ITS,rbcL和matK序列作為中藥雞骨草條形碼的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:對不同來源的雞骨草及其習用品毛雞骨草的ITS(內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū))序列,rbcL序列(1,5-二磷酸核酮糖羧化酶的大亞基基因),matK序列(葉綠體賴氨酸基因(trnK)的內(nèi)含子)進行序列測定以及對比分析,探討不同來源的同種植物在序列遺傳上的差異,同時對比不同植物(尤其是中藥雞骨草和其偽品)的堿基排列順序的差異,為建立中藥雞骨草的DNA條形碼奠定基礎,并為分子水平鑒定物種(中草藥)提供參考依據(jù)。
   方法:(1)利用改良的CT

2、AB法提取靶植物樣品的總DNA。(2)采用被子植物通用的ITS序列引物以及豆科植物通用的rbcL引物和matK引物對靶樣品的三段序列進行PCR擴增,然后對擴增結果進行測序分析。(3)利用CodonCode Aligner和MEGA5.1軟件對獲得的序列進行聚類分析,計算出種間和種內(nèi)遺傳距離,建立系統(tǒng)發(fā)育鄰接樹。(4)將獲得的所有序列申請?zhí)峤坏紾eneBank中,獲得GeneBank登錄號。
   結果:(1)以改良的CTAB法所

3、提取植物樣品的總DNA經(jīng)過紫外可見分光光度計的檢測,OD260/280比值位于1.676到1.884之間,符合PCR擴增的要求,可以作為PCR擴增時的模板。(2)將擴增的三段序列分別進行測序,測序結果顯示,ITS序列的長度為692bp~702bp;rbcL序列的長度為745bp~746bp;matK序列的長度為887bp~895bp。(3)將所得到的序列進行對比分析,不同地區(qū)同種植物之間存在個別的堿基變異,但遺傳距離很小;不同種植物之間

4、的堿基序列存在有變異(缺失,插入的現(xiàn)象頻繁),遺傳距離較大。利用遺傳距離的遠近可以準確的區(qū)分開不同物種。(4)最后將所有的序列登錄NCBI數(shù)據(jù)庫中,獲得GeneBank登錄號;為藥用植物數(shù)據(jù)庫增添新的內(nèi)容。
   結論:ITS,rbcL和matK序列均可以正確的區(qū)分開不同的豆科植物,但無法準確的區(qū)分開不同地區(qū)的同種植物。為分子水平上的物種鑒定提供了依據(jù)。初步建立了中藥雞骨草的DNA條形碼,為植物通用DNA條形碼片段的研究提供了參

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