1、溫州醫(yī)學院碩士學位論文原綠球藻和聚球藻密碼子使用偏好和適應性進化研究姓名：俞通海申請學位級別：碩士專業(yè)：遺傳學指導教師：包其郁20100501溫州醫(yī)學院碩士學位論文大。在原綠球藻中精氨酸(Arg)、亮氨酸(Leu)、纈氨酸(Val)、蘇氨酸(Thr)、絲氨酸(Ser)、脯氨酸(Pro)、異亮氨酸(11e)、甘氨酸(GIy)及谷氨酸(Glu)等氨基酸均偏好使用AGA、UUA、GUU、ACU、CCA、UCA、UCU、AUU、GGU及CAA等

2、密碼子編碼；而在聚球藻中，這些氨基酸則更喜歡使用CGC、CUG、GUG、ACC、CCC、AGC、AUA、GGC以及CAG等密碼子。而且聚球藻偏好使用最優(yōu)密碼子，而原綠球藻則更使用的較少。2通過對兩類藍藻密碼子使用影響因素的分析，我們發(fā)現(xiàn)導致兩類藍藻密碼子使用方式不同的原因并不一致。原綠球藻主要由于基因組組成和突變的作用，而聚球藻則更多是受選擇作用的影響。3通過比較基因組學分析，我們發(fā)現(xiàn)兩類藍藻的進化速率并不一致，聚球藻進化速率明顯快于原

3、綠球藻。而且聚球藻中有66個基因檢測到了正選擇信號，而在原綠球藻中只發(fā)現(xiàn)了63個。結論：本研究中我們通過比較基岡組學方法首次系統(tǒng)而深入的對兩類海洋單細胞藍藻進行密碼子偏好使用分析和進化機制及適應性進化研究，發(fā)現(xiàn)盡管他們親緣關系非常相近，但是他們的密碼子使用方式差異非常大，而且導致他們密碼子使用方式不同的原因也各不相同，原綠球藻密碼子使用主要受基因組組成限制和突變作用，而聚球藻則受選擇作用更大。同時，對進化速率的分析，我們發(fā)現(xiàn)兩類藻在進化