)檢測其G6PD基因突變的情況,在65例女性樣品中發(fā)現(xiàn)兩例常見突變類型(1376 G>T和1388 G>A),為了驗證這部分女性樣品是否還存在其他G6PD基因突變類型,我們同時對其進行DNA測序。本研究診斷G6PD缺乏癥的標準主要包括:(1)高鐵血紅蛋白還原試驗(MetRT)和G6PD/6PGD比值法檢測為表型陽性;或者(2)用PE/DHPLC技術(shù)或DNA測序進行基因分析檢測出
10、陽性突變。 結(jié)果與討論 本研究共檢測出G6PD缺乏癥陽性樣品361例,其中男性個體176例,因此廣西壯族自治區(qū)G6PD缺乏癥基因頻率為7.43%;女性個體185例,該地區(qū)漢族人群的突變基因頻率(16.38%,249/1,520)與壯族人群(15.39%,117/760)比較無統(tǒng)計學差異(X<'2>=2.368,P>0.05)。我們從上述361例樣品中鑒定出320例個體有陽性基因突變,共27種不同基因型,包括8種半合子、1
11、3種雜合子和6種純合子,此外,還有41例(15例男性和26例女性)表型陽性的樣品未發(fā)現(xiàn)任何突變。我們對G6PD基因突變譜鑒定結(jié)果顯示,1388G>A(G6PD Kaiping),1376G>T(G6PD Canton),95A>G(G6PD Gaohe),1024C>T(Chinese-5)和871G>A(G6PD Viangchan)等5種突變?yōu)樵摰貐^(qū)人群的常見突變,占G6PD缺陷等位基因的85%,另外檢測到10種(392G>T,44
12、2G>A,1004C>T,202G>A,592C>T,519C>T,196T>A,703C>T,202G>A/871G>A和1414A>C)少見突變,約占突變?nèi)旧w的4%。在這些變異中,有6種為中國人首次報道的突變,其中4種為我們研究發(fā)現(xiàn)的新突變,它們是442G>A(G6PD Liuzhou),703C>T(G6PD Nanning),141 4A>C(G6PD Laibin)和202G>A/871G>A(G6PD Hechi);另二種
13、稀有突變,196T>A和202G>A曾分別在泰國和日本人中報告過。此外,我們根據(jù)G6PD/6PGD比值表型指標的變化,將女性三種常見突變(分別為1376G>T,1388G>A和95A>G)雜合子的相同基因型樣品進一步分為陽性組(G6PD/6PGD=1.5)和陰性組(G6PD/6PGD>1.5),兩兩比較這3種相同基因型各自配對的陽性組與陰性組之間的表型差異,結(jié)果顯示MetHb%和G6PD/6PGD比值在三配對資料二組之間均有顯著差異(P
14、=0.000,P<0.05),本研究提示,即使是在相同突變時,女性雜合子的G6PD酶活性存在很大的變異性。根據(jù)Lyon學說,女性的兩個G6PD等位基因,有一個處于失活狀態(tài),即隨著酶缺乏的紅細胞與正常的紅細胞嵌合的差異,女性雜合子具有不同的表現(xiàn)度,這與該病不完全顯性的遺傳方式相吻合。分組比較的統(tǒng)計學分析結(jié)果顯示,表型指標高鐵血紅蛋白還原率(MetHb%)和G6PD/6PGD比值在女性雜合子組(MetHb%:43.22±17.42;G6PD
15、/6PGD:1.33±0.40;n=164)和男性半合子(MetHb%:29.63±15.12;G6PD/6PGD:0.50±0.31;n=176)有顯著差異(P=0.000,P<0.05);女性雜合子組(同上)和純合子組(MetHb%:33.16±6.34;G6PD/6PGD:0.57±0.24;n=21)有顯著差異(P=0.000,P<0.05);而男性半合子組和女性純合子組之間無統(tǒng)計學差異(MetHb%:P=0.272,P>0.0
16、5;G6PD/6PGD:P=0.310,P>0.05);正常對照組(正常參考值為MetHb%:88.10±5.23;G6PD/6PGD:1.70±0.11;n=129,男性64例,女性65例,無性別差異,P=0.121,P>0.05)與上述雜合子、純合子和半合子各組間均有差異(P=0.000,P<0.05)。同時從129例表型“正常”樣品中經(jīng)過測序檢測出3例突變(1376G>T,1388G>A和1414A>C),這提示了包括常見變異在內(nèi)
17、的許多隱性突變體很可能隱藏在“正常”雜合子個體中,而被一般表型篩查所漏檢,只有采用直接分子篩查才可以鑒定這類突變。我們對176例男性G6PD缺陷染色體和6例女性新突變?nèi)旧w的單倍型進行了202A(NlaⅢ),376G(Fok I),1116G(Pst),1311T(Bcl I),內(nèi)含子11-93C(NalⅢ)等5個多態(tài)性位點的分析,結(jié)果表明182個缺陷染色體中的94%為單倍型(——+——),提示常見的nt95A>G,1024C>T,13
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