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![基于SSR和AFLP標(biāo)記的東方百合群體遺傳圖譜構(gòu)建及QTL定位.pdf_第1頁(yè)](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/8/d8db95a4-47f5-4ec1-bc99-cddf7a90d2b0/d8db95a4-47f5-4ec1-bc99-cddf7a90d2b01.gif)
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文檔簡(jiǎn)介
1、百合屬植物是單子葉植物綱百合科的多年生球根花卉,其在全世界范圍內(nèi)分布約有100種(變種),是植物中基因組最大的類群之一。東方百合(Oriental Hybrid lily)是百合中一個(gè)重要的雜種系,不同的百合雜種系群體得到構(gòu)建,如AA(亞洲系百合×亞洲系百合),AL(亞洲系百合×鐵炮百合),OT(東方系百合×喇叭百合)等。在本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建了OO(東方百合×東方百合)作圖群體,
利用將SSR和AFLP兩種分子標(biāo)記法構(gòu)建了百合連鎖群
2、。其中,利用本實(shí)驗(yàn)室開(kāi)發(fā)的495對(duì)SSR引物對(duì)群體進(jìn)行檢測(cè)。試驗(yàn)中最終用于構(gòu)建連鎖圖譜的F1群體為100個(gè)單株。利用JoinMap4軟件的CP模型對(duì)獲得的分子標(biāo)記數(shù)據(jù)進(jìn)行處理分析,構(gòu)建了30個(gè)遺傳連鎖群圖譜,其中?Sorbonne’(母本)和?Gaudi’(父本)各為12個(gè),F(xiàn)1代為6個(gè)。分析觀賞和農(nóng)藝性狀后,用MapQTL4.0軟件定位遺傳連鎖圖譜中的QTL。主要的研究結(jié)果總結(jié)如下:
1.試驗(yàn)對(duì)940對(duì)引物組進(jìn)行了篩選,篩選
3、出172對(duì)合適的引物組合(包括96個(gè)個(gè)AFLP標(biāo)記和76個(gè)SSR標(biāo)記引物)用于構(gòu)建圖譜。最終共標(biāo)記出616個(gè)位點(diǎn),其中AFLP標(biāo)記出465個(gè)位點(diǎn),SSR標(biāo)記出151個(gè)位點(diǎn)。最終獲得616個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),其中AFLP位點(diǎn)465個(gè),SSR位點(diǎn)151個(gè)。為了對(duì)標(biāo)記進(jìn)行分組,對(duì)連鎖值(LOD)進(jìn)行了2到10的梯度設(shè)置。在分組后,利用 LOD為3.0-5.0構(gòu)建了連鎖圖譜。整個(gè)圖譜的長(zhǎng)度為2144.2cM.在遺傳圖譜中共顯示189個(gè)標(biāo)記位點(diǎn),其中A
4、FLP位點(diǎn)142個(gè),SSR位點(diǎn)47個(gè)。
2.母系為12個(gè)連鎖群,全長(zhǎng)為851.6cM。父本最小和最大的連鎖群的遺傳距離分別為2.2cM和55.7cM。父本遺傳連鎖圖譜共有52個(gè)標(biāo)記位點(diǎn),其中AFLP位點(diǎn)42個(gè),SSR位點(diǎn)10個(gè)。在12個(gè)連鎖群的父本遺傳圖譜中,連鎖群全長(zhǎng)為676 cM,標(biāo)記位51個(gè)。結(jié)果表明,全長(zhǎng)中AFLP標(biāo)記位點(diǎn)46個(gè),SSR標(biāo)記位點(diǎn)5個(gè)。在母系圖譜中的最小連鎖群距離為0.1 cM,而最大距離為47.7 cM
5、。在F1代的6個(gè)連鎖群中發(fā)現(xiàn)有86完全評(píng)估位點(diǎn)。結(jié)果還表明,AFLP標(biāo)記數(shù)得分位點(diǎn)為54位點(diǎn),SSR標(biāo)記位點(diǎn)有32個(gè)。F1代的連鎖群總長(zhǎng)度為606.6 cM。F1代最小和最大的連鎖群的距離分別為0.2 cM和26.8 cM。
3.檢測(cè)到控制重要百合性狀的8個(gè)QTL位點(diǎn),每一個(gè)QTL位點(diǎn)可解釋表型變異的2.4%~89.5%。在LG-F1P2上,LOD LOD的最高值的最高值(35.21)下找到了4個(gè)QTL。母系的LG-M10上的
6、兩個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)間定位到一個(gè)有關(guān)葉數(shù)的QTL,其LOD值為7.08。以E-CGC/M-CGC-4為引物,將花被片長(zhǎng)度的QTL定位在F1雜交圖譜的LG-F1P2上?;ū黄瑢挾鹊腝TL與LN相似,定位在母系的LG-M10上。PW2的QTL在父本的LG-F4。在F1、母本和父本圖譜上定位有5個(gè)關(guān)于斑點(diǎn)數(shù)量的QTL,1個(gè)長(zhǎng)度為51cM關(guān)于斑點(diǎn)大小的QTL在母系的LG-M8上,以E-CGC/M-CGC-4為引物在F1的LG-F1P2上定位到株高的QT
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