內(nèi)源性ALV的全基因測序、J-ALV實時熒光定量PCR檢測方法的建立及應用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究根據(jù)NCBI上ev-1設計了相應的引物,從商品蛋雞中擴增出一株內(nèi)源性E亞群,經(jīng)測序發(fā)現(xiàn)從正常商品蛋雞中擴增出的ALV-E亞群序列與ev-1(E)同源性達99.1%,與SD0501(E)同源性98.9%,而與HPRS103和NX0101同源性為85.4%。與ev-3只有54.8%的同源性。
   本研究為研究禽白血病J亞群病毒在雞體內(nèi)各個器官的病毒分布,建立了熒光定量PCR檢測方法。根據(jù)禽白血病病毒J亞群NX0101毒株基因

2、5257-5510bp的堿基序列,設計了1對特異性引物,進行RT-PCR反應,擴增產(chǎn)物為253bp,同時按照參考文獻,合成1對β-actinPCR引物作為內(nèi)參,進行RT-PCR反應,擴增產(chǎn)物為139bp。將ALV-Jenv基因和β-actin擴增產(chǎn)物與PMD-18-T載體重組,構(gòu)建的重組質(zhì)粒分別命名為PMD-18-J和PMD-18-β,測序成功后作為Real-timePCR反應的標準模板。利用上述引物和SYBRGreenⅠ染料進行Rea

3、l-timePCR反應,建立了標準曲線,并進行反應靈敏性、特異性和重復性試驗。試驗結(jié)果表明:標準曲線線性關(guān)系R值均為0.9914,檢測極限約為100拷貝質(zhì)粒DNA;特異性分析表明只有禽白血病病毒能檢測到特異性的熔解度峰值;批內(nèi)和批間重復性試驗的變異系數(shù)均小于5%。本研究所建立的ALV-J基因?qū)崟r熒光定量RT-PCR方法靈敏度高、特異性強、檢測周期短,為研究禽白血病J亞群病毒在畜禽體內(nèi)各個器官的病毒分布奠定了基礎。
   然后用已

4、建立的實時熒光定量RT-PCR方法對人工感染ALV-J后8周齡的SPF雞心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟、胸腺、法氏囊、腺胃分別提取RNA反轉(zhuǎn)錄成CDNA后進行熒光定量PCR的檢測。根據(jù)標準曲線公式計算出J基因和β-actin的拷貝數(shù),然后根據(jù)公式:ALV-J相對表達量=ALV-J拷貝數(shù)/β-actin拷貝數(shù)計算ALV-J的相對含量。通過比較數(shù)值得出可以得出法氏囊中ALV-J基因的相對含量最高,脾臟和胸腺次之,肝臟和腺胃第三,兩者之間也無差

5、異,心臟含量最低。針對實驗室送診ALV病例,采用上述方法對各個器官進行熒光定量PCR檢測,具有血管瘤癥狀自然感染雞只的胸腺中ALV-J的相對含量最高,其他器官依次是法氏囊>腎臟>腺胃>脾臟>肝臟>肺臟,心臟含量最低。此雞只的器官與實驗組人工感染的SPF雞比較,腎臟和胸腺的含量高于SPF雞,其余器官都低于SPF雞。另外肝臟有肉眼可見腫瘤結(jié)節(jié)的自然感染雞中肝臟的ALV-J基因的相對含量最高;胸腺、法氏囊、脾臟次之,但是三者之間無差異性;腎臟

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